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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G168750
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 44117198-44121833 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2687 bp · TkA08G168750|TK1151|cDNA

CAACGATGACCATTTATATTTACTGCAAATTTGTTTCTCTTGACATTTAATTAAGCAAAGCCGCTACAGGATCCAGCGGGTTTGCATGCCACATTGTTGTACCACGACGGTTGCGCCGCTCAGCATTACTTACAACCACCGTCCCCCGGCAGTCTATCTATCCGTTTTCCATCTAGAATCAAATGAAAATGGACGAGCAAGATGGAACCGATTGAACGATGCATCTAAACGTAAATAAAAATGTATACTGAAAATAACCC...

CDS

下载 CDS FASTA

1989 bp · TkA08G168750|TK1151|CDS

ATGGACACCCCTAAAACTCCCTTCAGTGGGATCAAAAAAGATATCCATGGAAGATTACAGTGTTACAAACAAGATTGGGTCAGAGCTCTAGATTCAGGCGCAAGAATATTAGCTCCAACAGCATACATTTTCTTTGCCTCCACCCTTCCAGTCATTGCATTCGGTGAACAACTAAATAAAGAAACAGATGACACCTTAAGTGCTGTAGAAACTCTCACATCAACTGCTATTTGTGGAATCATCCATGCAATATTCGGTGG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

662 aa · TkA08G168750|TK1151|PROTEIN

MDTPKTPFSGIKKDIHGRLQCYKQDWVRALDSGARILAPTAYIFFASTLPVIAFGEQLNKETDDTLSAVETLTSTAICGIIHAIFGGQPLLILGVAEPTVIMYNYLYAFAKKRPELGKHLFLAWAGWVCVWTAVMLCVLAILNACTLITRFTRVAGELFGMLISVLFMQEAIKGVLSEFYVPKGENETLEEYQFHWLYTNGLLAIILAFGTLMTSMKSRGARSWPYGVGWIRGFIADYGVPLMVLVWTGISYAKPREVPT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G168750
TK1151 IDTkA08G168750
OH-1004 IDLXL04_008547
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)61.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.130 / OH-1004 94.064
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G168750
位置Chr08:44117198-44121833 (+)
描述Similar to BOR4: Boron transporter 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g32510 推定的硼转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At5g25430 可能的硼转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At1g15460 外排型硼转运蛋白极性定位于根部。
Plants tolerant of high boron levels.2007 · DOI: 10.1126/science.1146634
At1g74810 推定的硼转运蛋白。 暂无已核实直接文献
At2g47160 用于木质部负载的外排型硼 转运蛋白，响应硼限制下从根到芽的硼易位。
Arabidopsis boron transporter for xylem loading.2002 · DOI: 10.1038/nature01139
Improvement of seed yields under boron-limiting conditions through overexpression of BOR1, a boron transporter for xylem loading, in Arabidopsis thaliana.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02763.x
DRP1-Dependent Endocytosis is Essential for Polar Localization and Boron-Induced Degradation of the Borate Transporter BOR1 in Arabidopsis thaliana.2016 · DOI: 10.1093/pcp/pcw121
bor1-1, an Arabidopsis thaliana mutant that requires a high level of boron.1997 · DOI: 10.1104/pp.115.3.901

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_008547 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006820 monoatomic anion transport 生物过程
GO:0046713 borate transport 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0050801 monoatomic ion homeostasis 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0080029 cellular response to boron-containing substance levels 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0005452 solute:inorganic anion antiporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G15460
ath:AT1G74810
ath:AT3G62270
ath:AT4G32510
ath:AT5G25430
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.717
排名 1 · TkA08G168750 · TK1151
细胞质0.135
排名 2 · TkA08G168750 · TK1151
内质网0.119
排名 3 · TkA08G168750 · TK1151
溶酶体／液泡0.077
排名 4 · TkA08G168750 · TK1151
高尔基体0.063
排名 5 · TkA08G168750 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00955HCO3_cotransp7-181 aa
PF00955HCO3_cotransp195-375 aa
PF00955HCO3_cotransp448-590 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G168750PF00955HCO3_cotransp71815.6e-99333.0
TkA08G168750PF00955HCO3_cotransp1953755.6e-99333.0
TkA08G168750PF00955HCO3_cotransp4485905.6e-99333.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SUU1拟南芥sp|Q9SUU1|BOR7_ARATH Probable boron transporter 763.900%Swiss-Prot高置信
Q3E954拟南芥sp|Q3E954|BOR6_ARATH Probable boron transporter 664.400%Swiss-Prot高置信
Q9XI23拟南芥sp|Q9XI23|BOR4_ARATH Boron transporter 463.800%Swiss-Prot高置信
Q9SSG5拟南芥sp|Q9SSG5|BOR5_ARATH Putative boron transporter 562.000%Swiss-Prot高置信
Q8VYR7拟南芥sp|Q8VYR7|BOR1_ARATH Boron transporter 157.500%Swiss-Prot高置信

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