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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G160580
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 41908602-41912033 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1645 bp · TkA08G160580|TK1151|cDNA

TTTTTATTAGTTTTGTGATCACCTCGTAAAACGAACTGATAAACCTTCAAATTTCCAAACTAGTCAAAGTTATCAAAGTGAACAAGAGAGCGATATAAAAGAAGGGGGAAGGGTTCCGTGTATTACTAGTCGACTCCACCCTCATTGTTTTGTTGCGTCCCCGTTCTTCATATTCGAGAACAATGGTATTTGCAGGGAGGCAGAAGAACAACAAGAATGCGGGAGAAGAATGGTATTTGGGGAAATACGAGATTGGAAGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1323 bp · TkA08G160580|TK1151|CDS

ATGGTATTTGCAGGGAGGCAGAAGAACAACAAGAATGCGGGAGAAGAATGGTATTTGGGGAAATACGAGATTGGAAGAACTCTTGGCGAAGGCAATTTCGGCAAGGTTAAATATGCTAAAGACATTCAAACTCAACACTCTTTTGCTATCAAGATCATTGATAAAACCCGCGTCATAAAGCTCAAAATATCCGATCAGATAAAGAGGGAGATCAGCGCATTGAAGCTTCTTAAACATCCTAACGTGGTTAGATTACACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

440 aa · TkA08G160580|TK1151|PROTEIN

MVFAGRQKNNKNAGEEWYLGKYEIGRTLGEGNFGKVKYAKDIQTQHSFAIKIIDKTRVIKLKISDQIKREISALKLLKHPNVVRLHEVLASKTKIYMVLEYVNGGELFDTISTNGKQQESNARKLFQQLIDGVSYCHDRGVFHRDLKLENVLLDANGNIKISDFGLSALPEHIREDGLLHTTCGSPNYVAPEVLSNRGYDGRASDTWSCGVILYVMLTGYLPFDDRNLAVIYQKIAKGDARLPKWMSLGAKNLVKRILDP...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G160580
TK1151 IDTkA08G160580
OH-1004 IDLXL04_032238
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G160580
位置Chr08:41908602-41912033 (-)
描述Similar to CIPK1: CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g17510 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
At1g48260 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0292200 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os07g0637000 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
Os05g0136200 CIPK 丝氨酸-苏氨酸蛋白激酶与 CBL 蛋白相互作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_032238 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G48260
ath:AT3G17510
dosa:Os01g0292200
dosa:Os05g0136200
dosa:Os07g0637000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.507
排名 1 · TkA08G160580 · TK1151
细胞核0.366
排名 2 · TkA08G160580 · TK1151
细胞膜0.223
排名 3 · TkA08G160580 · TK1151
高尔基体0.056
排名 4 · TkA08G160580 · TK1151
溶酶体／液泡0.056
排名 5 · TkA08G160580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase22-277 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr23-272 aa
PF14531Kinase-like27-78 aa
PF12330Haspin_kinase53-170 aa
PF01636APH66-131 aa
PF03109ABC172-169 aa
PF06293Kdo97-160 aa
PF14531Kinase-like108-231 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G160580PF00069Pkinase222772.1e-74250.9
TkA08G160580PF07714PK_Tyr_Ser-Thr232725.3e-41141.3
TkA08G160580PF14531Kinase-like27786.5e-0626.3
TkA08G160580PF12330Haspin_kinase531701.3e-0525.2
TkA08G160580PF01636APH661310.06113.8
TkA08G160580PF03109ABC1721692e-0627.9
TkA08G160580PF06293Kdo971600.2411.5
TkA08G160580PF14531Kinase-like1082316.5e-0626.3
TkA08G160580PF01636APH1381580.06113.8
TkA08G160580PF12330Haspin_kinase2072291.3e-0525.2
TkA08G160580PF03822NAF3063641.4e-1557.8
TkA08G160580PF02149KA13964220.1412.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8RWC9拟南芥sp|Q8RWC9|CIPK1_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 163.900%Swiss-Prot高置信
Q94C40拟南芥sp|Q94C40|CIPKH_ARATH CBL-interacting serine/threonine-protein kinase 1764.100%Swiss-Prot高置信
Q9LGV5水稻sp|Q9LGV5|CIPK1_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 162.600%Swiss-Prot高置信
Q0D4B2水稻sp|Q0D4B2|CIPKL_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 2162.900%Swiss-Prot高置信
Q75L42水稻sp|Q75L42|CIPKH_ORYSJ CBL-interacting protein kinase 1759.500%Swiss-Prot高置信

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