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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G147450
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 38439525-38448747 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1668 bp · TkA08G147450|TK1151|cDNA

ATGTCAAAATCTGATTCTCATAATATCGCGTTCAACCTTGCTAGTTCCATTGGATCTAACAACCGAGCTCCGACATTGTTTCCAGAAGAATATGATGCTTGGGTGATCCACATGGAGGATTACATCACCGGAATAAAAAAGGTAGGAATGGATATGAAAGAGCTGAAGGAACTGACTGAACGTCATGAAATAACCAGCGATGTCAAGGAGAAGATTGAAGCAGATCTTCGTGCGAAAAAGGAATTGAGGTTTGGTCTTAC...

CDS

下载 CDS FASTA

1668 bp · TkA08G147450|TK1151|CDS

ATGTCAAAATCTGATTCTCATAATATCGCGTTCAACCTTGCTAGTTCCATTGGATCTAACAACCGAGCTCCGACATTGTTTCCAGAAGAATATGATGCTTGGGTGATCCACATGGAGGATTACATCACCGGAATAAAAAAGGTAGGAATGGATATGAAAGAGCTGAAGGAACTGACTGAACGTCATGAAATAACCAGCGATGTCAAGGAGAAGATTGAAGCAGATCTTCGTGCGAAAAAGGAATTGAGGTTTGGTCTTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

555 aa · TkA08G147450|TK1151|PROTEIN

MSKSDSHNIAFNLASSIGSNNRAPTLFPEEYDAWVIHMEDYITGIKKVGMDMKELKELTERHEITSDVKEKIEADLRAKKELRFGLTPSSLRLIEPCKRAHDIWIKLKESYGSNDLLDSIQSSLLAEYGAFKQSSDESIYKISERFHQLLSRMEKYDLARKEVEKKTTFLQSLRSEFFNIGQTIRGHEQFKNYKMPEVLGILKAHEAELVKASKTNITLALVSKSEKQESDSDAEWSNEDKALMDCVLRRKQEKEEVVKD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G147450
TK1151 IDTkA08G147450
OH-1004 IDLXL04_028986
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)73.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.739 / OH-1004 29.320
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G147450
位置Chr08:38439525-38448747 (+)
描述Similar to GIP: Copia protein
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_028986 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0006310 DNA recombination 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0015074 DNA integration 生物过程
GO:0071897 DNA biosynthetic process 生物过程
GO:0042575 DNA polymerase complex 细胞组分
GO:0003676 nucleic acid binding 分子功能
GO:0003964 RNA-directed DNA polymerase activity 分子功能
GO:0004190 aspartic-type endopeptidase activity 分子功能
GO:0004519 endonuclease activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008270 zinc ion binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用暂无功能描述
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.529
排名 1 · TkA08G147450 · TK1151
细胞核0.444
排名 2 · TkA08G147450 · TK1151
细胞膜0.048
排名 3 · TkA08G147450 · TK1151
线粒体0.047
排名 4 · TkA08G147450 · TK1151
内质网0.034
排名 5 · TkA08G147450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02970TBCA48-72 aa
PF24224DUF744050-82 aa
PF14223Retrotran_gag_263-211 aa
PF19220Rod_CreS142-166 aa
PF08614ATG16154-176 aa
PF02970TBCA156-176 aa
PF08614ATG16203-271 aa
PF19220Rod_CreS233-251 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G147450PF02970TBCA48720.1912.8
TkA08G147450PF24224DUF744050820.09413.5
TkA08G147450PF14223Retrotran_gag_2632114.4e-1350.0
TkA08G147450PF19220Rod_CreS1421660.04313.7
TkA08G147450PF08614ATG161541760.03615.0
TkA08G147450PF02970TBCA1561760.1912.8
TkA08G147450PF08614ATG162032710.03615.0
TkA08G147450PF19220Rod_CreS2332510.04313.7
TkA08G147450PF02970TBCA2572680.1912.8
TkA08G147450PF19220Rod_CreS3434420.04313.7
TkA08G147450PF02970TBCA3443630.1912.8
TkA08G147450PF08614ATG163454210.03615.0
TkA08G147450PF10979DUF27863463670.01915.6
TkA08G147450PF02970TBCA3964640.1912.8
TkA08G147450PF08614ATG164424440.03615.0
TkA08G147450PF02970TBCA5205390.1912.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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