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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G134300
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 34925681-34928802 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2448 bp · TkA08G134300|TK1151|cDNA

TGATAATCAACTTATAAAAAATGAAAGAAAAATCATATTGTTATATATTTGACAAAATTAAGTAACTTCCTTAAATAAACAAGTTGTTATAATCTTATACGGTGAAGTAGAATATTATTTCCGTCGAGTTCCTCCGCCGCTTCTGGTTCTCTCTAACGACTCCCTCCGCCTTCTTCACGTCTTCAACCTCTTTACATCTATACAACCATTCACGCATACATTTTCCCATTGATCTCTATCTCAAAAACCTTTGGTTCATT...

CDS

下载 CDS FASTA

1800 bp · TkA08G134300|TK1151|CDS

ATGGCATTGGAATCGTCTTCAGAGTACGAAGCGGACGATTCCGATGCTGACTTCGTTGAGATCGATCCCTCCGGTCGTTATGGACGGTACAAGGAAGTGTTAGGAAAGGGGGCTTGCAAAAAGGTATACAGAGCATTTGACGAATTGGAAGGAATTGAAGTAGCTTGGAATCAAATAAGGATTTCCGATTTCTTACGGAACCCTGAGGAATTAGAACGTCTATACTCTGAAGTTCATTTGCTCAAAACACTTAGACACAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

599 aa · TkA08G134300|TK1151|PROTEIN

MALESSSEYEADDSDADFVEIDPSGRYGRYKEVLGKGACKKVYRAFDELEGIEVAWNQIRISDFLRNPEELERLYSEVHLLKTLRHKNIIKFYNSWVDTKNDHVNFITEIFTSGTLRQYRKKHKHVDLRALKKWSKQILEGLVYLHSHDPPVIHRDLKCDNIFVNGNQGEVKIGDLGLAAILRQARSAHSVIGTPEFMAPELYEEDYNELVDIYAFGMCLLELVTFEYPYVECTNAAQIYKKVTSGVRPASLATVKDPEI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G134300
TK1151 IDTkA08G134300
OH-1004 IDLXL04_031887
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G134300
位置Chr08:34925681-34928802 (-)
描述Similar to WNK3: Probable serine/threonine-protein kinase WNK3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g48260 可能通过调节光周期通路来调控开花时间。 暂无已核实直接文献
At3g04910 通过调节光周期途径来调节开花时间。
The APRR3 component of the clock-associated APRR1/TOC1 quintet is phosphorylated by a novel protein kinase belonging to the WNK family, the gene for which is also transcribed rhythmically in Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1093/pcp/pcf084
Compilation and characterization of a novel WNK family of protein kinases in Arabiodpsis thaliana with reference to circadian rhythms.2002 · DOI: 10.1271/bbb.66.2429
The plant WNK gene family and regulation of flowering time in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2008.00072.x
At3g22420 通过调节光周期途径来调节开花时间。
The plant WNK gene family and regulation of flowering time in Arabidopsis.2008 · DOI: 10.1111/j.1438-8677.2008.00072.x

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os05g0108300 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 WNK2。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2YMV6 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 WNK1。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031887 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0048573 photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G22420
ath:AT3G48260
dosa:Os05g0108300
dosa:Os07g0572800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.514
排名 1 · TkA08G134300 · TK1151
细胞核0.396
排名 2 · TkA08G134300 · TK1151
细胞膜0.197
排名 3 · TkA08G134300 · TK1151
高尔基体0.061
排名 4 · TkA08G134300 · TK1151
内质网0.059
排名 5 · TkA08G134300 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase31-285 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr31-280 aa
PF25571TPR_CCP1_N70-127 aa
PF01636APH117-171 aa
PF27815C24B10_03287-300 aa
PF12202OSR1_C340-394 aa
PF24889CCTL2_WNK352-391 aa
PF22966INTS7_C_plants478-541 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G134300PF00069Pkinase312851.7e-50172.6
TkA08G134300PF07714PK_Tyr_Ser-Thr312807.7e-34117.9
TkA08G134300PF25571TPR_CCP1_N701273.07.5
TkA08G134300PF01636APH1171710.3111.5
TkA08G134300PF27815C24B10_032873002.09.9
TkA08G134300PF12202OSR1_C3403942e-0628.5
TkA08G134300PF24889CCTL2_WNK3523910.001219.4
TkA08G134300PF22966INTS7_C_plants4785410.07813.3
TkA08G134300PF27815C24B10_034815592.09.9
TkA08G134300PF25571TPR_CCP1_N4835493.07.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9STK6拟南芥sp|Q9STK6|WNK3_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase WNK358.300%Swiss-Prot高置信
Q9CAV6拟南芥sp|Q9CAV6|WNK1_ARATH Serine/threonine-protein kinase WNK155.300%Swiss-Prot中等置信
Q8S8Y9拟南芥sp|Q8S8Y9|WNK2_ARATH Serine/threonine-protein kinase WNK258.200%Swiss-Prot中等置信
Q65X23水稻sp|Q65X23|WNK2_ORYSJ Probable serine/threonine-protein kinase WNK251.800%Swiss-Prot高置信
A2YMV6水稻sp|A2YMV6|WNK1_ORYSI Probable serine/threonine-protein kinase WNK155.600%Swiss-Prot中等置信

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