TkA08G129110 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G129110

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 33506086-33510157 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

684 bp · TkA08G129110|TK1151|cDNA

ATGGAAGGATGGCTTACGGTGTACAACACCAGCGACCCAGATTCCGAATTCGTGAAATTAAGTGCGAGAACACAGCTCTTGACACAAATTAAAGAGTTATTAGACAAATTCAAGGATGAAAAAGTAAGCATAACATTAACGGGACATAGCCTTGGTGCAAGTTTAGCAGTTTTATCTGCGTTTGACCTAGCTACGAATGTAGCAACACGAGATATTCACTTATCGGCGTTTATTCTTGAATGTCCGCAAGTGGGTAATCA...

CDS

下载 CDS FASTA

684 bp · TkA08G129110|TK1151|CDS

ATGGAAGGATGGCTTACGGTGTACAACACCAGCGACCCAGATTCCGAATTCGTGAAATTAAGTGCGAGAACACAGCTCTTGACACAAATTAAAGAGTTATTAGACAAATTCAAGGATGAAAAAGTAAGCATAACATTAACGGGACATAGCCTTGGTGCAAGTTTAGCAGTTTTATCTGCGTTTGACCTAGCTACGAATGTAGCAACACGAGATATTCACTTATCGGCGTTTATTCTTGAATGTCCGCAAGTGGGTAATCA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

227 aa · TkA08G129110|TK1151|PROTEIN

MEGWLTVYNTSDPDSEFVKLSARTQLLTQIKELLDKFKDEKVSITLTGHSLGASLAVLSAFDLATNVATRDIHLSAFILECPQVGNQAFKEKMQELTNLKVLRVKNDPDVIPFWPSKLTGFVDVGIEILIDSRKSPYLKDESGLSFFHNLEAVLHTLGGWNGENGGFDWSLEKRDLGLVNMRGDILKEEMKIPGSWWGEKNKGMVVNDDGHWVLSPIDPDDQDLPVY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G129110`
TK1151 ID	TkA08G129110
OH-1004 ID	LXL04_031767
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	80.200
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 99.119 / OH-1004 27.928 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G129110

位置 Chr08:33506086-33510157 (+)

描述 Similar to At2g42690: Phospholipase A1-IIdelta

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At2g42690`	酰基水解酶，催化磷脂酰胆碱（PC）在sn-1位点的水解。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8A8C9`	酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。	暂无已核实直接文献
`Os01g0710700`	酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。	暂无已核实直接文献
`UniProt: A2WT95`	酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。	暂无已核实直接文献
`Os01g0651100`	酰基水解酶，催化sn-1位点磷脂的水解。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031767 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009650 UV protection 生物过程

GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程

GO:0071493 cellular response to UV-B 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0008970 glycerophospholipid phospholipase A1 activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT2G42690

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.558

排名 1 · TkA08G129110 · TK1151

细胞核0.131

排名 2 · TkA08G129110 · TK1151

溶酶体／液泡0.123

排名 3 · TkA08G129110 · TK1151

细胞外0.106

排名 4 · TkA08G129110 · TK1151

内质网0.096

排名 5 · TkA08G129110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01764Lipase_32-116 aa

PF02089Palm_thioest15-55 aa

PF11187Mbeg1-like20-90 aa

PF00975Thioesterase23-64 aa

PF05990DUF90024-98 aa

PF12146Hydrolase_424-92 aa

PF12697Abhydrolase_628-88 aa

PF04025RemA-like29-47 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G129110	`PF01764`	Lipase_3	2	116	2.1e-22	80.2
TkA08G129110	`PF02089`	Palm_thioest	15	55	0.077	13.4
TkA08G129110	`PF11187`	Mbeg1-like	20	90	0.014	15.4
TkA08G129110	`PF00975`	Thioesterase	23	64	0.011	16.6
TkA08G129110	`PF05990`	DUF900	24	98	0.017	15.3
TkA08G129110	`PF12146`	Hydrolase_4	24	92	0.14	12.2
TkA08G129110	`PF12697`	Abhydrolase_6	28	88	0.032	15.6
TkA08G129110	`PF04025`	RemA-like	29	47	0.31	11.8
TkA08G129110	`PF26363`	Phospholipase-like	34	61	0.23	11.4
TkA08G129110	`PF02089`	Palm_thioest	85	145	0.077	13.4
TkA08G129110	`PF04025`	RemA-like	198	220	0.31	11.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SJI7`	拟南芥	sp\|Q9SJI7\|PLA20_ARATH Phospholipase A1-IIdelta	50.500%	Swiss-Prot	高置信
`B8A8C9`	水稻	sp\|B8A8C9\|PLA5_ORYSI Phospholipase A1-II 5	42.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q5NAI4`	水稻	sp\|Q5NAI4\|PLA5_ORYSJ Phospholipase A1-II 5	42.400%	Swiss-Prot	中等置信
`A2WT95`	水稻	sp\|A2WT95\|PLA1_ORYSI Phospholipase A1-II 1	44.700%	Swiss-Prot	中等置信
`A2ZW16`	水稻	sp\|A2ZW16\|PLA1_ORYSJ Phospholipase A1-II 1	44.700%	Swiss-Prot	中等置信

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