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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G127910
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 33250940-33251686 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

684 bp · TkA08G127910|TK1151|cDNA

ATGGCGGTTGAAGCTTTGAATTCTCCGAGAACGGAAACCGCTCCTTTGTTTAAACAAGATTCCGGCAATCATCTGAGGTATTTGGACTCGTGGACAAAGGGCAAAAGATCGAAAAGGCCACGGGTGGATCAGCCACCTACCGAGGAGGAGTACCTTGCTTTCTGCCTTATGTTACTTGCCCGCGGTGGCCATGCGCCACAGCCGCGTGCTAAATCTCCGGCGCTTAGTATTGTGCTACCGCAGCCGGAATCGTTTGCTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

684 bp · TkA08G127910|TK1151|CDS

ATGGCGGTTGAAGCTTTGAATTCTCCGAGAACGGAAACCGCTCCTTTGTTTAAACAAGATTCCGGCAATCATCTGAGGTATTTGGACTCGTGGACAAAGGGCAAAAGATCGAAAAGGCCACGGGTGGATCAGCCACCTACCGAGGAGGAGTACCTTGCTTTCTGCCTTATGTTACTTGCCCGCGGTGGCCATGCGCCACAGCCGCGTGCTAAATCTCCGGCGCTTAGTATTGTGCTACCGCAGCCGGAATCGTTTGCTTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

227 aa · TkA08G127910|TK1151|PROTEIN

MAVEALNSPRTETAPLFKQDSGNHLRYLDSWTKGKRSKRPRVDQPPTEEEYLAFCLMLLARGGHAPQPRAKSPALSIVLPQPESFAYKCSVCDKVFGSYQALGGHKASHRKNNPAAAGAEIEHGTHGGGSGRSHECSICHRSFATGQALGGHKRRHYEGVIGGGRANSGITSSEGVGSTNSQRGFDLNIPAMPEHLPGFADEEVESPHPTKKSRLFPPVKLQMAADQ

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G127910
TK1151 IDTkA08G127910
OH-1004 IDLXL04_031755
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)82.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G127910
位置Chr08:33250940-33251686 (-)
描述Similar to ZAT10: Zinc finger protein ZAT10
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g27730 参与非生物应激反应的转录阻遏蛋白。
LOS2, a genetic locus required for cold-responsive gene transcription encodes a bi-functional enolase.2002 · DOI: 10.1093/emboj/21.11.2692
Gain- and loss-of-function mutations in Zat10 enhance the tolerance of plants to abiotic stress.2006 · DOI: 10.1016/j.febslet.2006.11.002
Mapping methyl jasmonate-mediated transcriptional reprogramming of metabolism and cell cycle progression in cultured Arabidopsis cells.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0711203105
Fine-tuning of early events in the jasmonate response.2008 · DOI: 10.4161/psb.3.10.5993
At5g04340 可能的转录因子，调节根部发育以及磷酸盐 获取和稳态。
Phosphate homeostasis and root development in Arabidopsis are synchronized by the zinc finger transcription factor ZAT6.2007 · DOI: 10.1104/pp.107.101691
At5g43170 转录阻遏蛋白可能参与非生物胁迫反应。
Arabidopsis Cys2/His2-type zinc-finger proteins function as transcription repressors under drought, cold, and high-salinity stress conditions.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.046599
At3g19580 转录阻遏蛋白参与非生物胁迫条件下植物生长的抑制。
Functional identification of an Arabidopsis snf4 ortholog by screening for heterologous multicopy suppressors of snf4 deficiency in yeast.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00809.x
Arabidopsis Cys2/His2-type zinc-finger proteins function as transcription repressors under drought, cold, and high-salinity stress conditions.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.046599
Mapping methyl jasmonate-mediated transcriptional reprogramming of metabolism and cell cycle progression in cultured Arabidopsis cells.2008 · DOI: 10.1073/pnas.0711203105
Arabidopsis zinc-finger protein 2 is a negative regulator of ABA signaling during seed germination.2010 · DOI: 10.1016/j.jplph.2010.05.010
Arabidopsis Cys2/His2 zinc-finger proteins AZF1 and AZF2 negatively regulate abscisic acid-repressive and auxin-inducible genes under abiotic stress conditions.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182683
Gene network analysis and functional studies of senescence-associated genes reveal novel regulators of Arabidopsis leaf senescence.2012 · DOI: 10.1111/j.1744-7909.2012.01136.x
At5g67450 转录阻遏蛋白参与非生物胁迫条件下植物生长的抑制。
Arabidopsis Cys2/His2-type zinc-finger proteins function as transcription repressors under drought, cold, and high-salinity stress conditions.2004 · DOI: 10.1104/pp.104.046599
Arabidopsis Cys2/His2 zinc-finger proteins AZF1 and AZF2 negatively regulate abscisic acid-repressive and auxin-inducible genes under abiotic stress conditions.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.182683

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031755 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006979 response to oxidative stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009644 response to high light intensity 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010117 photoprotection 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G27730
ath:AT3G19580
ath:AT5G04340
ath:AT5G43170
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.983
排名 1 · TkA08G127910 · TK1151
细胞质0.065
排名 2 · TkA08G127910 · TK1151
细胞膜0.022
排名 3 · TkA08G127910 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA08G127910 · TK1151
质体0.009
排名 5 · TkA08G127910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13912zf-C2H2_627-39 aa
PF23103Zf-C2H2_ZNF451_5th85-105 aa
PF13465zf-H2C2_285-97 aa
PF13912zf-C2H2_686-111 aa
PF13894zf-C2H2_487-109 aa
PF00096zf-C2H287-109 aa
PF12171zf-C2H2_jaz87-108 aa
PF12874zf-met87-109 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G127910PF13912zf-C2H2_627391.2e-2486.4
TkA08G127910PF23103Zf-C2H2_ZNF451_5th851050.3511.4
TkA08G127910PF13465zf-H2C2_285971.89.8
TkA08G127910PF13912zf-C2H2_6861111.2e-2486.4
TkA08G127910PF13894zf-C2H2_4871091.4e-0938.6
TkA08G127910PF00096zf-C2H2871099.4e-0626.5
TkA08G127910PF12171zf-C2H2_jaz871080.000620.6
TkA08G127910PF12874zf-met871090.004917.9
TkA08G127910PF13913zf-C2HC_288940.2212.0
TkA08G127910PF24071Phage_zn_bind_3891150.01915.6
TkA08G127910PF17123zf-RING_11891010.03114.7
TkA08G127910PF25299ZZ_ADA2891100.06214.2
TkA08G127910PF10367zf-Vps39_C89980.1512.4
TkA08G127910PF13465zf-H2C2_21051141.89.8
TkA08G127910PF24071Phage_zn_bind_31291550.01915.6
TkA08G127910PF13465zf-H2C2_21321451.89.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q96289拟南芥sp|Q96289|ZAT10_ARATH Zinc finger protein ZAT1044.000%Swiss-Prot中等置信
O22533拟南芥sp|O22533|ZAT6_ARATH Zinc finger protein ZAT644.900%Swiss-Prot中等置信
Q9SSW0拟南芥sp|Q9SSW0|AZF3_ARATH Zinc finger protein AZF350.400%Swiss-Prot高置信
Q9SSW2拟南芥sp|Q9SSW2|AZF2_ARATH Zinc finger protein AZF233.200%Swiss-Prot中等置信
Q9SSW1拟南芥sp|Q9SSW1|AZF1_ARATH Zinc finger protein AZF144.700%Swiss-Prot低置信

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