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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G125110
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 32495241-32500607 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3396 bp · TkA08G125110|TK1151|cDNA

CTAAACTGCCCTTCTCTGTGTGTTAGATGATTTGGTCCATTCCATGTTAAGAGGTTACTGAATCACTTTCAGGGCTCCATAAAATTACTTCATTTCTGTAAAGATACAGAGAACTCATCTTCATTTTCTCTCTCTGTAACTATAACTGTTTCCTGGACCACCTTCCTTTTGCATTTTTCACATGATGGAAGCGCCTCCGGCGACGACCACGACGGCGGAGGATTGTTGTGTGAAGGTAGCAGTACATATTCGACCGCTTA...

CDS

下载 CDS FASTA

3087 bp · TkA08G125110|TK1151|CDS

ATGATGGAAGCGCCTCCGGCGACGACCACGACGGCGGAGGATTGTTGTGTGAAGGTAGCAGTACATATTCGACCGCTTATTGGAGATGAGAAGCTTCAAGCTTGTCAAGATTGTGTCGCTGTCGTACCCGGAAAACCCCAGGTGCAACTTGGTACACATTCCTTCACTTTCGATCATGTCTATGGAAGCTCCGGTTCCCCATCATCCGCCATGTTTGAAGACTGCGTTTCTCCCCTTGTTGACGGTCTATTTCAAGGATA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

1028 aa · TkA08G125110|TK1151|PROTEIN

MMEAPPATTTTAEDCCVKVAVHIRPLIGDEKLQACQDCVAVVPGKPQVQLGTHSFTFDHVYGSSGSPSSAMFEDCVSPLVDGLFQGYNATVLAYGQTGSGKTYTMGTGFKDGYQAGLIPQAMTALFNKIKTLQDKIEFQLHVSFIEILKEEVRDLLDSKSEITHGQNGKLNSPGKPPIQIRETSNGVITLAGSTECSIKTLKEMSDCLEHGSLSRATGSTNMNNQSSRSHAIFTITLEQMSKTDSNDSMCDEYLCAKLHL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G125110
TK1151 IDTkA08G125110
OH-1004 IDLXL04_031709
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G125110
位置Chr08:32495241-32500607 (+)
描述Similar to KIN4A: Kinesin-like protein KIN-4A
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g47820 驱动蛋白样运动蛋白参与纤维素微纤维定向沉积的控制。
A kinesin-like protein is essential for oriented deposition of cellulose microfibrils and cell wall strength.2002 · DOI: 10.1105/tpc.005801
Single molecule analysis of the Arabidopsis FRA1 kinesin shows that it is a functional motor protein with unusually high processivity.2011 · DOI: 10.1093/mp/ssr077
Kinesin-4 Functions in Vesicular Transport on Cortical Microtubules and Regulates Cell Wall Mechanics during Cell Elongation in Plants.2015 · DOI: 10.1016/j.molp.2015.01.004
At3g50240 类驱动马达蛋白，参与纤维素微纤维定向沉积的控制。 暂无已核实直接文献
At5g60930 类驱动马达蛋白，参与纤维素微纤维定向沉积的控制。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os09g0114500 微管依赖性运动蛋白参与纤维素微纤维定向沉积的控制。
Mutation of rice BC12/GDD1, which encodes a kinesin-like protein that binds to a GA biosynthesis gene promoter, leads to dwarfism with impaired cell elongation.2011 · DOI: 10.1105/tpc.110.081901
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031709 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程
GO:0009832 plant-type cell wall biogenesis 生物过程
GO:0009937 regulation of gibberellic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0010215 cellulose microfibril organization 生物过程
GO:0030705 cytoskeleton-dependent intracellular transport 生物过程
GO:0042127 regulation of cell population proliferation 生物过程
GO:0045893 positive regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0051231 spindle elongation 生物过程
GO:0071555 cell wall organization 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G50240
ath:AT5G47820
ath:AT5G60930
dosa:Os09g0114500
ghi:107917911
osa:4346402
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.666
排名 1 · TkA08G125110 · TK1151
细胞核0.269
排名 2 · TkA08G125110 · TK1151
细胞膜0.147
排名 3 · TkA08G125110 · TK1151
高尔基体0.073
排名 4 · TkA08G125110 · TK1151
线粒体0.049
排名 5 · TkA08G125110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00225Kinesin44-361 aa
PF16796Microtub_bd45-156 aa
PF25764KIF21A_4th403-424 aa
PF25764KIF21A_4th470-647 aa
PF03009GDPD552-664 aa
PF16796Microtub_bd572-638 aa
PF00225Kinesin654-699 aa
PF25764KIF21A_4th662-700 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G125110PF00225Kinesin443612.7e-105352.7
TkA08G125110PF16796Microtub_bd451567.1e-2175.4
TkA08G125110PF25764KIF21A_4th4034243.2e-53180.8
TkA08G125110PF25764KIF21A_4th4706473.2e-53180.8
TkA08G125110PF03009GDPD5526640.5611.0
TkA08G125110PF16796Microtub_bd5726387.1e-2175.4
TkA08G125110PF00225Kinesin6546992.7e-105352.7
TkA08G125110PF25764KIF21A_4th6627003.2e-53180.8
TkA08G125110PF00225Kinesin8339092.7e-105352.7
TkA08G125110PF25764KIF21A_4th8578823.2e-53180.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8GS71拟南芥sp|Q8GS71|KN4A_ARATH Kinesin-like protein KIN-4A69.900%Swiss-Prot高置信
Q94LW7拟南芥sp|Q94LW7|KN4B_ARATH Kinesin-like protein KIN-4B60.900%Swiss-Prot高置信
F4K0J3拟南芥sp|F4K0J3|KN4C_ARATH Kinesin-like protein KIN-4C50.000%Swiss-Prot高置信
Q6YUL8水稻sp|Q6YUL8|KN4A_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-4A65.600%Swiss-Prot高置信

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