TkA08G121110 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G121110

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 31514687-31522929 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1277 bp · TkA08G121110|TK1151|cDNA

AAAAAAAATGTTTTTGACGTAACCCAAGTTTTCATCCGCCTGTTGCTCAGTTCCTGTGTACTGGCCGCCTCCAACTCTCCAAAAGTTTACACATCCGCCGCCGCCTCTCAGCTTCTCCGACGGAAACCGCCTCTAAGCTTCTCCGGTTTCGTCTCCGGCGTCTCAGCTTCTCCGTTAACCCTAACCCTACCTTCTACGCAAGCGCCGCCGCCGCCGCCTCTCAGCTTCTCCGACGGAAGCTACCCCGCCGTCTTTCTACA...

CDS

下载 CDS FASTA

678 bp · TkA08G121110|TK1151|CDS

ATGGATACCGAACCAAATGGAGGTGGCTCTTTGGTTCTAATAAAGCAAGGCGCTGAAGCTAGAGTCTTTGAGTCAACATTTGGTGGAAGAAAGTCTATCATCAAGGAACGATTCTCAAAGAAATACAGACATCCAACTTTAGATTCAAAGCTCACACTCAAGCGCTTAAATGCGGAAGCAAGGTGTATGACAAAAGCTAGAAAGCTTGGAGTTTCAACTCCCGTTCTTTATGCAGTCGACCCTGTATCACATACACTGAC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

225 aa · TkA08G121110|TK1151|PROTEIN

MDTEPNGGGSLVLIKQGAEARVFESTFGGRKSIIKERFSKKYRHPTLDSKLTLKRLNAEARCMTKARKLGVSTPVLYAVDPVSHTLTFEYIEGPSIKDIFLEFGSQGIIEEKMDDIAFQIGTTIGKLHDGGVIHGDLTTSNMLWRSDTNQLVLIDFGLSFVSTLPEDKGVDLYVLERALLSMHSSCGNVMDKILAGYRKSTKQWSSTFNKLGQVRLRGRKRTMVG

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G121110`
TK1151 ID	TkA08G121110
OH-1004 ID	LXL04_031662
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA08G121110`
位置	Chr08:31514687-31522929 (+)
描述	Similar to TP53RK: EKC/KEOPS complex subunit TP53RK
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_031662` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0002949 tRNA threonylcarbamoyladenosine modification 生物过程 GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程 GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程 GO:0008033 tRNA processing 生物过程 GO:0043936 asexual sporulation resulting in formation of a cellular spore 生物过程 GO:0070525 tRNA threonylcarbamoyladenosine metabolic process 生物过程 GO:1990145 maintenance of translational fidelity 生物过程 GO:0000408 EKC/KEOPS complex 细胞组分 GO:0000781 chromosome, telomeric region 细胞组分 GO:0005634 nucleus 细胞组分 GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分 GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用	ani:ANIA_02513 ddi:DDB_G0279977 hsa:112858 spo:2541953 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.624

排名 1 · TkA08G121110 · TK1151

细胞核0.287

排名 2 · TkA08G121110 · TK1151

线粒体0.152

排名 3 · TkA08G121110 · TK1151

质体0.081

排名 4 · TkA08G121110 · TK1151

过氧化物酶体0.063

排名 5 · TkA08G121110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01636APH13-98 aa

PF22303OspG_kinase13-27 aa

PF01163RIO124-157 aa

PF06293Kdo37-179 aa

PF00069Pkinase40-160 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr52-159 aa

PF20613HipA_252-85 aa

PF03109ABC172-159 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G121110	`PF01636`	APH	13	98	1.1e-06	29.4
TkA08G121110	`PF22303`	OspG_kinase	13	27	0.00014	22.6
TkA08G121110	`PF01163`	RIO1	24	157	2.4e-07	31.3
TkA08G121110	`PF06293`	Kdo	37	179	1.3e-07	32.0
TkA08G121110	`PF00069`	Pkinase	40	160	9.5e-11	42.3
TkA08G121110	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	52	159	2e-06	28.1
TkA08G121110	`PF20613`	HipA_2	52	85	0.0035	17.4
TkA08G121110	`PF03109`	ABC1	72	159	9e-07	29.0
TkA08G121110	`PF07914`	DUF1679	115	157	0.076	12.6
TkA08G121110	`PF22303`	OspG_kinase	123	156	0.00014	22.6
TkA08G121110	`PF01636`	APH	129	161	1.1e-06	29.4
TkA08G121110	`PF19974`	TCAD9	131	156	0.3	10.9
TkA08G121110	`PF02958`	EcKL	133	164	0.0066	16.5
TkA08G121110	`PF01633`	Choline_kinase	133	159	0.015	15.4
TkA08G121110	`PF20613`	HipA_2	140	178	0.0035	17.4
TkA08G121110	`PF19974`	TCAD9	171	220	0.3	10.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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