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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G113680
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 29589163-29591291 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1885 bp · TkA08G113680|TK1151|cDNA

AAGGATCTGAATTCATAAGTTTTTATCAAACATAAAAACATTTTTGCAGTCTACTATTTTATCTTACATATCATTGTTAAACGAGCGACTAAATTGTTACAAGTTTAACGGCAACGAACTCTTTGATAAGCTCGTGAAATGGCGGTTTTCTGATGGCGACCAGATAACGAATCCTACTTTATTGTGCCCATGTTTTCTGGAAGATCCAATTTCATTTATTTCCTCTGTCTATAACTCCTCCCAGATACGTAAAATTCAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1125 bp · TkA08G113680|TK1151|CDS

ATGGCGACCCCAGTTGAACCTCCAAGCGGGATTAGAACAGAAGGGAAGCATTACTTTTCTATATGCCAAGCATTATTCGAATTAGATACAAAATACGTTCCTATAAAGCCAATTGGTCGAGGGGCATATGGTATTGTGTGTTCTTCATTTAACAGGCAAACCAATGAAAAAGTCGCAATCAAAAAGATCCACAATACGTTTGATAACCATACGGATGCCCTAAGAAGCTTACGTGAACTCAAACTTCTTCGACATCTTCG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

374 aa · TkA08G113680|TK1151|PROTEIN

MATPVEPPSGIRTEGKHYFSICQALFELDTKYVPIKPIGRGAYGIVCSSFNRQTNEKVAIKKIHNTFDNHTDALRSLRELKLLRHLRHENVIALKDVMVPMHKTSFKDVYLVYELMDTDLHQIIKSSQSLSNDHCQYFLFQLLRGLKYLHSANILHRDLKPGNLLINANCDLKICDFGLARTNNSKDQFMTEYVVTRWYRAPELLLCCENYGTSIDIWSVGCIFAELLGRKPLFPGTECLNQLRLIINILGSQMEEEIEF...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G113680
TK1151 IDTkA08G113680
OH-1004 IDLXL04_030499
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)82.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.663 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G113680
位置Chr08:29589163-29591291 (-)
描述Similar to NTF3: Mitogen-activated protein kinase homolog NTF3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g18170 MKK3-MPK7 模块充当 PR1 基因表达的正调节因子。
The Arabidopsis mitogen-activated protein kinase kinase MKK3 is upstream of group C mitogen-activated protein kinases and participates in pathogen signaling.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.050039
At1g59580 丝裂原活化蛋白激酶 2。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0699400 丝裂原活化蛋白激酶4。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030499 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009734 auxin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004707 MAP kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0016301 kinase activity 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10210
dosa:Os02g0148100
dosa:Os06g0699400
osa:4328297
osa:4341956
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.612
排名 1 · TkA08G113680 · TK1151
细胞核0.580
排名 2 · TkA08G113680 · TK1151
细胞膜0.065
排名 3 · TkA08G113680 · TK1151
线粒体0.050
排名 4 · TkA08G113680 · TK1151
内质网0.032
排名 5 · TkA08G113680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase33-319 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr36-228 aa
PF03109ABC153-70 aa
PF25505ARM_CPL356-120 aa
PF06293Kdo64-173 aa
PF01636APH72-152 aa
PF17482Phage_sheath_1C87-127 aa
PF03109ABC191-188 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G113680PF00069Pkinase333193.7e-70237.0
TkA08G113680PF07714PK_Tyr_Ser-Thr362286.1e-32111.6
TkA08G113680PF03109ABC153701.4e-0525.1
TkA08G113680PF25505ARM_CPL3561200.1312.9
TkA08G113680PF06293Kdo641731.1e-0629.0
TkA08G113680PF01636APH721520.02714.9
TkA08G113680PF17482Phage_sheath_1C871270.04314.6
TkA08G113680PF03109ABC1911881.4e-0525.1
TkA08G113680PF12330Haspin_kinase1031880.0002820.8
TkA08G113680PF14531Kinase-like1122040.05913.3
TkA08G113680PF13095FTA21351790.1112.9
TkA08G113680PF17667Pkinase_fungal1431800.06712.6
TkA08G113680PF01636APH1541800.02714.9
TkA08G113680PF17482Phage_sheath_1C1551960.04314.6
TkA08G113680PF17482Phage_sheath_1C2442850.04314.6
TkA08G113680PF00069Pkinase3403683.7e-70237.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q39027拟南芥sp|Q39027|MPK7_ARATH Mitogen-activated protein kinase 776.800%Swiss-Prot高置信
Q39022拟南芥sp|Q39022|MPK2_ARATH Mitogen-activated protein kinase 275.900%Swiss-Prot高置信
Q5Z859水稻sp|Q5Z859|MPK4_ORYSJ Mitogen-activated protein kinase 477.500%Swiss-Prot高置信

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