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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G112140
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 29160554-29165536 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

696 bp · TkA08G112140|TK1151|cDNA

ATCAGGCGGAGACACCTCGAGCCATGAAATCACGAAGTGACGATGACGACTGGGAATCGAAGTTCGAGGATCAACGAAGGAAGATAATAAAATTGTGGGACGAATGCAACATTCCATTGATTCACAGGACCTACTTTTTCTTGCTCATTCAAGGAGACCCATCCGACTCAGTCTACATCGAGGTCGAGCTCCGACGTCTATCCTTCCTCCAAAAAGCAGTCGACCACGCCTCAAGCATAAAGGCAATGACTGCGGAGAGG...

CDS

下载 CDS FASTA

2472 bp · TkA08G112140|TK1151|CDS

ATGAGAGCGCTTACTGGAGACGATATAAATCACGGCGGTGGACAAGAGCCAGGCGCAAATGAAGAAAAAATATTCGTCTCTGTGAGGGTGAGGCCTTTAAACGAAAAGGAAATTGCCAAAAATAATTCTTGCGATTGGGAATGCATTAGCAATGACACCATTATCTACAAAAACGCTGTAACTGAACGATCAAACTACCCAAATGCCTACACTTTTGATAGAGTATACGGATGTGATAGCAATACAAGACAAGTGTACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

823 aa · TkA08G112140|TK1151|PROTEIN

MRALTGDDINHGGGQEPGANEEKIFVSVRVRPLNEKEIAKNNSCDWECISNDTIIYKNAVTERSNYPNAYTFDRVYGCDSNTRQVYEEGVKRVALSALNGINSSVFAYGQTSSGKTYTMSGITQYAISDIFDYIKNQNDREFVLKFSAIEIYNECVRDLLSADNTPLRLLDDPVKGTVVDKLTEVRLTDWTHLMELLAVCEAQRKIGETSMNEMSSRSHQILRLTIESSPSEFARIGSASSLTASVNFVDLAGSERASQT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G112140
TK1151 IDTkA08G112140
OH-1004 IDLXL04_031535
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)93.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G112140
位置Chr08:29160554-29165536 (-)
描述Similar to KIN7E: Kinesin-like protein KIN-7E
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g21300 类 kinesin 蛋白 KIN-7E。 暂无已核实直接文献
At4g38950 类动力蛋白 KIN-7F。 暂无已核实直接文献
At5g42490 类驱动蛋白KIN-7J。 暂无已核实直接文献
At4g24170 类动力蛋白 KIN-7I。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0538800 体外结合ATP/ADP。 暂无已核实直接文献
Os02g0645100 类驱动蛋白KIN-7C。 暂无已核实直接文献
Os08g0547500 类驱动蛋白KIN-7H。 暂无已核实直接文献
Os02g0644400 推测的非活性类驱动蛋白KIN-7B。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031535 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007018 microtubule-based movement 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005874 microtubule 细胞组分
GO:0003777 microtubule motor activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0008017 microtubule binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G21300
ath:AT3G51150
dosa:Os08g0547500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.664
排名 1 · TkA08G112140 · TK1151
细胞核0.263
排名 2 · TkA08G112140 · TK1151
细胞膜0.136
排名 3 · TkA08G112140 · TK1151
高尔基体0.069
排名 4 · TkA08G112140 · TK1151
溶酶体／液泡0.058
排名 5 · TkA08G112140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF16796Microtub_bd24-160 aa
PF00225Kinesin29-345 aa
PF04344CheZ301-422 aa
PF02181FH2342-421 aa
PF13851GAS343-420 aa
PF11995DUF3490347-401 aa
PF14362DUF4407349-422 aa
PF04102SlyX352-384 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G112140PF16796Microtub_bd241601.3e-2177.9
TkA08G112140PF00225Kinesin293458.9e-100334.6
TkA08G112140PF04344CheZ3014220.3811.3
TkA08G112140PF02181FH23424210.01515.2
TkA08G112140PF13851GAS3434200.02714.6
TkA08G112140PF11995DUF34903474016.5e-57192.5
TkA08G112140PF14362DUF44073494220.1112.5
TkA08G112140PF04102SlyX3523848.57.8
TkA08G112140PF28743IPGAL2_N3553823.18.3
TkA08G112140PF25764KIF21A_4th3594190.4211.0
TkA08G112140PF25101Spectrin_73614070.06214.3
TkA08G112140PF14197Cep57_CLD_23623770.4911.2
TkA08G112140PF28743IPGAL2_N3894133.18.3
TkA08G112140PF04102SlyX3914088.57.8
TkA08G112140PF14197Cep57_CLD_23924180.4911.2
TkA08G112140PF18606HTH_534024300.05913.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4IGL2拟南芥sp|F4IGL2|KN7E_ARATH Kinesin-like protein KIN-7E45.500%Swiss-Prot中等置信
F4JUI9拟南芥sp|F4JUI9|KN7F_ARATH Kinesin-like protein KIN-7F44.000%Swiss-Prot中等置信
Q9FIG8拟南芥sp|Q9FIG8|KN7J_ARATH Kinesin-like protein KIN-7J50.000%Swiss-Prot高置信
F4JQ51拟南芥sp|F4JQ51|KN7I_ARATH Kinesin-like protein KIN-7I45.900%Swiss-Prot中等置信
Q7X7H4水稻sp|Q7X7H4|KN7F_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7F41.800%Swiss-Prot中等置信
Q6H638水稻sp|Q6H638|KN7C_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7C43.000%Swiss-Prot中等置信
Q6Z9D2水稻sp|Q6Z9D2|KN7H_ORYSJ Kinesin-like protein KIN-7H40.800%Swiss-Prot中等置信
Q6H647水稻sp|Q6H647|KN7B_ORYSJ Putative inactive kinesin-like protein KIN-7B (Fragment)42.800%Swiss-Prot中等置信

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