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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G104580
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 27134359-27135589 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

822 bp · TkA08G104580|TK1151|cDNA

ATGGCTTCCGAACCAGTGAAACGAGATTGGTCTATTGAAGATTTCGAGATCGGGAAACTCCTCGGCAAGGGAAAATTCGGTCGAGTATACCTCGCCCGTGAAGTCAAGAGCAAGTATATAGTGGCATTGAAAGTGATATTTAAAGAACAAATCGAAAAATACAGACTGCAACACCAGCTCAAGAGAGAGATGGCGATACAAACAAGCCTTCTTCATCCGCATGTTCTCAGACTTTATGGTTGGTTTCACGATGCAGAAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

822 bp · TkA08G104580|TK1151|CDS

ATGGCTTCCGAACCAGTGAAACGAGATTGGTCTATTGAAGATTTCGAGATCGGGAAACTCCTCGGCAAGGGAAAATTCGGTCGAGTATACCTCGCCCGTGAAGTCAAGAGCAAGTATATAGTGGCATTGAAAGTGATATTTAAAGAACAAATCGAAAAATACAGACTGCAACACCAGCTCAAGAGAGAGATGGCGATACAAACAAGCCTTCTTCATCCGCATGTTCTCAGACTTTATGGTTGGTTTCACGATGCAGAAAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

273 aa · TkA08G104580|TK1151|PROTEIN

MASEPVKRDWSIEDFEIGKLLGKGKFGRVYLAREVKSKYIVALKVIFKEQIEKYRLQHQLKREMAIQTSLLHPHVLRLYGWFHDAERIFLILEYAHGGELYGELRRSGCFSEKQAATYIASLTQALAYCHEKHVIHRDIKPENLLLDHEGRLKIADFGWSVRSEDKRHTMCGTLDYLAPEMVENKAHDYAVDNWTLGVLCYEFLYGVPPFEADSQADTFTRIMKIDLTFPPSSYVSMEAKHLITRLLVKDSEKRLPLEKI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G104580
TK1151 IDTkA08G104580
OH-1004 IDLXL04_031393
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)80.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 99.115
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G104580
位置Chr08:27134359-27135589 (-)
描述Similar to AUR3: Serine/threonine-protein kinase Aurora-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g45490 在体外磷酸化组蛋白 H3 的“Ser-10” 和“Ser-28”，但不在“Thr-3” 或“Thr-11” 处磷酸化。
Characterization of plant Aurora kinases during mitosis.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-3454-x
Aurora kinase is required for chromosome segregation in tobacco BY-2 cells.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2006.02893.x
At2g25880 在体外特异性磷酸化组蛋白H3的'Ser-10'位点。
Characterization of plant Aurora kinases during mitosis.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-3454-x
At4g32830 在体外特异性磷酸化组蛋白 H3 的“Ser-10”，并在有丝分裂过程中与磷酸化组蛋白 H3 共定位。
Characterization of plant Aurora kinases during mitosis.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-3454-x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031393 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000212 meiotic spindle organization 生物过程
GO:0007052 mitotic spindle organization 生物过程
GO:0007100 mitotic centrosome separation 生物过程
GO:0016310 phosphorylation 生物过程
GO:0018105 peptidyl-serine phosphorylation 生物过程
GO:0032465 regulation of cytokinesis 生物过程
GO:0043687 post-translational protein modification 生物过程
GO:0046777 protein autophosphorylation 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0090307 mitotic spindle assembly 生物过程
GO:0000775 chromosome, centromeric region 细胞组分
GO:0000776 kinetochore 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G25880
ath:AT2G45490
ath:AT4G32830
xla:397925
xla:398349
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.655
排名 1 · TkA08G104580 · TK1151
细胞核0.499
排名 2 · TkA08G104580 · TK1151
细胞膜0.082
排名 3 · TkA08G104580 · TK1151
线粒体0.053
排名 4 · TkA08G104580 · TK1151
内质网0.040
排名 5 · TkA08G104580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase15-266 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr16-262 aa
PF14531Kinase-like18-56 aa
PF03109ABC126-53 aa
PF01636APH27-127 aa
PF15818CCDC7327-65 aa
PF01163RIO129-56 aa
PF03109ABC187-171 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G104580PF00069Pkinase152664.4e-74249.9
TkA08G104580PF07714PK_Tyr_Ser-Thr162623.2e-40138.8
TkA08G104580PF14531Kinase-like18561.7e-0628.2
TkA08G104580PF03109ABC126537.6e-0522.7
TkA08G104580PF01636APH271270.01515.8
TkA08G104580PF15818CCDC7327650.548.8
TkA08G104580PF01163RIO129560.0913.1
TkA08G104580PF03109ABC1871717.6e-0522.7
TkA08G104580PF01163RIO1911660.0913.1
TkA08G104580PF01636APH1181520.01515.8
TkA08G104580PF14531Kinase-like1222541.7e-0628.2
TkA08G104580PF07387Seadorna_VP71231570.01814.8
TkA08G104580PF17667Pkinase_fungal1301920.001518.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64629拟南芥sp|O64629|AUR3_ARATH Serine/threonine-protein kinase Aurora-377.800%Swiss-Prot高置信
Q683C9拟南芥sp|Q683C9|AUR2_ARATH Serine/threonine-protein kinase Aurora-261.900%Swiss-Prot高置信
Q9M077拟南芥sp|Q9M077|AUR1_ARATH Serine/threonine-protein kinase Aurora-161.300%Swiss-Prot高置信

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