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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G096550
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 24974909-24976697 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1422 bp · TkA08G096550|TK1151|cDNA

CCTACACATGGTTACCAACCTTCTAGGCAAGGAAAAATGTTACATTAGACATTAGTGTCCCCATTTTCTAACCCTAAAATATTTCACTTGGCATCCCTTTCAGCATCAATATCTATTACACGCGGCCTGCCTTCGAACTGACTGCCGGTGTAATAAGACCTGTTCCCACCGGCCGCTGCTGAACTTCAACTCATGATGGATCCAAAGTTCGCCGGGAACCCAATCCCCACTTCACCGTATTATGGTGGTGGTCGGACTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

984 bp · TkA08G096550|TK1151|CDS

ATGATGGATCCAAAGTTCGCCGGGAACCCAATCCCCACTTCACCGTATTATGGTGGTGGTCGGACTGATATCGATCAGATGCCGGAAACGCCCAATCGCGGAAGCCACCACCGCCGGGCCATGTCGGAGACCTTCTTCCGGTTCCCAGACGAAGACATGCTACTAGACGACGTCGTTGCGGACTTCAACTTCGCCAATATAGACCTCCCATCGCTGTCCTGCGACGCTCCTGTACCTACCACAACGGAAGATTCTTGTAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

327 aa · TkA08G096550|TK1151|PROTEIN

MMDPKFAGNPIPTSPYYGGGRTDIDQMPETPNRGSHHRRAMSETFFRFPDEDMLLDDVVADFNFANIDLPSLSCDAPVPTTTEDSCKSDRESNDVNASKLTARKPLGYSSHIRSLSVGSDFFDGFGLSSAAEPEKLGGGGAYRHRHSSSMDGSPATSFEGDSVSMMLDNSKKALPPDKLAELSLIDPKRAKRILANRQSAARSKERKTRYTSELERKVQTLQTEATTLSAEVTKLQRDTSGLTSENKELKLRLEAMEQHA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G096550
TK1151 IDTkA08G096550
OH-1004 IDLXL04_031241
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G096550
位置Chr08:24974909-24976697 (+)
描述Similar to VIP1: Transcription factor VIP1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g43700 被MPK3磷酸化／激活后，特异性结合TRX8、MYB44等胁迫相关基因中的VIP1应答元件（VRE）DNA序列5′-ACNGCT-3′的转录激活因子。
Isolation and characterization of low-sulphur-tolerant mutants of Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1093/jxb/erq161
At2g40620 可能与 bZIP34 一起参与花粉发育的配子体控制的转录因子。
Characterization of pollen-expressed bZIP protein interactions and the role of ATbZIP18 in the male gametophyte.2017 · DOI: 10.1007/s00497-016-0295-5
At2g31370 推测具有激活作用的转录因子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os03g0336200 转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。
RF2b, a rice bZIP transcription activator, interacts with RF2a and is involved in symptom development of rice tungro disease.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0307687100
Os09g0516200 转录因子可能参与维管发育和芽组织组织。
Transcription factor RF2a alters expression of the rice tungro bacilliform virus promoter in transgenic tobacco plants.2001 · DOI: 10.1073/pnas.121186398
Functional analysis of RF2a, a rice transcription factor.2003 · DOI: 10.1074/jbc.m304862200
RF2b, a rice bZIP transcription activator, interacts with RF2a and is involved in symptom development of rice tungro disease.2004 · DOI: 10.1073/pnas.0307687100
RF2a, a bZIP transcriptional activator of the phloem-specific rice tungro bacilliform virus promoter, functions in vascular development.1997 · DOI: 10.1093/emboj/16.17.5247
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031241 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006355 regulation of DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0006970 response to osmotic stress 生物过程
GO:0007231 osmosensory signaling pathway 生物过程
GO:0009294 DNA-mediated transformation 生物过程
GO:0009652 thigmotropism 生物过程
GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程
GO:0045596 negative regulation of cell differentiation 生物过程
GO:0051170 import into nucleus 生物过程
GO:1902358 sulfate transmembrane transport 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G43700
ath:AT2G31370
ath:AT2G40620
dosa:Os03g0336200
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.973
排名 1 · TkA08G096550 · TK1151
细胞质0.099
排名 2 · TkA08G096550 · TK1151
细胞膜0.027
排名 3 · TkA08G096550 · TK1151
内质网0.014
排名 4 · TkA08G096550 · TK1151
质体0.011
排名 5 · TkA08G096550 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04849HAP1_N50-73 aa
PF03131bZIP_Maf164-249 aa
PF14932HAUS-augmin3165-276 aa
PF07716bZIP_2186-237 aa
PF00170bZIP_1188-247 aa
PF11932DUF3450189-278 aa
PF28726CCDC110191-284 aa
PF06810Phage_scaffold193-268 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G096550PF04849HAP1_N50730.0214.8
TkA08G096550PF03131bZIP_Maf1642490.002818.8
TkA08G096550PF14932HAUS-augmin31652760.05313.7
TkA08G096550PF07716bZIP_21862373.8e-0730.7
TkA08G096550PF00170bZIP_11882471.1e-1042.2
TkA08G096550PF11932DUF34501892780.2111.6
TkA08G096550PF28726CCDC1101912840.01914.5
TkA08G096550PF06810Phage_scaffold1932680.7310.5
TkA08G096550PF14662KASH_CCD1962790.01216.3
TkA08G096550PF25450Rab11-FIP31972760.2312.4
TkA08G096550PF27636CCPG1_N1982780.1913.0
TkA08G096550PF01496V_ATPase_I1992632.36.8
TkA08G096550PF26095CC_Bre12012580.4911.4
TkA08G096550PF27575Map3k7cl2012617.07.8
TkA08G096550PF30854Par-4_C2022490.04514.6
TkA08G096550PF26052BRE1B2022580.3711.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MA75拟南芥sp|Q9MA75|VIP1_ARATH Transcription factor VIP144.500%Swiss-Prot中等置信
O22873拟南芥sp|O22873|BZP18_ARATH bZIP transcription factor 1846.100%Swiss-Prot中等置信
Q04088拟南芥sp|Q04088|POF21_ARATH Probable transcription factor PosF2153.000%Swiss-Prot中等置信
Q6S4P4水稻sp|Q6S4P4|RF2B_ORYSJ Transcription factor RF2b42.700%Swiss-Prot中等置信
Q69IL4水稻sp|Q69IL4|RF2A_ORYSJ Transcription factor RF2a57.800%Swiss-Prot低置信

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