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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G092400
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 23925974-23929364 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2250 bp · TkA08G092400|TK1151|cDNA

ATAACTTTCTTTAGTTTGCTAATCTTGCTATCTTGGGTGAGTTTGTTAAGTGTACTCTACAATGGATCATCAAGACATGGATCTTGAAACAAAGAACATGGAAACAAGAACCTTTTTTTCATCAGAAAGTCAAAGAAACAATGCACCTTACATTCATAAGGTTGGCATACCCCCAAAACAAGATCTCTTGAAGGAGTTCAAAACTAGTGTGAAAGAAACGTTTTTCTCAGATGACCCTTTACGCCCCTTTAAAGATCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

927 bp · TkA08G092400|TK1151|CDS

ATGATAGCATTAACTGAAGCTGTTGCTATTGGAAGAACATTTGCTTCAATGAAAGACTACCAAGTTGATGGGAACAAAGAAATGATAGCATTAGGAACAATGAATGTTGTAGGCTCATTGACATCATGCTATGTTGCAACAGGTTCTTTTTCACGGTCGGCTGTGAATTATATGGCGGGGTGTCAAACAGCAGTTTCCAACATAGTGATGTCATTAGTCGTATTTCTAACCTTAAAATTCTTGACACCACTTTTTGAGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

308 aa · TkA08G092400|TK1151|PROTEIN

MIALTEAVAIGRTFASMKDYQVDGNKEMIALGTMNVVGSLTSCYVATGSFSRSAVNYMAGCQTAVSNIVMSLVVFLTLKFLTPLFEYTPNAILSSIIISAVIGLIDFEAAILIWKIDKFDFVACLGAFLGVVFASVEIGLLIAVSISFAKILLQVTRPRTAILGRVPMTSVYRNIQQYPEATKVPGVLIVRVDSAIYFSNSNYIKERILRWLTEEDDHLRATYQPKVESLIIEMSPVTDIDTSGIHAFEELYRSLVKRDV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G092400
TK1151 IDTkA08G092400
OH-1004 IDLXL04_031186
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 41.012
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G092400
位置Chr08:23925974-23929364 (-)
描述Similar to ST2: High affinity sulfate transporter 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g78000 可能作为高亲和力 H⁺/硫酸盐同向转运蛋白，介导植物根部对环境硫酸盐的吸收。
Two distinct high-affinity sulfate transporters with different inducibilities mediate uptake of sulfate in Arabidopsis roots.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01231.x
Selenate-resistant mutants of Arabidopsis thaliana identify Sultr1;2, a sulfate transporter required for efficient transport of sulfate into roots.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01232.x
At1g22150 可能作为高亲和力 H⁺/硫酸盐同向转运蛋白，介导硫酸盐向筛管的装载。
Phloem-localizing sulfate transporter, Sultr1;3, mediates re-distribution of sulfur from source to sink organs in Arabidopsis.2003 · DOI: 10.1104/pp.014712
At4g08620 可能作为高亲和力 H⁺/硫酸盐同向转运蛋白，介导低硫条件下根部对硫酸盐的吸收。
The roles of three functional sulphate transporters involved in uptake and translocation of sulphate in Arabidopsis thaliana.2000 · DOI: 10.1046/j.1365-313x.2000.00768.x
Two distinct high-affinity sulfate transporters with different inducibilities mediate uptake of sulfate in Arabidopsis roots.2002 · DOI: 10.1046/j.0960-7412.2001.01231.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031186 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009970 cellular response to sulfate starvation 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:1902358 sulfate transmembrane transport 生物过程
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0008271 secondary active sulfate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015116 sulfate transmembrane transporter activity 分子功能
GO:0015293 symporter activity 分子功能
GO:0022857 transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G22150
ath:AT1G78000
ath:AT4G08620
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.588
排名 1 · TkA08G092400 · TK1151
溶酶体／液泡0.176
排名 2 · TkA08G092400 · TK1151
细胞质0.117
排名 3 · TkA08G092400 · TK1151
内质网0.099
排名 4 · TkA08G092400 · TK1151
高尔基体0.060
排名 5 · TkA08G092400 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00916Sulfate_transp1-125 aa
PF04161Arv161-123 aa
PF11457DUF302162-138 aa
PF07178TraL62-77 aa
PF26273Gly_zipper96-105 aa
PF07178TraL105-152 aa
PF26273Gly_zipper124-142 aa
PF00916Sulfate_transp134-151 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G092400PF00916Sulfate_transp11256.2e-48164.2
TkA08G092400PF04161Arv1611230.01416.4
TkA08G092400PF11457DUF3021621380.1513.0
TkA08G092400PF07178TraL62778.47.6
TkA08G092400PF26273Gly_zipper961050.8910.0
TkA08G092400PF07178TraL1051528.47.6
TkA08G092400PF26273Gly_zipper1241420.8910.0
TkA08G092400PF00916Sulfate_transp1341516.2e-48164.2
TkA08G092400PF01740STAS1782969.7e-29100.0
TkA08G092400PF13466STAS_22222830.001919.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9MAX3拟南芥sp|Q9MAX3|SUT12_ARATH Sulfate transporter 1.275.300%Swiss-Prot高置信
Q9FEP7拟南芥sp|Q9FEP7|SUT13_ARATH Sulfate transporter 1.375.600%Swiss-Prot高置信
Q9SAY1拟南芥sp|Q9SAY1|SUT11_ARATH Sulfate transporter 1.171.000%Swiss-Prot高置信

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