TkA08G090830 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA08G090830

当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 23496272-23498077 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1693 bp · TkA08G090830|TK1151|cDNA

TTTCATCTTGTGTCCTATATATATATATATAAAACCTTACACTGCTATTCATATATTGCATCTAAAACAAACAAAACTCATTTCAAACATACAGTTATGGGATCCATGAACAAACCTCATGCAGTATGCATACCCTTCCCAGCACAAGGCCACATCAATCCCATGCTAAAACTAGCTAAGATCCTCCATTCCAAAGGCTTCCATATCACCTTCGTCAACACCGACTTCAACCACCAACGCCTTCTCAAGTCACAGGGCTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1524 bp · TkA08G090830|TK1151|CDS

TTTCATCTTGTGTCCTATATATATATATATAAAACCTTACACTGCTATTCATATATTGCATCTAAAACAAACAAAACTCATTTCAAACATACAGTTATGGGATCCATGAACAAACCTCATGCAGTATGCATACCCTTCCCAGCACAAGGCCACATCAATCCCATGCTAAAACTAGCTAAGATCCTCCATTCCAAAGGCTTCCATATCACCTTCGTCAACACCGACTTCAACCACCAACGCCTTCTCAAGTCACAGGGCTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

507 aa · TkA08G090830|TK1151|PROTEIN

FHLVSYIYIYKTLHCYSYIASKTNKTHFKHTVMGSMNKPHAVCIPFPAQGHINPMLKLAKILHSKGFHITFVNTDFNHQRLLKSQGSATLTHLPSFKFETIPDGLPPPENLDATQDIPSLCKSTSETALEPFKKLLFKLNDTTTTTTPPVSCIISDGAMSFTLDAANELGIPEVLFWTTSACGFLAYVHYNTLRQKGYIPLKDSADLTNGYLDTLVDCIPSMKGTRLKDMPSFLRSTDPDEFMVNFIIRETTRAKQASAI...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA08G090830`
TK1151 ID	TkA08G090830
OH-1004 ID	LXL04_031164
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	99.600
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 93.688 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA08G090830

位置 Chr08:23496272-23498077 (+)

描述 Similar to UGT85A24: 7-deoxyloganetin glucosyltransferase

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g22360`	UDP-糖基转移酶 85A2。	暂无已核实直接文献
`At1g22370`	UDP-糖基转移酶 85A5。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_031164 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:1900994 (-)-secologanin biosynthetic process 生物过程

GO:0005634 nucleus 细胞组分

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0010494 cytoplasmic stress granule 细胞组分

GO:0008194 UDP-glycosyltransferase activity 分子功能

GO:0015020 glucuronosyltransferase activity 分子功能

GO:0035251 UDP-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0080043 quercetin 3-O-glucosyltransferase activity 分子功能

GO:0080044 quercetin 7-O-glucosyltransferase activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ag:ABV68925

ag:BAK55737

ag:BAK55749

ath:AT1G22360

ath:AT1G22380

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.693

排名 1 · TkA08G090830 · TK1151

细胞核0.212

排名 2 · TkA08G090830 · TK1151

质体0.089

排名 3 · TkA08G090830 · TK1151

内质网0.079

排名 4 · TkA08G090830 · TK1151

过氧化物酶体0.070

排名 5 · TkA08G090830 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26168Glyco_transf_N42-170 aa

PF06722EryCIII-like_C163-176 aa

PF07249Cerato-platanin170-192 aa

PF26168Glyco_transf_N236-290 aa

PF00201UDPGT241-472 aa

PF07249Cerato-platanin385-415 aa

PF06722EryCIII-like_C389-470 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA08G090830	`PF26168`	Glyco_transf_N	42	170	2.1e-11	44.9
TkA08G090830	`PF06722`	EryCIII-like_C	163	176	0.13	13.0
TkA08G090830	`PF07249`	Cerato-platanin	170	192	0.041	14.7
TkA08G090830	`PF26168`	Glyco_transf_N	236	290	2.1e-11	44.9
TkA08G090830	`PF00201`	UDPGT	241	472	2.7e-30	106.4
TkA08G090830	`PF07249`	Cerato-platanin	385	415	0.041	14.7
TkA08G090830	`PF06722`	EryCIII-like_C	389	470	0.13	13.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9ZWJ3`	拟南芥	sp\|Q9ZWJ3\|U85A2_ARATH UDP-glycosyltransferase 85A2	61.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9LMF0`	拟南芥	sp\|Q9LMF0\|U85A5_ARATH UDP-glycosyltransferase 85A5	59.400%	Swiss-Prot	高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情