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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G085530
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 22045552-22046487 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

936 bp · TkA08G085530|TK1151|cDNA

ATGGACTTGTCGGTGCTCCGGCGTCGTCAACAGAAGGAAAAAGTGGTGGTTGTAATGGGTGCTACCGGCACCGGAAAATCAAGACTTTCTATCGACCTCGCCACCCGGTTCCAGGGTGAGATAATAAATTCTGACAAGATACAAATCTATGAAGGATTAGATATCGTCACGAATAAAATCAGTGAGGAAGAATGCGGCGGCGTGCCGCACCACCTTCTCGGAATTGTCGACCCGGAATCGGATTTCACCGCAAGAAACTT...

CDS

下载 CDS FASTA

936 bp · TkA08G085530|TK1151|CDS

ATGGACTTGTCGGTGCTCCGGCGTCGTCAACAGAAGGAAAAAGTGGTGGTTGTAATGGGTGCTACCGGCACCGGAAAATCAAGACTTTCTATCGACCTCGCCACCCGGTTCCAGGGTGAGATAATAAATTCTGACAAGATACAAATCTATGAAGGATTAGATATCGTCACGAATAAAATCAGTGAGGAAGAATGCGGCGGCGTGCCGCACCACCTTCTCGGAATTGTCGACCCGGAATCGGATTTCACCGCAAGAAACTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

311 aa · TkA08G085530|TK1151|PROTEIN

MDLSVLRRRQQKEKVVVVMGATGTGKSRLSIDLATRFQGEIINSDKIQIYEGLDIVTNKISEEECGGVPHHLLGIVDPESDFTARNFVSTASMAMESIVGRGKLPVIAGGSNSFIEALVDDENYDFRSRYDVCFLWVDVTMVVLHQFVADRVDRMVAAGMVEEVRNMYNPKADNSKGIRRAIGVPEFDSYFRAEYSSFADEKTRAKLLESAINKTKINTCILAHRQLEKIHRLRNVKGWKIHRLDATKVFQRKGREADEA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G085530
TK1151 IDTkA08G085530
OH-1004 IDLXL04_036992
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)77.900
蛋白覆盖度 (%)TK1151 97.428 / OH-1004 90.361
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G085530
位置Chr08:22045552-22046487 (+)
描述Similar to IPT3: Adenylate isopentenyltransferase 3, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g63110 参与细胞分裂素生物合成。 暂无已核实直接文献
At5g19040 参与细胞分裂素生物合成。 暂无已核实直接文献
At3g23630 参与细胞分裂素生物合成。 暂无已核实直接文献
At3g19160 参与细胞分裂素生物合成。
Identification of genes encoding adenylate isopentenyltransferase, a cytokinin biosynthesis enzyme, in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1074/jbc.m102130200
The Arabidopsis AtIPT8/PGA22 gene encodes an isopentenyl transferase that is involved in de novo cytokinin biosynthesis.2003 · DOI: 10.1104/pp.011494
At1g68460 参与细胞分裂素生物合成。
Roles of Arabidopsis ATP/ADP isopentenyltransferases and tRNA isopentenyltransferases in cytokinin biosynthesis.2006 · DOI: 10.1073/pnas.0603522103

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036992 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006400 tRNA modification 生物过程
GO:0009691 cytokinin biosynthetic process 生物过程
GO:0009860 pollen tube growth 生物过程
GO:0034265 isopentenyl adenine biosynthetic process 生物过程
GO:0080117 secondary growth 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0031965 nuclear membrane 细胞组分
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009824 AMP dimethylallyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ag:AAS94327
ath:AT1G68460
ath:AT3G23630
ath:AT3G63110
ath:AT5G19040
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.459
排名 1 · TkA08G085530 · TK1151
细胞质0.233
排名 2 · TkA08G085530 · TK1151
细胞核0.227
排名 3 · TkA08G085530 · TK1151
线粒体0.134
排名 4 · TkA08G085530 · TK1151
过氧化物酶体0.051
排名 5 · TkA08G085530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04851ResIII6-40 aa
PF13191AAA_168-39 aa
PF13401AAA_2211-188 aa
PF20720nSTAND311-40 aa
PF02562PhoH11-36 aa
PF13481AAA_2512-35 aa
PF01745IPT14-167 aa
PF09848SLFN-g3_helicase14-38 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G085530PF04851ResIII6400.02915.0
TkA08G085530PF13191AAA_168390.04714.9
TkA08G085530PF13401AAA_22111880.001419.7
TkA08G085530PF20720nSTAND311400.01915.4
TkA08G085530PF02562PhoH11360.0913.0
TkA08G085530PF13481AAA_2512350.03314.5
TkA08G085530PF01745IPT141678.2e-0832.7
TkA08G085530PF09848SLFN-g3_helicase14380.1911.7
TkA08G085530PF13671AAA_3315470.05514.5
TkA08G085530PF13521AAA_2816390.07614.0
TkA08G085530PF00910RNA_helicase16500.1213.6
TkA08G085530PF01715IPPT481211.4e-38133.7
TkA08G085530PF31070DUF8801921500.01415.7
TkA08G085530PF01715IPPT1272281.4e-38133.7
TkA08G085530PF13521AAA_281952220.07614.0
TkA08G085530PF20720nSTAND32002250.01915.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q93WC9拟南芥sp|Q93WC9|IPT3_ARATH Adenylate isopentenyltransferase 3, chloroplastic57.600%Swiss-Prot高置信
Q94ID2拟南芥sp|Q94ID2|IPT5_ARATH Adenylate isopentenyltransferase 5, chloroplastic60.700%Swiss-Prot高置信
Q94ID1拟南芥sp|Q94ID1|IPT7_ARATH Adenylate isopentenyltransferase 7, mitochondrial54.000%Swiss-Prot高置信
Q9LJL4拟南芥sp|Q9LJL4|IPT8_ARATH Adenylate isopentenyltransferase 8, chloroplastic46.100%Swiss-Prot中等置信
Q94ID3拟南芥sp|Q94ID3|IPT1_ARATH Adenylate isopentenyltransferase 1, chloroplastic45.800%Swiss-Prot中等置信

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