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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G066500
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 17104887-17110204 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1045 bp · TkA08G066500|TK1151|cDNA

CTATCAATCGACCCACCCCTATACCCACACCTCCAACATTGACTCCAATACATAAATCAACAAACCAAATCCCCTTTGCCCAACCCTTGCACAAAATAATTACCGGTTTCTTAATCAAACCCTCGTCAATTTAACAACTTACCACCATCGAATAATGGGTTGGAGCACGTTAGTAATCGTATTAGTAGCAACAACAGTGACATTTACATCGGCGAGGAGAGGAGGGAATCCCGATGTGGCCGCACTTTCCGCCTTTCGCA...

CDS

下载 CDS FASTA

648 bp · TkA08G066500|TK1151|CDS

ATGGGTTGGAGCACGTTAGTAATCGTATTAGTAGCAACAACAGTGACATTTACATCGGCGAGGAGAGGAGGGAATCCCGATGTGGCCGCACTTTCCGCCTTTCGCAAGGCCGTAAAGGATCCCAGTAAAGTACTTGAGACTTGGGATTCTGGTCTTACTGATGCATGTACCTGGATTCACATCAAATGCAGCCCAGATAACCACGTTATCCGTGTGGATCTTGGAAACTCAAACTTGACGGGCTATCTCCCAACTGAACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

215 aa · TkA08G066500|TK1151|PROTEIN

MGWSTLVIVLVATTVTFTSARRGGNPDVAALSAFRKAVKDPSKVLETWDSGLTDACTWIHIKCSPDNHVIRVDLGNSNLTGYLPTELGSLEHLQYLELYKNKLQGIIPKELGNLKSLVSLDLYENNLSGSIPASLGNLKALIFLRLNNNQLSGRIPRELKGATNLKVVDVSHNNLCGTFPTTGPFAHIPLSNFENNPRLEGPELMGLASYDTNCT

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G066500
TK1151 IDTkA08G066500
OH-1004 IDLXL04_018526
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)70.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G066500
位置Chr08:17104887-17110204 (+)
描述Similar to LRR1: Leucine-rich repeat protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g21090 参与植物防御反应。
A novel simple extracellular leucine-rich repeat (eLRR) domain protein from rice (OsLRR1) enters the endosomal pathway and interacts with the hypersensitive-induced reaction protein 1 (OsHIR1).2009 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2009.02039.x
At3g43740 可能参与植物防御反应。 暂无已核实直接文献
At4g33430 双特异性激酶作用于含丝氨酸/苏氨酸和含酪氨酸的底物。
The BRI1-associated kinase 1, BAK1, has a brassinolide-independent role in plant cell-death control.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.046
BAK1 and BKK1 regulate brassinosteroid-dependent growth and brassinosteroid-independent cell-death pathways.2007 · DOI: 10.1016/j.cub.2007.05.036
Arabidopsis SOMATIC EMBRYOGENESIS RECEPTOR KINASE proteins serve brassinosteroid-dependent and -independent signaling pathways.2008 · DOI: 10.1104/pp.108.123216
Tyrosine phosphorylation of the BRI1 receptor kinase emerges as a component of brassinosteroid signaling in Arabidopsis.2009 · DOI: 10.1073/pnas.0810249106
Phosphorylation of receptor-like cytoplasmic kinases by bacterial flagellin.2010 · DOI: 10.4161/psb.11500
The Arabidopsis leucine-rich repeat receptor-like kinases BAK1/SERK3 and BKK1/SERK4 are required for innate immunity to hemibiotrophic and biotrophic pathogens.2011 · DOI: 10.1105/tpc.111.084301
Structure of the pseudokinase domain of BIR2, a regulator of BAK1-mediated immune signaling in Arabidopsis.2014 · DOI: 10.1016/j.jsb.2014.02.005
Phytosulfokine Regulates Growth in Arabidopsis through a Response Module at the Plasma Membrane That Includes CYCLIC NUCLEOTIDE-GATED CHANNEL17, H+-ATPase, and BAK1.2015 · DOI: 10.1105/tpc.15.00306
An RLP23-SOBIR1-BAK1 complex mediates NLP-triggered immunity.2015 · DOI: 10.1038/nplants.2015.140
The SCOOP12 peptide regulates defense response and root elongation in Arabidopsis thaliana.2019 · DOI: 10.1093/jxb/ery454
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8ABC2 参与植物防御反应。 暂无已核实直接文献
Os01g0809300 参与植物防御反应。
A novel simple extracellular leucine-rich repeat (eLRR) domain protein from rice (OsLRR1) enters the endosomal pathway and interacts with the hypersensitive-induced reaction protein 1 (OsHIR1).2009 · DOI: 10.1111/j.1365-3040.2009.02039.x
Os04g0457800 LRR 受体激酶参与体细胞胚胎发生的正向调节和对稻瘟病菌病原体 Magnaporthe oryzae 的防御反应。
Rice SERK1 gene positively regulates somatic embryogenesis of cultured cell and host defense response against fungal infection.2005 · DOI: 10.1007/s00425-005-1534-4
An XA21-associated kinase (OsSERK2) regulates immunity mediated by the XA21 and XA3 immune receptors.2014 · DOI: 10.1093/mp/ssu003
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018526 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0031901 early endosome membrane 细胞组分
GO:0031902 late endosome membrane 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004675 transmembrane receptor protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0015026 coreceptor activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G43740
ath:AT5G21090
dosa:Os01g0809300
dosa:Os08g0174700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.546
排名 1 · TkA08G066500 · TK1151
细胞外0.162
排名 2 · TkA08G066500 · TK1151
内质网0.112
排名 3 · TkA08G066500 · TK1151
细胞质0.086
排名 4 · TkA08G066500 · TK1151
溶酶体／液泡0.048
排名 5 · TkA08G066500 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF08263LRRNT_225-64 aa
PF00560LRR_171-90 aa
PF23598LRR_1471-169 aa
PF13855LRR_871-127 aa
PF12799LRR_471-103 aa
PF23211LRR_LRWD172-104 aa
PF24141LRR_ComC72-110 aa
PF00560LRR_192-114 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G066500PF08263LRRNT_225642.9e-0937.7
TkA08G066500PF00560LRR_171902.2e-1760.1
TkA08G066500PF23598LRR_14711695.7e-1245.8
TkA08G066500PF13855LRR_8711272.3e-1144.0
TkA08G066500PF12799LRR_4711032.7e-1144.1
TkA08G066500PF23211LRR_LRWD1721040.0003521.1
TkA08G066500PF24141LRR_ComC721100.04414.2
TkA08G066500PF00560LRR_1921142.2e-1760.1
TkA08G066500PF12799LRR_4921322.7e-1144.1
TkA08G066500PF23211LRR_LRWD1931520.0003521.1
TkA08G066500PF29252LRR_NLRC41121420.08812.7
TkA08G066500PF29252LRR_NLRC41131660.08812.7
TkA08G066500PF00560LRR_11161382.2e-1760.1
TkA08G066500PF13855LRR_81251752.3e-1144.0
TkA08G066500PF24141LRR_ComC1311780.04414.2
TkA08G066500PF12799LRR_41401782.7e-1144.1

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FPJ5拟南芥sp|Q9FPJ5|LRR1_ARATH Leucine-rich repeat protein 184.800%Swiss-Prot高置信
Q6NQP4拟南芥sp|Q6NQP4|LRR2_ARATH Leucine-rich repeat protein 280.900%Swiss-Prot高置信
Q94F62拟南芥sp|Q94F62|BAK1_ARATH BRASSINOSTEROID INSENSITIVE 1-associated receptor kinase 169.300%Swiss-Prot低置信
B8ABC2水稻sp|B8ABC2|LRR1_ORYSI Leucine-rich repeat protein 179.500%Swiss-Prot高置信
Q5VQP7水稻sp|Q5VQP7|LRR1_ORYSJ Leucine-rich repeat protein 179.500%Swiss-Prot高置信
Q7XV05水稻sp|Q7XV05|SERK2_ORYSJ LRR receptor kinase SERK250.600%Swiss-Prot低置信

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