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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G065240
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 16678632-16681475 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1497 bp · TkA08G065240|TK1151|cDNA

ACCACCACCACCGTATCTCTCTCCTCACGACGGCGACTTCCAATCACACACAGTGGACAAAAAAATGGGAAGATCATTCCGTTATGTGATAATCGGTGGAGGTGTCGCTGCTGGTTATGCAGCTCTCGAATTCACCAAAAAAGGCGTCTCTCATGGTGAACTCTGCATCATCTCCGACGAACCTGTGGCTCCTTATGAGCGACCAGCACTCAGCAAAGGGTTTCTACTTCCAGAAGCTTCTGCACGTCTCCCTGGCTTTC...

CDS

下载 CDS FASTA

1383 bp · TkA08G065240|TK1151|CDS

ATGGGAAGATCATTCCGTTATGTGATAATCGGTGGAGGTGTCGCTGCTGGTTATGCAGCTCTCGAATTCACCAAAAAAGGCGTCTCTCATGGTGAACTCTGCATCATCTCCGACGAACCTGTGGCTCCTTATGAGCGACCAGCACTCAGCAAAGGGTTTCTACTTCCAGAAGCTTCTGCACGTCTCCCTGGCTTTCATACTTGTGTAGGTGCCAATGAAGAGAGGTTAACACCCAATTGGTACAAAGAATATGGGATAGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

460 aa · TkA08G065240|TK1151|PROTEIN

MGRSFRYVIIGGGVAAGYAALEFTKKGVSHGELCIISDEPVAPYERPALSKGFLLPEASARLPGFHTCVGANEERLTPNWYKEYGIELILGTRVESIDVRRKTLLTTTGETISYKFLIIATGSRAVKLEEIGIKGSDAENVCYLHDLADATNLVNIMQKCSGGNAIVVGGGYIGMECAASLVANKINVSIVFPGPHCMERLFTPKIASYYEDFYKSKGVNFVKGTSLSSFEFNSEGMVTGANLRDGRQLPADMIVVGIGA...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G065240
TK1151 IDTkA08G065240
OH-1004 IDLXL04_018503
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G065240
位置Chr08:16678632-16681475 (-)
描述Similar to MDAR4: Monodehydroascorbate reductase 4, peroxisomal
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g27820 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，并在此过程中氧化 NADH。
Arabidopsis peroxisomes possess functionally redundant membrane and matrix isoforms of monodehydroascorbate reductase.2005 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02503.x
MONODEHYROASCORBATE REDUCTASE4 is required for seed storage oil hydrolysis and postgerminative growth in Arabidopsis.2007 · DOI: 10.1105/tpc.106.043992

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0707100 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。 暂无已核实直接文献
Os02g0707000 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。 暂无已核实直接文献
Os09g0567300 催化单脱氢抗坏血酸转化为抗坏血酸，同时氧化 NADH。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018503 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0042744 hydrogen peroxide catabolic process 生物过程
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005778 peroxisomal membrane 细胞组分
GO:0009941 chloroplast envelope 细胞组分
GO:0016656 monodehydroascorbate reductase (NADH) activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G27820
dosa:Os02g0707000
dosa:Os02g0707100
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.373
排名 1 · TkA08G065240 · TK1151
细胞质0.273
排名 2 · TkA08G065240 · TK1151
过氧化物酶体0.235
排名 3 · TkA08G065240 · TK1151
质体0.131
排名 4 · TkA08G065240 · TK1151
细胞核0.106
排名 5 · TkA08G065240 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13241NAD_binding_75-39 aa
PF07992Pyr_redox_26-320 aa
PF13738Pyr_redox_36-28 aa
PF00070Pyr_redox7-29 aa
PF01266DAO7-28 aa
PF03486HI0933_like7-27 aa
PF01134GIDA8-28 aa
PF04820Trp_halogenase8-27 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G065240PF13241NAD_binding_75390.0117.1
TkA08G065240PF07992Pyr_redox_263201.7e-56192.5
TkA08G065240PF13738Pyr_redox_36281.3e-0835.1
TkA08G065240PF00070Pyr_redox7292.2e-1764.1
TkA08G065240PF01266DAO7288.7e-0729.5
TkA08G065240PF03486HI0933_like7270.0006620.0
TkA08G065240PF01134GIDA8280.03413.9
TkA08G065240PF04820Trp_halogenase8270.1511.6
TkA08G065240PF29717AF_1314_N8260.2612.4
TkA08G065240PF00890FAD_binding_28280.3110.9
TkA08G065240PF13450NAD_binding_89280.2112.6
TkA08G065240PF03486HI0933_like801260.0006620.0
TkA08G065240PF00070Pyr_redox821032.2e-1764.1
TkA08G065240PF13738Pyr_redox_3822951.3e-0835.1
TkA08G065240PF01266DAO821258.7e-0729.5
TkA08G065240PF01593Amino_oxidase871270.01715.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LK94拟南芥sp|Q9LK94|MDAR4_ARATH Monodehydroascorbate reductase 4, peroxisomal65.600%Swiss-Prot高置信
Q8S3R2水稻sp|Q8S3R2|MDAR2_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 2, peroxisomal63.200%Swiss-Prot高置信
Q8S3R1水稻sp|Q8S3R1|MDAR1_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 1, peroxisomal61.400%Swiss-Prot高置信
Q652L6水稻sp|Q652L6|MDAR3_ORYSJ Monodehydroascorbate reductase 3, cytosolic52.600%Swiss-Prot高置信

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