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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G058810
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 15044103-15046319 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2157 bp · TkA08G058810|TK1151|cDNA

ATGTACTATCTCTATGTTCGTGTTGAAAAAGCGAGAGACCTACCTATAAATCCTTTAACTGCTAGCTGTGATCCCTACGTTGAAGTCAAACTCGGGAACTACAAAGGGAAAACAAAGCATTTTGAGAAGAGAACTTACGCGGAATGGAAACAGGTGTTTGCGTTTTCAAAAGAGAAGATACAGTCGACTGTTCTCGAAGTTTATGTGAAGGATAAAGATATGATTTCGAGAGATGATTATTTGGGGAAGGTGGTGTTTGA...

CDS

下载 CDS FASTA

2157 bp · TkA08G058810|TK1151|CDS

ATGTACTATCTCTATGTTCGTGTTGAAAAAGCGAGAGACCTACCTATAAATCCTTTAACTGCTAGCTGTGATCCCTACGTTGAAGTCAAACTCGGGAACTACAAAGGGAAAACAAAGCATTTTGAGAAGAGAACTTACGCGGAATGGAAACAGGTGTTTGCGTTTTCAAAAGAGAAGATACAGTCGACTGTTCTCGAAGTTTATGTGAAGGATAAAGATATGATTTCGAGAGATGATTATTTGGGGAAGGTGGTGTTTGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

718 aa · TkA08G058810|TK1151|PROTEIN

MYYLYVRVEKARDLPINPLTASCDPYVEVKLGNYKGKTKHFEKRTYAEWKQVFAFSKEKIQSTVLEVYVKDKDMISRDDYLGKVVFDMNEVPTRVPPDSPLAPQWYRLEDRKGERKIKGEVMLAVWMGTQADEAFSEAWHSDAATVHGEGVFSVRSKVVNVIEAQDVESADKSQLPQVFVKAQLGNQILKTKLSATKTTNPLWNEDLVFVAAEPFEEQLVLTLENKATSKEEIVGRIVLPLNSFEKRLDHRTVHSKWYNL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G058810
TK1151 IDTkA08G058810
OH-1004 IDLXL04_018403
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)97.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 93.418
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G058810
位置Chr08:15044103-15046319 (-)
描述Similar to FTIP1: FT-interacting protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g06850 参与通过胞间连丝将 FT 从韧皮部伴胞输出到筛管元素的过程。
FTIP1 is an essential regulator required for florigen transport.2012 · DOI: 10.1371/journal.pbio.1001313
Characterization of Multiple C2 Domain and Transmembrane Region Proteins in Arabidopsis.2018 · DOI: 10.1104/pp.17.01144
At5g48060 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献
At5g12970 可能通过调节其他调控因子的运输发挥信号分子的功能。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0614000 参与长日照特异性促花信号RFT1 从韧皮部伴细胞到筛元件的输出。
OsFTIP1-Mediated Regulation of Florigen Transport in Rice Is Negatively Regulated by the Ubiquitin-Like Domain Kinase OsUbDKγ4.2017 · DOI: 10.1105/tpc.16.00728
Os05g0370600 促进转录因子 OSH1 的核转位，在花药发育后期直接抑制生长素生物合成基因 YUCCA4。
OsFTIP7 determines auxin-mediated anther dehiscence in rice.2018 · DOI: 10.1038/s41477-018-0175-0
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018403 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009663 plasmodesma organization 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0009911 positive regulation of flower development 生物过程
GO:0010228 vegetative to reproductive phase transition of meristem 生物过程
GO:0010930 negative regulation of auxin mediated signaling pathway 生物过程
GO:0048574 long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0048578 positive regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:1902182 shoot apical meristem development 生物过程
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G57880
ath:AT5G06850
ath:AT5G48060
dosa:Os05g0370600
dosa:Os06g0614000
osa:4338582
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.491
排名 1 · TkA08G058810 · TK1151
细胞膜0.251
排名 2 · TkA08G058810 · TK1151
高尔基体0.190
排名 3 · TkA08G058810 · TK1151
细胞质0.176
排名 4 · TkA08G058810 · TK1151
细胞核0.082
排名 5 · TkA08G058810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00168C23-108 aa
PF00168C2158-260 aa
PF19706DUF6203299-313 aa
PF00168C2308-418 aa
PF24677DUF7657506-584 aa
PF06398Pex24p519-699 aa
PF04842DUF639529-562 aa
PF08372PRT_C536-555 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G058810PF00168C231087.2e-62206.8
TkA08G058810PF00168C21582607.2e-62206.8
TkA08G058810PF19706DUF62032993130.1612.6
TkA08G058810PF00168C23084187.2e-62206.8
TkA08G058810PF24677DUF76575065842.17.7
TkA08G058810PF06398Pex24p5196990.0004520.1
TkA08G058810PF04842DUF6395295620.839.8
TkA08G058810PF08372PRT_C5365551.3e-79266.2
TkA08G058810PF08372PRT_C5637181.3e-79266.2
TkA08G058810PF04842DUF6396476900.839.8
TkA08G058810PF24677DUF76576586892.17.7
TkA08G058810PF19706DUF62036646980.1612.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FL59拟南芥sp|Q9FL59|FTIP1_ARATH FT-interacting protein 175.900%Swiss-Prot高置信
Q9FI32拟南芥sp|Q9FI32|MCTP2_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 268.400%Swiss-Prot高置信
Q9LXU2拟南芥sp|Q9LXU2|MCTP5_ARATH Multiple C2 domain and transmembrane region protein 567.000%Swiss-Prot高置信
Q69T22水稻sp|Q69T22|FTIP1_ORYSJ FT-interacting protein 168.200%Swiss-Prot高置信
Q60EW9水稻sp|Q60EW9|FTIP7_ORYSJ FT-interacting protein 767.100%Swiss-Prot高置信

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