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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G054970
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 14100925-14101347 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

423 bp · TkA08G054970|TK1151|cDNA

ATGGAGCATCTTCCGGTGGAAGTCATCGGCAACATCCTCTCTCGGCTCGGCGCCGCTCGTGACGTCGTAATCGCCTCCGCCACTTGCCGGAAATGGCGAGAAGCCTGGCGCATCCACCTCCACACACTCTCCTTCAACTCAAACGACTGGCCTGTTTACCACGAACTAACAACAAGCAGACTCGAAATCCTCATCACTCAAACAATCTTCCAAACCACCGGCCTCCAATCTCTCTCAATCATCATGGACGACGTCGACGA...

CDS

下载 CDS FASTA

423 bp · TkA08G054970|TK1151|CDS

ATGGAGCATCTTCCGGTGGAAGTCATCGGCAACATCCTCTCTCGGCTCGGCGCCGCTCGTGACGTCGTAATCGCCTCCGCCACTTGCCGGAAATGGCGAGAAGCCTGGCGCATCCACCTCCACACACTCTCCTTCAACTCAAACGACTGGCCTGTTTACCACGAACTAACAACAAGCAGACTCGAAATCCTCATCACTCAAACAATCTTCCAAACCACCGGCCTCCAATCTCTCTCAATCATCATGGACGACGTCGACGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

140 aa · TkA08G054970|TK1151|PROTEIN

MEHLPVEVIGNILSRLGAARDVVIASATCRKWREAWRIHLHTLSFNSNDWPVYHELTTSRLEILITQTIFQTTGLQSLSIIMDDVDEFSAAPVIAWLMYTRESLRQLHYNVRTSPTINILEKCGRQKLEILNLSHNTITE

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G054970
TK1151 IDTkA08G054970
OH-1004 IDLXL04_018327
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.286 / OH-1004 37.568
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G054970
位置Chr08:14100925-14101347 (-)
描述Similar to At1g67190: F-box/LRR-repeat protein At1g67190
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g67190 F-box/LRR 重复蛋白 At1g67190。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018327 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G10780
ath:AT1G67190
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.512
排名 1 · TkA08G054970 · TK1151
细胞核0.418
排名 2 · TkA08G054970 · TK1151
细胞膜0.125
排名 3 · TkA08G054970 · TK1151
内质网0.091
排名 4 · TkA08G054970 · TK1151
质体0.060
排名 5 · TkA08G054970 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12937F-box-like1-35 aa
PF00646F-box2-38 aa
PF13516LRR_639-49 aa
PF00560LRR_139-49 aa
PF12799LRR_439-48 aa
PF13855LRR_840-48 aa
PF13855LRR_866-78 aa
PF12799LRR_472-80 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G054970PF12937F-box-like1351.9e-0834.6
TkA08G054970PF00646F-box2386.1e-0626.7
TkA08G054970PF13516LRR_639490.07113.9
TkA08G054970PF00560LRR_139490.1812.8
TkA08G054970PF12799LRR_439480.4911.4
TkA08G054970PF13855LRR_840480.710.4
TkA08G054970PF13855LRR_866780.710.4
TkA08G054970PF12799LRR_472800.4911.4
TkA08G054970PF13516LRR_673790.07113.9
TkA08G054970PF13516LRR_61261390.07113.9
TkA08G054970PF13855LRR_81261390.710.4
TkA08G054970PF00560LRR_11271390.1812.8
TkA08G054970PF12799LRR_41271390.4911.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZW88拟南芥sp|Q9ZW88|FBL34_ARATH F-box/LRR-repeat protein At1g6719078.400%Swiss-Prot高置信

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