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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G053450
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 13690680-13693828 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1932 bp · TkA08G053450|TK1151|cDNA

CCTAATAAAGTCAACAAATGAGTTCGACTGACTATATATAAACCTCACAAATCAAGCTTCAGATAAAGTCATAAAACTCTTAAACCATGGCTGAACATTTCATTTTGCATTCGGCTCTTCTCCTATCTATATTTACATTTTCTGTTTCGGGTCAAGTGTTTTGGAGCGTAAATTGTGGGGAATCCGAAACGTACATTGATAGTAACCAAATTACTTGGACACCTGACGCAACCTTAGTCTCAAATGGGGTTGCTCGAGTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1743 bp · TkA08G053450|TK1151|CDS

ATGGCTGAACATTTCATTTTGCATTCGGCTCTTCTCCTATCTATATTTACATTTTCTGTTTCGGGTCAAGTGTTTTGGAGCGTAAATTGTGGGGAATCCGAAACGTACATTGATAGTAACCAAATTACTTGGACACCTGACGCAACCTTAGTCTCAAATGGGGTTGCTCGAGTGGTCCAGTCAAGTAACCAAATATCTACTGTTCTAGACTCTCTCAGAGTTTTCACTAGTCGAAATAAGAATTGTTACTCTACCCCAGT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

580 aa · TkA08G053450|TK1151|PROTEIN

MAEHFILHSALLLSIFTFSVSGQVFWSVNCGESETYIDSNQITWTPDATLVSNGVARVVQSSNQISTVLDSLRVFTSRNKNCYSTPVTKGEKVLVRAIFNYGNYDRLSSPPTFDLHFDGNFWTTVETSNEGFNMYEVTYVTRGDVVSVCVAQTKSGQFPFMSTLEVRSVDSNVYSEVDADRALFLINRWSYGASGILRFPQDPYDRIWRPISDITNVTNDAILVDPTGANNPPAEIFDNAATENNRSDSLYLATIAPGDT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G053450
TK1151 IDTkA08G053450
OH-1004 IDLXL04_017737
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G053450
位置Chr08:13690680-13693828 (-)
描述Similar to At2g19210: Putative leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At2g19210
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g24485 未表征蛋白At1g24485。 暂无已核实直接文献
At2g19190 参与植物的先天免疫反应。 暂无已核实直接文献
At1g67720 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g67720。 暂无已核实直接文献
At5g48740 可能的LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At5g48740。 暂无已核实直接文献
At3g08680 可能的非活性受体激酶 At3g08680。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017737 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009617 response to bacterium 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G51820
ath:AT2G19190
ath:AT2G19210
ath:AT2G19230
ath:AT5G59650
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.616
排名 1 · TkA08G053450 · TK1151
细胞外0.191
排名 2 · TkA08G053450 · TK1151
内质网0.105
排名 3 · TkA08G053450 · TK1151
细胞质0.087
排名 4 · TkA08G053450 · TK1151
溶酶体／液泡0.044
排名 5 · TkA08G053450 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12819Malectin_like28-344 aa
PF00560LRR_137-46 aa
PF00560LRR_161-70 aa
PF12799LRR_462-70 aa
PF15102TMEM154258-295 aa
PF12799LRR_4397-432 aa
PF00560LRR_1399-415 aa
PF00560LRR_1422-442 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G053450PF12819Malectin_like283446.8e-70236.7
TkA08G053450PF00560LRR_137463.6e-0626.7
TkA08G053450PF00560LRR_161703.6e-0626.7
TkA08G053450PF12799LRR_462700.001219.7
TkA08G053450PF15102TMEM1542582950.1312.8
TkA08G053450PF12799LRR_43974320.001219.7
TkA08G053450PF00560LRR_13994153.6e-0626.7
TkA08G053450PF00560LRR_14224423.6e-0626.7
TkA08G053450PF13855LRR_84234770.0007220.0
TkA08G053450PF12799LRR_44234570.001219.7
TkA08G053450PF00560LRR_14454653.6e-0626.7
TkA08G053450PF15102TMEM1544745440.1312.8
TkA08G053450PF17870Insulin_TMD5065370.0813.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
A5PHT0拟南芥sp|A5PHT0|Y1448_ARATH Uncharacterized protein At1g2448535.700%Swiss-Prot中等置信
O64483拟南芥sp|O64483|SIRK_ARATH Senescence-induced receptor-like serine/threonine-protein kinase32.600%Swiss-Prot中等置信
C0LGI2拟南芥sp|C0LGI2|Y1677_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g6772031.000%Swiss-Prot中等置信
C0LGV0拟南芥sp|C0LGV0|Y5487_ARATH Probable LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase At5g4874030.200%Swiss-Prot中等置信
Q9C9Y8拟南芥sp|Q9C9Y8|Y3868_ARATH Probable inactive receptor kinase At3g0868038.600%Swiss-Prot低置信

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