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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G042920
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 10965707-10967712 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

711 bp · TkA08G042920|TK1151|cDNA

ATGCATGTGTCCAATAATCTCCAAAATACCTGCAAATCTTATGCAAAATGGCAAATAAACGTTGCCACCACAACTGGTCAAGATAGCTGGAAGTTTGCTTCTGCTCTTATGGGCATTTATATAAGAGGATCTATAAATTATATTGCGGTTTCAGAAGCACTTGGTGTTTCTCCATCTGTGGTAGCAGCAAGATTGAACTTCAATGATATGACTGCAATCCCATGGTCTTTACTAGGGTGCTTGGGACTGATGAACAAGTA...

CDS

下载 CDS FASTA

711 bp · TkA08G042920|TK1151|CDS

ATGCATGTGTCCAATAATCTCCAAAATACCTGCAAATCTTATGCAAAATGGCAAATAAACGTTGCCACCACAACTGGTCAAGATAGCTGGAAGTTTGCTTCTGCTCTTATGGGCATTTATATAAGAGGATCTATAAATTATATTGCGGTTTCAGAAGCACTTGGTGTTTCTCCATCTGTGGTAGCAGCAAGATTGAACTTCAATGATATGACTGCAATCCCATGGTCTTTACTAGGGTGCTTGGGACTGATGAACAAGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

236 aa · TkA08G042920|TK1151|PROTEIN

MHVSNNLQNTCKSYAKWQINVATTTGQDSWKFASALMGIYIRGSINYIAVSEALGVSPSVVAARLNFNDMTAIPWSLLGCLGLMNKYQLELEPQLEALVGRHSRKPWSKFMNTDNQHLVSPEAIDFLNKLLCYDNQDRLTTKEAMGHPYFMQVRAAENNRMRTQYKFCETIQAKINFRWCGKNENSVSRRKLRGKSLGTSFPRGVFLGDHFRGKSLGNVTFLRISYENGPRKPLIF

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G042920
TK1151 IDTkA08G042920
OH-1004 IDLXL04_017891
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)89.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 92.373 / OH-1004 82.270
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G042920
位置Chr08:10965707-10967712 (-)
描述Similar to CKA1: Casein kinase II subunit alpha-1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g67380 酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。
Cloning and characterization of two cDNAs encoding casein kinase II catalytic subunits in Arabidopsis thaliana.1993 · DOI: 10.1007/bf00019944
Reconstitution of Arabidopsis casein kinase II from recombinant subunits and phosphorylation of transcription factor GBF1.1995 · DOI: 10.1105/tpc.7.1.105
At3g50000 酪蛋白激酶通过优先利用酸性蛋白如酪蛋白作为底物来操作定义（通过相似性）。 暂无已核实直接文献
At2g23080 酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: Q9AR27 酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。 暂无已核实直接文献
UniProt: B6F107 酪蛋白激酶在操作上通过其优先利用酸性蛋白（例如酪蛋白）作为底物来定义。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017891 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006281 DNA repair 生物过程
GO:0006325 chromatin organization 生物过程
GO:0006468 protein phosphorylation 生物过程
GO:0006974 DNA damage response 生物过程
GO:0007623 circadian rhythm 生物过程
GO:0009648 photoperiodism 生物过程
GO:0009908 flower development 生物过程
GO:0010225 response to UV-C 生物过程
GO:0010229 inflorescence development 生物过程
GO:0010332 response to gamma radiation 生物过程
GO:0042752 regulation of circadian rhythm 生物过程
GO:0051726 regulation of cell cycle 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G23080
ath:AT3G50000
ath:AT5G67380
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.303
排名 1 · TkA08G042920 · TK1151
细胞核0.222
排名 2 · TkA08G042920 · TK1151
线粒体0.212
排名 3 · TkA08G042920 · TK1151
内质网0.149
排名 4 · TkA08G042920 · TK1151
细胞膜0.139
排名 5 · TkA08G042920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF05684DUF81925-68 aa
PF13412HTH_2443-66 aa
PF00069Pkinase112-150 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G042920PF05684DUF81925685.2e-0936.3
TkA08G042920PF13412HTH_2443660.1612.3
TkA08G042920PF00069Pkinase1121507.1e-0626.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q08467拟南芥sp|Q08467|CSK21_ARATH Casein kinase II subunit alpha-182.700%Swiss-Prot低置信
Q08466拟南芥sp|Q08466|CSK22_ARATH Casein kinase II subunit alpha-281.500%Swiss-Prot低置信
O64817拟南芥sp|O64817|CSK23_ARATH Casein kinase II subunit alpha-377.800%Swiss-Prot低置信
Q9AR27水稻sp|Q9AR27|HD6_ORYSI Casein kinase II subunit alpha-279.000%Swiss-Prot低置信
B6F107水稻sp|B6F107|HD6_ORYSJ Casein kinase II subunit alpha-279.000%Swiss-Prot低置信

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