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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G042170
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 10757297-10759817 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2222 bp · TkA08G042170|TK1151|cDNA

ATTAATCAGAAGATCTCCATTTCACACACATATTCTCTCTCCTCGCTCCCTATGCGAATCTTCAACGAGAAGCGTGTGTTTCACCATCGCGTAAAGGCAGTATGTGTGGCGTAAATCTCAGTCACCAAGCACCTTCCGCCTCCGTCTATATATACGCACTCACCCAAATTCCCTACTTCTCAGTTACCCACATGTGATACCCTAAAAAGCTGAGGGGAATTTTAGAGACGAAGTGAAAGGGTAATGGGGAATTACAGGGT...

CDS

下载 CDS FASTA

1782 bp · TkA08G042170|TK1151|CDS

ATGGGGAATTACAGGGTATGTTGGTGTTTCACTAGGAAGTTCAAAGTATCGGAAGCAGAGCCGCCGATTGACGTGAAAGAAGCGTTTAAGAAGTACTCCGACGATGGGATCCACATGACGCCGGATCAGCTCCGGCGGTTTTTGGAGGAATCTCAGGGCGACGATCAACACGATGGCTCGAGTTCGGAAGCTGAGCGGATTGTAGAGCAGATACTTCACAAACGGCATCATCTTCCCAAGTTTATGAACAGGAAGGCTCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

593 aa · TkA08G042170|TK1151|PROTEIN

MGNYRVCWCFTRKFKVSEAEPPIDVKEAFKKYSDDGIHMTPDQLRRFLEESQGDDQHDGSSSEAERIVEQILHKRHHLPKFMNRKALSLEDFHHFLFSVDLNPPIKSQVHHDMTAPLSHYFIYTGHNSYLTGNQLSSNCSEIPIIKALKRGVRAIELDLWPNSSKNKVRVLHGRTLTSPVDLMRCLKAIKDYAFTASPYPVIITLEDHLTPDLQAKVAQMITETFGSMLYLPESENLEELPTPESLKYRILISTKPPKEY...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G042170
TK1151 IDTkA08G042170
OH-1004 IDLXL04_017897
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.325 / OH-1004 50.776
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G042170
位置Chr08:10757297-10759817 (-)
描述Similar to PLC4: Phosphoinositide phospholipase C 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g58700 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At2g40116 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At3g08510 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。
N-terminal EF-hand-like domain is required for phosphoinositide-specific phospholipase C activity in Arabidopsis thaliana.2001 · DOI: 10.1016/s0014-5793(01)02453-x
At3g55940 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献
At5g58690 活化的磷脂酰肌醇特异性磷脂酶C介导第二信使分子二酰甘油（DAG）和肌醇1,4,5-三磷酸（IP3）的产生。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017897 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009556 microsporogenesis 生物过程
GO:0010601 positive regulation of auxin biosynthetic process 生物过程
GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0048015 phosphatidylinositol-mediated signaling 生物过程
GO:0048437 floral organ development 生物过程
GO:0051209 release of sequestered calcium ion into cytosol 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G40116
ath:AT3G08510
ath:AT5G58700
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.489
排名 1 · TkA08G042170 · TK1151
细胞质0.417
排名 2 · TkA08G042170 · TK1151
细胞核0.231
排名 3 · TkA08G042170 · TK1151
内质网0.061
排名 4 · TkA08G042170 · TK1151
高尔基体0.052
排名 5 · TkA08G042170 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF09279EF-hand_like24-100 aa
PF23617EF-hand_1526-62 aa
PF06156YabA37-78 aa
PF00388PI-PLC-X113-255 aa
PF06156YabA346-398 aa
PF00387PI-PLC-Y354-443 aa
PF00168C2465-566 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G042170PF09279EF-hand_like241007.2e-0523.9
TkA08G042170PF23617EF-hand_1526620.02315.5
TkA08G042170PF06156YabA37780.2612.6
TkA08G042170PF00388PI-PLC-X1132552.4e-55186.8
TkA08G042170PF06156YabA3463980.2612.6
TkA08G042170PF00387PI-PLC-Y3544433.2e-29102.2
TkA08G042170PF00168C24655664.8e-1556.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q944C1拟南芥sp|Q944C1|PLCD4_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 459.800%Swiss-Prot高置信
Q8GV43拟南芥sp|Q8GV43|PLCD6_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 659.200%Swiss-Prot高置信
Q39033拟南芥sp|Q39033|PLCD2_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 256.000%Swiss-Prot高置信
Q9LY51拟南芥sp|Q9LY51|PLCD7_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 755.800%Swiss-Prot高置信
Q944C2拟南芥sp|Q944C2|PLCD5_ARATH Phosphoinositide phospholipase C 557.500%Swiss-Prot高置信

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