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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G036020
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 9182913-9186524 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

717 bp · TkA08G036020|TK1151|cDNA

ATGGTTGCCATTGATTTTACCGCTTCAAATGGATGTCCTCGAAGGCCAGATTCTTTGCATTATATTGATCCTTCTGGCCGATTAAACGCATACCAGCAAGCTATAATGGATGTTGGAGAAGTGTTACAATTTTATGATTCTGATAAAATGTTTCCCGCTTGGGGTTTTGGTGGAAGAATGTATAACGGCCCTGTTTCCCATTGTTTCAACCTCAATGGAAGCACTGGTAGCTTTGAGGTTGAAGGAATCCAAGGAATAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

717 bp · TkA08G036020|TK1151|CDS

ATGGTTGCCATTGATTTTACCGCTTCAAATGGATGTCCTCGAAGGCCAGATTCTTTGCATTATATTGATCCTTCTGGCCGATTAAACGCATACCAGCAAGCTATAATGGATGTTGGAGAAGTGTTACAATTTTATGATTCTGATAAAATGTTTCCCGCTTGGGGTTTTGGTGGAAGAATGTATAACGGCCCTGTTTCCCATTGTTTCAACCTCAATGGAAGCACTGGTAGCTTTGAGGTTGAAGGAATCCAAGGAATAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

238 aa · TkA08G036020|TK1151|PROTEIN

MVAIDFTASNGCPRRPDSLHYIDPSGRLNAYQQAIMDVGEVLQFYDSDKMFPAWGFGGRMYNGPVSHCFNLNGSTGSFEVEGIQGIMAAYENALHTLILDGPTLFGHVVNQAADLAAQSQSQNSSKYFVLLIITGGALTDLQETKDALVRASDLPLSILIVGVDEADFTVMEVLDANIGQRLESSTGRIATRDIVRFVCIRDVHRGEMSMVQGLLEELPGQFLTYMRNKDVRPHNLIL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G036020
TK1151 IDTkA08G036020
OH-1004 IDLXL04_007473
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)88.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.319 / OH-1004 32.545
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G036020
位置Chr08:9182913-9186524 (-)
描述Similar to BON3: Protein BONZAI 3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g61900 细胞死亡和防御反应的负调节因子。
A haplotype-specific Resistance gene regulated by BONZAI1 mediates temperature-dependent growth control in Arabidopsis.2004 · DOI: 10.1105/tpc.020479
The BON/CPN gene family represses cell death and promotes cell growth in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02585.x
Evidence that the BONZAI1/COPINE1 protein is a calcium- and pathogen-responsive defense suppressor.2009 · DOI: 10.1007/s11103-008-9413-6
Multiple R-like genes are negatively regulated by BON1 and BON3 in arabidopsis.2009 · DOI: 10.1094/mpmi-22-7-0840
Requirement of calcium binding, myristoylation, and protein-protein interaction for the Copine BON1 function in Arabidopsis.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m109.066100
At1g08860 细胞死亡和防御反应的负调节因子。
The BON/CPN gene family represses cell death and promotes cell growth in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02585.x
Multiple R-like genes are negatively regulated by BON1 and BON3 in arabidopsis.2009 · DOI: 10.1094/mpmi-22-7-0840
At5g07300 细胞死亡和防御反应的负调节因子。
The BON/CPN gene family represses cell death and promotes cell growth in Arabidopsis.2006 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2005.02585.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_007473 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006508 proteolysis 生物过程
GO:0006629 lipid metabolic process 生物过程
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0009266 response to temperature stimulus 生物过程
GO:0009270 response to humidity 生物过程
GO:0010629 negative regulation of gene expression 生物过程
GO:0016192 vesicle-mediated transport 生物过程
GO:0019725 cellular homeostasis 生物过程
GO:0030335 positive regulation of cell migration 生物过程
GO:0038128 ERBB2 signaling pathway 生物过程
GO:0043069 negative regulation of programmed cell death 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G08860
ath:AT5G07300
ath:AT5G61900
hsa:8895
hsa:8904
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.535
排名 1 · TkA08G036020 · TK1151
细胞核0.415
排名 2 · TkA08G036020 · TK1151
细胞膜0.221
排名 3 · TkA08G036020 · TK1151
内质网0.059
排名 4 · TkA08G036020 · TK1151
线粒体0.053
排名 5 · TkA08G036020 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07002Copine18-233 aa
PF10138vWA-TerF-like108-183 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G036020PF07002Copine182335.9e-73245.7
TkA08G036020PF10138vWA-TerF-like1081830.0002821.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q941L3拟南芥sp|Q941L3|BON1_ARATH Protein BONZAI 172.100%Swiss-Prot高置信
Q5XQC7拟南芥sp|Q5XQC7|BON3_ARATH Protein BONZAI 370.000%Swiss-Prot高置信
Q5S1W2拟南芥sp|Q5S1W2|BON2_ARATH Protein BONZAI 268.200%Swiss-Prot高置信

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