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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G034990
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 8952892-8954847 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

766 bp · TkA08G034990|TK1151|cDNA

GTCGGTTCATTTTTCAAACAGATCTCACTTTGACGGCCGAAGTTCAACCAGCAATCGGAATCGCTGCAAAACCAGTTCCGAAAATGGCCAGATCCGCTGCCGTACCTTTCATTTTCACGATCCTGCTAACGATCGGCGCCTTCTATATGTCCAATGCAGAAGCATCATCCGCCGATTTCGTGAAGAAGACCGTCTCCTCTCACCCCATAGTCATCTTCTCCAAATCATACTGCCCATACTGTAAAAGGGCTAAAGGTATA...

CDS

下载 CDS FASTA

402 bp · TkA08G034990|TK1151|CDS

ATGGCCAGATCCGCTGCCGTACCTTTCATTTTCACGATCCTGCTAACGATCGGCGCCTTCTATATGTCCAATGCAGAAGCATCATCCGCCGATTTCGTGAAGAAGACCGTCTCCTCTCACCCCATAGTCATCTTCTCCAAATCATACTGCCCATACTGTAAAAGGGCTAAAGGTATATTCAACGAGTTGAATCAGAAACCTTATGTTGTTGAGTTGGATCAGAGAGAGGATGGAGCGAATATTCAGAATGCTATGGGCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

133 aa · TkA08G034990|TK1151|PROTEIN

MARSAAVPFIFTILLTIGAFYMSNAEASSADFVKKTVSSHPIVIFSKSYCPYCKRAKGIFNELNQKPYVVELDQREDGANIQNAMGEFVGKRTVPQVFVNGKHLGGSDDTMEAYESGELAKLLGISSSYETEL

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G034990
TK1151 IDTkA08G034990
OH-1004 IDLXL04_017986
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 53.200
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G034990
位置Chr08:8952892-8954847 (-)
描述Similar to GRXC4: Glutaredoxin-C4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g20500 在 NADPH 和谷胱甘肽还原酶存在的情况下具有谷胱甘肽二硫化物氧化还原酶活性。 暂无已核实直接文献
At1g77370 在 NADPH 和谷胱甘肽还原酶存在的情况下具有谷胱甘肽二硫化物氧化还原酶活性。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os06g0659500 在 NADPH 和谷胱甘肽还原酶存在的情况下具有谷胱甘肽二硫化物氧化还原酶活性。 暂无已核实直接文献
Os02g0646400 可能仅还原 GSH-硫醇二硫键，但不还原蛋白二硫键。 暂无已核实直接文献
Os04g0508300 在 NADPH 和谷胱甘肽还原酶存在的情况下具有谷胱甘肽二硫化物氧化还原酶活性。
Cloning and sequence analysis of a cDNA encoding rice glutaredoxin.1994 · DOI: 10.1016/0014-5793(94)80264-5
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_017986 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0034599 cellular response to oxidative stress 生物过程
GO:0000137 Golgi cis cisterna 细胞组分
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009536 plastid 细胞组分
GO:0099503 secretory vesicle 细胞组分
GO:0015038 glutathione disulfide oxidoreductase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G77370
ath:AT5G20500
dosa:Os02g0646400
dosa:Os04g0508300
dosa:Os06g0659500
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

溶酶体／液泡0.495
排名 1 · TkA08G034990 · TK1151
高尔基体0.164
排名 2 · TkA08G034990 · TK1151
内质网0.159
排名 3 · TkA08G034990 · TK1151
细胞外0.137
排名 4 · TkA08G034990 · TK1151
细胞质0.137
排名 5 · TkA08G034990 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF26981Thioredoxin-like_PDI17-72 aa
PF13728TraF25-66 aa
PF00085Thioredoxin33-68 aa
PF13462Thioredoxin_438-65 aa
PF00462Glutaredoxin42-103 aa
PF05768Glrx-like42-75 aa
PF01323DSBA42-73 aa
PF13098Thioredoxin_242-69 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G034990PF26981Thioredoxin-like_PDI17720.006917.0
TkA08G034990PF13728TraF25660.03414.7
TkA08G034990PF00085Thioredoxin33680.03914.7
TkA08G034990PF13462Thioredoxin_438650.1213.3
TkA08G034990PF00462Glutaredoxin421031e-1971.2
TkA08G034990PF05768Glrx-like42750.02215.8
TkA08G034990PF01323DSBA42730.02215.3
TkA08G034990PF13098Thioredoxin_242690.03515.1
TkA08G034990PF13192Thioredoxin_3431030.01416.1
TkA08G034990PF13417GST_N_3471090.0008120.4
TkA08G034990PF13409GST_N_2491150.0002922.1
TkA08G034990PF13462Thioredoxin_4821080.1213.3
TkA08G034990PF01323DSBA941090.02215.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LFQ6拟南芥sp|Q8LFQ6|GRXC4_ARATH Glutaredoxin-C466.200%Swiss-Prot高置信
Q9FVX1拟南芥sp|Q9FVX1|GRXC3_ARATH Glutaredoxin-C362.500%Swiss-Prot高置信
Q0DAE4水稻sp|Q0DAE4|GRXC8_ORYSJ Glutaredoxin-C869.500%Swiss-Prot高置信
Q6H628水稻sp|Q6H628|GRXS6_ORYSJ Monothiol glutaredoxin-S652.000%Swiss-Prot高置信
P55142水稻sp|P55142|GRXC6_ORYSJ Glutaredoxin-C648.000%Swiss-Prot中等置信

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