本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA08G029980
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 7685321-7688941 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1946 bp · TkA08G029980|TK1151|cDNA

AGAGAGAGAGATAATCAATAATGGAATCGCCGGGGCCGCGGCTGGAGACGGCGGTGACTAAAGTTGCCGTAAGGTCGTCCGTGATAGAGTCGCTCAAGGGGTGGTCGTTATCTGGGGTACAGATTCGTAAAGAGGAGCTGAGACGGAAAATTACGATGCCGGAATATTTACGGCTCTCTATCAAAGACGCCATTGCATCAAAAGATATTGATGCCGGAAAACTCCATTACGAACGCAGTACCACCGGTGATGATAAACCG...

1221 bp · TkA08G029980|TK1151|CDS

ATGGAATCGCCGGGGCCGCGGCTGGAGACGGCGGTGACTAAAGTTGCCGTAAGGTCGTCCGTGATAGAGTCGCTCAAGGGGTGGTCGTTATCTGGGGTACAGATTCGTAAAGAGGAGCTGAGACGGAAAATTACGATGCCGGAATATTTACGGCTCTCTATCAAAGACGCCATTGCATCAAAAGATATTGATGCCGGAAAACTCCATTACGAACGCAGTACCACCGGTGATGATAAACCGGTTCAAGTTGCCCCTGAATC...

406 aa · TkA08G029980|TK1151|PROTEIN

MESPGPRLETAVTKVAVRSSVIESLKGWSLSGVQIRKEELRRKITMPEYLRLSIKDAIASKDIDAGKLHYERSTTGDDKPVQVAPESPLIVFINSKSGGRYGPELMARLQDLMGEEQVIDLLSVKPQEFINYGLGCLEKLASIGDMCAKETREKLRIVVAGGDGTVGWVLGCLGELHKAGRDPVPPTAVVPLGTGNDLSRSFGWGGSFPFSWKAAIKKTLDKATRAPTSRLDSWNLVISMPAGADLDNPYSLKRTEEVVL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G029980
TK1151 IDTkA08G029980
OH-1004 IDLXL04_018062
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)98.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 98.768 / OH-1004 82.680
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G029980
位置Chr08:7685321-7688941 (+)
描述Similar to DGK4: Diacylglycerol kinase 4
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g57690 对第二信使二酰甘油(DAG)进行磷酸化生成磷脂酸(PA),另一种重要的信号分子。
At4g30340 磷酸化第二信使二酰甘油 ,生成另一种重要的信号分子磷脂酸。
At2g18730 对第二信使二酰甘油(DAG)进行磷酸化生成磷脂酸(PA),另一种重要的信号分子。 暂无已核实直接文献
At4g28130 对第二信使二酰甘油(DAG)进行磷酸化生成磷脂酸(PA),另一种重要的信号分子。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0634700 对第二信使二酰甘油(DAG)进行磷酸化生成磷脂酸(PA),另一种重要的信号分子。
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_018062 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006952 defense response 生物过程
GO:0007200 phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0046486 glycerolipid metabolic process 生物过程
GO:0048364 root development 生物过程
GO:0048366 leaf development 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004143 ATP-dependent diacylglycerol kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G18730
ath:AT2G20900
ath:AT4G30340
ath:AT5G57690
dosa:Os04g0634700
osa:4337126
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

线粒体0.325
排名 1 · TkA08G029980 · TK1151
细胞质0.288
排名 2 · TkA08G029980 · TK1151
内质网0.280
排名 3 · TkA08G029980 · TK1151
细胞膜0.196
排名 4 · TkA08G029980 · TK1151
细胞核0.142
排名 5 · TkA08G029980 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00609DAGK_acc49-99 aa
PF00781DAGK_cat89-222 aa
PF00609DAGK_acc280-391 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G029980PF00609DAGK_acc49991.6e-2591.0
TkA08G029980PF00781DAGK_cat892224e-2278.8
TkA08G029980PF00609DAGK_acc2803911.6e-2591.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q1PDI2拟南芥sp|Q1PDI2|DGK4_ARATH Diacylglycerol kinase 462.900%Swiss-Prot高置信
F4JQ95拟南芥sp|F4JQ95|DGK7_ARATH Diacylglycerol kinase 762.500%Swiss-Prot高置信
Q8VZG1拟南芥sp|Q8VZG1|DGK3_ARATH Diacylglycerol kinase 358.900%Swiss-Prot高置信
F4JKI3拟南芥sp|F4JKI3|DGK6_ARATH Diacylglycerol kinase 637.500%Swiss-Prot中等置信
Q7XQT2水稻sp|Q7XQT2|DGK1_ORYSJ Diacylglycerol kinase 138.000%Swiss-Prot中等置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看