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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA08G023140
当前版本: TK1151 染色体: Chr08 坐标: 5858900-5862721 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2379 bp · TkA08G023140|TK1151|cDNA

GCCGCACAGAGAGCATTTCTAGATAGCTAGAGAGAAAGTCGACTAGAGACCGAAAGAGAACATCGACGAGAGACCGAAAGAGAATATCGACGATTAAAGATGTCTGGCTGGGATGAAGGTGCGATATTCTACAGCGACCAAGCACAGTTCCCTCACGGCGCCGGCGCCGACCCTGAACAGGCGTCGAACCGGCACACGGTGCTCAGAAAGTTCAAAGAGTTCATCCGAAACTTCGCTCGTCAAAATGAGCCCAACGTCTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2199 bp · TkA08G023140|TK1151|CDS

ATGTCTGGCTGGGATGAAGGTGCGATATTCTACAGCGACCAAGCACAGTTCCCTCACGGCGCCGGCGCCGACCCTGAACAGGCGTCGAACCGGCACACGGTGCTCAGAAAGTTCAAAGAGTTCATCCGAAACTTCGCTCGTCAAAATGAGCCCAACGTCTTCCCTTACAGAGAAAGCCTGGTTCAAAATCCCAAGTTTCTCCTCGTTAATATGTCCGATCTTCTTACCTACGACAAAGATCAAGATCTTCGAGATTTGCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

732 aa · TkA08G023140|TK1151|PROTEIN

MSGWDEGAIFYSDQAQFPHGAGADPEQASNRHTVLRKFKEFIRNFARQNEPNVFPYRESLVQNPKFLLVNMSDLLTYDKDQDLRDLLRKNPSDYLPLFETAAAEVNANLKARVAGETGEMEEPHTGEVQILLNSDEDPVSMRSLGAQYISKLVKISGITIAASRTKAKATYVTLLCKNCKNVKVVPCRPGLGGAIVPRSCDHVAQMGETPCPIDPWLVVPDRSKYVDQQTLKLQENPEDVPTGELPRNMLLSVDRHLVQT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA08G023140
TK1151 IDTkA08G023140
OH-1004 IDLXL04_018158
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA08G023140
位置Chr08:5858900-5862721 (+)
描述Similar to MCM5: DNA replication licensing factor MCM5
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g07690 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os02g0797400 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
UniProt: B8AEH3 MCM2-7 复合物（MCM 复合物）的可能组成部分，可充当 DNA 解旋酶，对于真核细胞中每个细胞周期进行单轮复制起始和延伸至关重要。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018158 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000727 double-strand break repair via break-induced replication 生物过程
GO:0006270 DNA replication initiation 生物过程
GO:0006279 premeiotic DNA replication 生物过程
GO:0030174 regulation of DNA-templated DNA replication initiation 生物过程
GO:0044786 cell cycle DNA replication 生物过程
GO:0000347 THO complex 细胞组分
GO:0000785 chromatin 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0042555 MCM complex 细胞组分
GO:0071162 CMG complex 细胞组分
GO:0003678 DNA helicase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G07690
dosa:Os02g0797400
xla:380587
xtr:550081
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.819
排名 1 · TkA08G023140 · TK1151
细胞质0.248
排名 2 · TkA08G023140 · TK1151
线粒体0.035
排名 3 · TkA08G023140 · TK1151
细胞膜0.025
排名 4 · TkA08G023140 · TK1151
内质网0.012
排名 5 · TkA08G023140 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14551MCM_N36-132 aa
PF17207MCM_OB141-276 aa
PF00493MCM319-541 aa
PF01078Mg_chelatase372-394 aa
PF00158Sigma54_activat374-396 aa
PF07728AAA_5376-498 aa
PF07726AAA_3413-491 aa
PF01078Mg_chelatase430-500 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA08G023140PF14551MCM_N361328.7e-1246.0
TkA08G023140PF17207MCM_OB1412763.1e-33114.9
TkA08G023140PF00493MCM3195411.2e-102342.5
TkA08G023140PF01078Mg_chelatase3723942e-0524.8
TkA08G023140PF00158Sigma54_activat3743960.1912.1
TkA08G023140PF07728AAA_53764983.9e-0524.4
TkA08G023140PF07726AAA_34134910.0003621.2
TkA08G023140PF01078Mg_chelatase4305002e-0524.8
TkA08G023140PF00158Sigma54_activat4324890.1912.1
TkA08G023140PF13335Mg_chelatase_C4474680.6311.4
TkA08G023140PF17855MCM_lid5586472.9e-2795.7
TkA08G023140PF13335Mg_chelatase_C5666420.6311.4
TkA08G023140PF13335Mg_chelatase_C6656890.6311.4
TkA08G023140PF21933MCM5_C6727308e-1968.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80786拟南芥sp|O80786|MCM5_ARATH DNA replication licensing factor MCM577.400%Swiss-Prot高置信
Q6KAJ4水稻sp|Q6KAJ4|MCM5_ORYSJ DNA replication licensing factor MCM574.600%Swiss-Prot高置信
B8AEH3水稻sp|B8AEH3|MCM5_ORYSI DNA replication licensing factor MCM574.500%Swiss-Prot高置信

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