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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G445150
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 112923083-112933246 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1608 bp · TkA07G445150|TK1151|cDNA

TTTTATTTTGTTGCATATTTGAAATAGTAATCGAGTTCGTCCCTTTTGAATCCCTCCAAGCAAGCAACTATGAACATTCAGTCTAATCGGGAAAGAAAAATGTCCGAAACGATTTCAGCAAGCACGGCCGCAAATTCTACAGCAGCCGGCGCCGATGATTACTTCCGGCCGTCGTCCATCATGAAGCTTCCGATCACAGATATCGGCGACTCCTCCACCTCATCCTCGTCAAATACTTACGTAACCCAGGCATTCCCGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1440 bp · TkA07G445150|TK1151|CDS

ATGAACATTCAGTCTAATCGGGAAAGAAAAATGTCCGAAACGATTTCAGCAAGCACGGCCGCAAATTCTACAGCAGCCGGCGCCGATGATTACTTCCGGCCGTCGTCCATCATGAAGCTTCCGATCACAGATATCGGCGACTCCTCCACCTCATCCTCGTCAAATACTTACGTAACCCAGGCATTCCCGTTCTCTTCTGGAAACCCTAGAATCGAAGAGACGAGAGGCGTCATGCATCTCTTTCTGGACGACGCTGCTTC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

479 aa · TkA07G445150|TK1151|PROTEIN

MNIQSNRERKMSETISASTAANSTAAGADDYFRPSSIMKLPITDIGDSSTSSSSNTYVTQAFPFSSGNPRIEETRGVMHLFLDDAASSSSNLPVGRIPLICVLGVPNHMTYADFCQFCGSFIHHIMEMRIVRNDGMENWYSILVRFDEQSSTDSFHKHFNGRRFSSLETESCRVLFTVDVQYTSTIEHTRTSPASTEQPSCPVCLERLDQDMSGILTTICNHSFHCSCISKWTDSSCPVCRYCQQQPEKSKCLICQTSEN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G445150
TK1151 IDTkA07G445150
OH-1004 IDLXL04_018237
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)45.300
蛋白覆盖度 (%)TK1151 82.463 / OH-1004 80.404
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G445150
位置Chr07:112923083-112933246 (+)
描述Similar to BRIZ1: BRAP2 RING ZnF UBP domain-containing protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At2g26000 RING型泛素E3连接酶，可结合泛素，是种子萌发和萌发后生长所必需的。
BRIZ1 and BRIZ2 proteins form a heteromeric E3 ligase complex required for seed germination and post-germination growth in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m110.168021
At2g42160 种子萌发和萌发后生长所需的环型泛素 E3 连接酶。
BRIZ1 and BRIZ2 proteins form a heteromeric E3 ligase complex required for seed germination and post-germination growth in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1074/jbc.m110.168021

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_018237 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000165 MAPK cascade 生物过程
GO:0007265 Ras protein signal transduction 生物过程
GO:0009968 negative regulation of signal transduction 生物过程
GO:0010029 regulation of seed germination 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0023051 regulation of signaling 生物过程
GO:0000151 ubiquitin ligase complex 细胞组分
GO:0005654 nucleoplasm 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0031965 nuclear membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G26000
ath:AT2G42160
hsa:8315
mmu:72399
spo:2542333
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.646
排名 1 · TkA07G445150 · TK1151
细胞核0.359
排名 2 · TkA07G445150 · TK1151
溶酶体／液泡0.075
排名 3 · TkA07G445150 · TK1151
高尔基体0.070
排名 4 · TkA07G445150 · TK1151
细胞膜0.044
排名 5 · TkA07G445150 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF07576BRAP292-189 aa
PF13639zf-RING_2112-123 aa
PF00097zf-C3HC4114-118 aa
PF13923zf-C3HC4_2114-119 aa
PF13920zf-C3HC4_3114-122 aa
PF13920zf-C3HC4_3198-241 aa
PF13639zf-RING_2200-241 aa
PF12678zf-rbx1200-241 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G445150PF07576BRAP2921897.9e-37126.1
TkA07G445150PF13639zf-RING_21121232.1e-0835.0
TkA07G445150PF00097zf-C3HC41141183.7e-0524.2
TkA07G445150PF13923zf-C3HC4_21141194.2e-0524.0
TkA07G445150PF13920zf-C3HC4_31141220.1812.4
TkA07G445150PF13920zf-C3HC4_31982410.1812.4
TkA07G445150PF13639zf-RING_22002412.1e-0835.0
TkA07G445150PF12678zf-rbx12002411.4e-0629.1
TkA07G445150PF12861zf-ANAPC112002421.69.5
TkA07G445150PF00097zf-C3HC42012403.7e-0524.2
TkA07G445150PF13923zf-C3HC4_22012404.2e-0524.0
TkA07G445150PF17123zf-RING_112012290.003917.6
TkA07G445150PF13445zf-RING_UBOX2012360.00417.8
TkA07G445150PF13920zf-C3HC4_32492710.1812.4
TkA07G445150PF13639zf-RING_22512702.1e-0835.0
TkA07G445150PF13923zf-C3HC4_22512724.2e-0524.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O80996拟南芥sp|O80996|BRIZ2_ARATH BRAP2 RING ZnF UBP domain-containing protein 264.800%Swiss-Prot高置信
E5KGE0拟南芥sp|E5KGE0|BRIZ1_ARATH BRAP2 RING ZnF UBP domain-containing protein 144.500%Swiss-Prot中等置信

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