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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G443810
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 112570504-112572122 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1311 bp · TkA07G443810|TK1151|cDNA

ATAACAACTTATATCAATTTTTTTTTTGTAAACCATATTTGTAAAAATTAAAGAATGGCGATACAAATGGTAGATATAGAAGCTCAATCTTCGATCTTCAACAAAGTCGATCATCCCGTTACATTAAAGTTCCAAGAAGTGGTGTACACCATTAAAACGAAGAAACACGGATGGATACAGAAAAACCACGAGCCTACAGAGAAACATATACTAAAAGGAATAACAGGCATGGTGATACCCGGAGAAATGTTAGCCATGTT...

CDS

下载 CDS FASTA

1257 bp · TkA07G443810|TK1151|CDS

ATGGCGATACAAATGGTAGATATAGAAGCTCAATCTTCGATCTTCAACAAAGTCGATCATCCCGTTACATTAAAGTTCCAAGAAGTGGTGTACACCATTAAAACGAAGAAACACGGATGGATACAGAAAAACCACGAGCCTACAGAGAAACATATACTAAAAGGAATAACAGGCATGGTGATACCCGGAGAAATGTTAGCCATGTTAGGTCCATCCGGTTGTGGAAAAACCACGCTTCTAACCGCGTTAGGTGGGCGCCT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

419 aa · TkA07G443810|TK1151|PROTEIN

MAIQMVDIEAQSSIFNKVDHPVTLKFQEVVYTIKTKKHGWIQKNHEPTEKHILKGITGMVIPGEMLAMLGPSGCGKTTLLTALGGRLGGNLCGTITYNNKPFSSIMKRYTGFVTQDDILYPHLTVTETLVFTALLRLPKHLTALEKTMHAKAVINQLRLTRCKDIVIGGPNLRGVSGGERKRVSIGQEMLINPSLLFLDEPTSGLDSTTAQRIVLTLWELARGGRTIVMTIHQPSSRLFYMFHKVLLLSEGNSLFFGKGS...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G443810
TK1151 IDTkA07G443810
OH-1004 IDLXL04_030991
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 68.464
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G443810
位置Chr07:112570504-112572122 (-)
描述Similar to ABCG9: ABC transporter G family member 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g27420 与 ABCG31 一起参与花粉适应性所需的甾醇糖苷的花粉外衣沉积。
ABCG9, ABCG11 and ABCG14 ABC transporters are required for vascular development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12334
The role of Arabidopsis ABCG9 and ABCG31 ATP binding cassette transporters in pollen fitness and the deposition of steryl glycosides on the pollen coat.2014 · DOI: 10.1105/tpc.113.118935
At1g31770 植物生长的正调节剂，充当外排泵，参与主要的根到芽长距离细胞分裂素通过木质部汁液的运输。
ABCG9, ABCG11 and ABCG14 ABC transporters are required for vascular development in Arabidopsis.2013 · DOI: 10.1111/tpj.12334
Arabidopsis ABCG14 protein controls the acropetal translocation of root-synthesized cytokinins.2014 · DOI: 10.1038/ncomms4274
Arabidopsis ABCG14 is essential for the root-to-shoot translocation of cytokinin.2014 · DOI: 10.1073/pnas.1321519111
Cytokinin Response Factor 6 Represses Cytokinin-Associated Genes during Oxidative Stress.2016 · DOI: 10.1104/pp.16.00415
A Role of Cytokinin Transporter in Arabidopsis Immunity.2017 · DOI: 10.1094/mpmi-01-17-0011-r
At3g25620 ABC 转运蛋白 G 家族成员 21。 暂无已核实直接文献
At5g06530 ABC 转运蛋白 G 家族成员 22。 暂无已核实直接文献
At3g52310 ABC转运蛋白G家族成员27。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030991 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009736 cytokinin-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010115 regulation of abscisic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0010148 transpiration 生物过程
GO:0010184 cytokinin transport 生物过程
GO:0010208 pollen wall assembly 生物过程
GO:0010222 stem vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0010588 cotyledon vascular tissue pattern formation 生物过程
GO:0042542 response to hydrogen peroxide 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:0055085 transmembrane transport 生物过程
GO:0140115 export across plasma membrane 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G31770
ath:AT3G25620
ath:AT4G27420
ath:AT5G06530
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.465
排名 1 · TkA07G443810 · TK1151
内质网0.179
排名 2 · TkA07G443810 · TK1151
细胞质0.177
排名 3 · TkA07G443810 · TK1151
溶酶体／液泡0.166
排名 4 · TkA07G443810 · TK1151
高尔基体0.112
排名 5 · TkA07G443810 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03193RsgA_GTPase49-86 aa
PF13481AAA_2551-83 aa
PF00005ABC_tran53-203 aa
PF09818ABC_ATPase54-83 aa
PF03215Rad1762-91 aa
PF13555AAA_2963-83 aa
PF13671AAA_3365-89 aa
PF02463SMC_N65-84 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G443810PF03193RsgA_GTPase49860.02215.3
TkA07G443810PF13481AAA_2551830.0314.7
TkA07G443810PF00005ABC_tran532033.7e-2589.8
TkA07G443810PF09818ABC_ATPase54830.07212.8
TkA07G443810PF03215Rad1762910.01615.8
TkA07G443810PF13555AAA_2963830.06913.6
TkA07G443810PF13671AAA_3365890.01716.2
TkA07G443810PF02463SMC_N65840.03114.4
TkA07G443810PF13401AAA_2265900.04914.7
TkA07G443810PF05729NACHT66830.5110.9
TkA07G443810PF13304AAA_2167843.7e-0627.8
TkA07G443810PF13521AAA_2867870.2612.2
TkA07G443810PF00004AAA68910.0001922.6
TkA07G443810PF00910RNA_helicase681110.05214.8
TkA07G443810PF13476AAA_2368910.05514.8
TkA07G443810PF13238AAA_1869900.4611.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9SZR9拟南芥sp|Q9SZR9|AB9G_ARATH ABC transporter G family member 964.300%Swiss-Prot高置信
Q9C6W5拟南芥sp|Q9C6W5|AB14G_ARATH ABC transporter G family member 1457.700%Swiss-Prot高置信
Q7XA72拟南芥sp|Q7XA72|AB21G_ARATH ABC transporter G family member 2157.900%Swiss-Prot高置信
Q93YS4拟南芥sp|Q93YS4|AB22G_ARATH ABC transporter G family member 2250.100%Swiss-Prot高置信
Q9FT51拟南芥sp|Q9FT51|AB27G_ARATH ABC transporter G family member 2749.200%Swiss-Prot中等置信

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