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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G441010
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 111721967-111724753 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1812 bp · TkA07G441010|TK1151|cDNA

GTTACTATTGTCCATTTATAATGATTTTTATCAAATATATATTATACTTCATATTATGAATTGTTTACCAAAATTATTTAATTAATAATAAAATATGGGAAGGAGTGAAGGAGTAATAGATTGCGGCACTATAGTATTTAGTCCAAATCAAATAGCTTAAAAGTCAGAAAGCTGCTTTGATCATAGAAGAACCAAAAACCCTTCACGTGATCGATTTTCCTCGATTAGATACTCCAATCCCATTACAATCTTTCTTTCTA...

1191 bp · TkA07G441010|TK1151|CDS

ATGAATTTTTCTTTGAAGCAATCCAATGTAACAATTCCTGTATGCAATTCGAAAATTATCGATCACCGGAGAAATCATCCGGCGCAATTCTCGGTTTTGCCGCCTGTTTCTAATCCCAAAGTTAACAAATTTACCATTGTTTCAAGCTCAAAACCCCTACATGTTTCCTCAATTCAAACTTTCGGGTCATTACGACCACTACTACACGATGATCGCAGTCTAAAATCTAGTGTGGTATGTAACGCGTATGAAGCTGATCG...

396 aa · TkA07G441010|TK1151|PROTEIN

MNFSLKQSNVTIPVCNSKIIDHRRNHPAQFSVLPPVSNPKVNKFTIVSSSKPLHVSSIQTFGSLRPLLHDDRSLKSSVVCNAYEADRSDAEVIGEKVEAARKVKIGVYFATWWSLNVIFNIYNKKVLNAFPYPWLTSTLSLAAGSAIMLISWGTKLAEAPNTDLDFWKSLFPVALAHTIGHVAATVSMSKVAVSFTHIIKSGEPAFSVLVSRFILGETFPLPVYLSLIPIIGGCGLSALTELNFNMTGFMGAMISNLAFV...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G441010
TK1151 IDTkA07G441010
OH-1004 IDLXL04_030951
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.242 / OH-1004 97.037
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G441010
位置Chr07:111721967-111724753 (-)
描述Similar to GPT2: Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g61800 6-磷酸葡萄糖 转运蛋白。
At5g54800 6-磷酸葡萄糖 转运蛋白。
At5g17630 糖磷酸/磷酸转运蛋白,运输无机磷酸、三碳磷酸盐、3-磷酸甘油酸、木酮糖 5-磷酸(Xul-5-P),以及在较小程度上运输核酮糖 5-磷酸。 暂无已核实直接文献
At4g03950 推定的葡萄糖-6-磷酸/磷酸转运蛋白样蛋白1。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_030951 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0007033 vacuole organization 生物过程
GO:0009553 embryo sac development 生物过程
GO:0009624 response to nematode 生物过程
GO:0009643 photosynthetic acclimation 生物过程
GO:0009744 response to sucrose 生物过程
GO:0009749 response to glucose 生物过程
GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程
GO:0010109 regulation of photosynthesis 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0015713 phosphoglycerate transmembrane transport 生物过程
GO:0015714 phosphoenolpyruvate transport 生物过程
GO:0015760 glucose-6-phosphate transport 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G61800
ath:AT4G03950
ath:AT5G17630
ath:AT5G54800
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

质体0.979
排名 1 · TkA07G441010 · TK1151
高尔基体0.030
排名 2 · TkA07G441010 · TK1151
过氧化物酶体0.028
排名 3 · TkA07G441010 · TK1151
内质网0.028
排名 4 · TkA07G441010 · TK1151
线粒体0.019
排名 5 · TkA07G441010 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03151TPT104-392 aa
PF00892EamA120-237 aa
PF08449UAA174-394 aa
PF00892EamA247-392 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G441010PF03151TPT1043921.3e-113380.0
TkA07G441010PF00892EamA1202375.7e-1143.5
TkA07G441010PF08449UAA1743940.00616.5
TkA07G441010PF00892EamA2473925.7e-1143.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94B38拟南芥sp|Q94B38|GPT2_ARATH Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 2, chloroplastic77.300%Swiss-Prot高置信
Q9M5A9拟南芥sp|Q9M5A9|GPT1_ARATH Glucose-6-phosphate/phosphate translocator 1, chloroplastic79.000%Swiss-Prot高置信
Q9LF61拟南芥sp|Q9LF61|XPT_ARATH Xylulose 5-phosphate/phosphate translocator, chloroplastic48.200%Swiss-Prot中等置信
O81514拟南芥sp|O81514|GPTP1_ARATH Putative glucose-6-phosphate/phosphate-translocator-like protein 155.400%Swiss-Prot高置信

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