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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G440470
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 111585294-111588509 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2280 bp · TkA07G440470|TK1151|cDNA

AAAAAATAGTTCTCTCTCTCTCTCACACACACACAGTGTTTCCAGTGGTGATGATAATATGATATCTTCGTTTACTATTCTTTCAATTTTCAAAGCTTTCAACCATCGTGCATAAGCTGCCCACGTTCTTTCCTCTCTACTTCCTTCTTCTCCAACCTTAAAATCATCCTTCTTTATCCAATTTCATCTCTGTATGTTCTCCATTTCCACCTCCCACATCTTCTTCTCCACAGTCTACATCTGGATTTCCAATTTCTCGC...

CDS

下载 CDS FASTA

1563 bp · TkA07G440470|TK1151|CDS

ATGGGCGTATGTCTAAGCAAAAGCAAGAGCTCTTCGAGAAATGATGTGGGTGTTGCCAACAATCACAGATCCGATGAGCCGAACATAGTTTACTCCAAATCGCCTACGCCGGAATCCCAATTGCCGCCGGTAAGAAAGCCGCCACCGGCTAGTCCCAGAAGGATCTTCAAATCAGATACGATTCTCGGAAAACCATTGGAAGATGTGAAAGAACACTACACAATGGGGAAGGAATTGGGTAGAGGTCAATTTGGGGTTAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

520 aa · TkA07G440470|TK1151|PROTEIN

MGVCLSKSKSSSRNDVGVANNHRSDEPNIVYSKSPTPESQLPPVRKPPPASPRRIFKSDTILGKPLEDVKEHYTMGKELGRGQFGVTYMCTQNSTGLKYACKSISKKKLITKGDKEDMRREVQIMQHLSGQANIVEFKGAYEDKQSVHLVMEVCEGGELFDRIIAKGHYSERAAASICRSIVNVVHVCHFMGVMHRDLKPENFLLLDKSENALLKATDFGLSVFIQEGKSYRDIVGSAYYVAPEVLKRKYGKEIDIWSAG...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G440470
TK1151 IDTkA07G440470
OH-1004 IDLXL04_037425
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)76.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.808 / OH-1004 40.015
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G440470
位置Chr07:111585294-111588509 (-)
描述Similar to CPK9: Calcium-dependent protein kinase 9
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g20410 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
At1g50700 Ca²⁺-依赖性蛋白激酶。
THI1, a Thiamine Thiazole Synthase, Interacts with Ca2+-Dependent Protein Kinase CPK33 and Modulates the S-Type Anion Channels and Stomatal Closure in Arabidopsis.2016 · DOI: 10.1104/pp.15.01649

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os07g0515100 可能在涉及钙作为第二信使的信号转导途径中发挥作用。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_037425 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0007165 signal transduction 生物过程
GO:0035556 intracellular signal transduction 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004683 calcium/calmodulin-dependent protein kinase activity 分子功能
GO:0005509 calcium ion binding 分子功能
GO:0005516 calmodulin binding 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
GO:0009931 calcium-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G50700
ath:AT3G20410
dosa:Os07g0515100
osa:4343373
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.491
排名 1 · TkA07G440470 · TK1151
细胞质0.389
排名 2 · TkA07G440470 · TK1151
细胞核0.207
排名 3 · TkA07G440470 · TK1151
高尔基体0.098
排名 4 · TkA07G440470 · TK1151
内质网0.071
排名 5 · TkA07G440470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase73-331 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr74-327 aa
PF06293Kdo100-211 aa
PF03109ABC1148-228 aa
PF14531Kinase-like171-284 aa
PF23564EF-hand_FSTL1196-219 aa
PF08726EFhand_Ca_insen303-314 aa
PF06293Kdo350-367 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G440470PF00069Pkinase733311.6e-77261.2
TkA07G440470PF07714PK_Tyr_Ser-Thr743271.5e-28100.5
TkA07G440470PF06293Kdo1002110.0005220.2
TkA07G440470PF03109ABC11482280.006316.4
TkA07G440470PF14531Kinase-like1712840.002218.0
TkA07G440470PF23564EF-hand_FSTL11962198.7e-0523.6
TkA07G440470PF08726EFhand_Ca_insen3033140.007517.0
TkA07G440470PF06293Kdo3503670.0005220.2
TkA07G440470PF13833EF-hand_83593996.8e-1968.1
TkA07G440470PF20742DUF5580_M3594370.1512.8
TkA07G440470PF10591SPARC_Ca_bdg3664371e-0733.0
TkA07G440470PF21008AIF-13694395.1e-0834.0
TkA07G440470PF12763EH3734382.6e-0937.7
TkA07G440470PF25825SAPC2_N3734140.004117.7
TkA07G440470PF25578EF-hand_STIM13753990.001719.1
TkA07G440470PF23564EF-hand_FSTL13764018.7e-0523.6

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q38868拟南芥sp|Q38868|CDPK9_ARATH Calcium-dependent protein kinase 972.000%Swiss-Prot高置信
Q9C6P3拟南芥sp|Q9C6P3|CDPKX_ARATH Calcium-dependent protein kinase 3366.900%Swiss-Prot高置信
P53683水稻sp|P53683|CDPKJ_ORYSJ Calcium-dependent protein kinase 1971.500%Swiss-Prot高置信

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