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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G438040
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 110903493-110906833 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1542 bp · TkA07G438040|TK1151|cDNA

ATGGAAGACCTAAAAGAACGTCTCCTCCCATCAAAACCTACGTCCAATATAACCCCTAGAGATCCATCACACAAGCCATCTTCAAATCCATATGGCCGCCAACCTTTTCAAGGAGTAGATGTTCTAGGTCTCAAAAAACGTGGTCAAGGTCTTCGATCATGGATCCGTGTAGATTCTTCATCAGGTGAAGCTCAAGTAATCGAAGTAGACAAATTCACCATGATGCGTAGATGTGATCTTCCTGCACGCGATCTTCGACT...

CDS

下载 CDS FASTA

1302 bp · TkA07G438040|TK1151|CDS

ATGGAAGACCTAAAAGAACGTCTCCTCCCATCAAAACCTACGTCCAATATAACCCCTAGAGATCCATCACACAAGCCATCTTCAAATCCATATGGCCGCCAACCTTTTCAAGGAGTAGATGTTCTAGGTCTCAAAAAACGTGGTCAAGGTCTTCGATCATGGATCCGTGTAGATTCTTCATCAGGTGAAGCTCAAGTAATCGAAGTAGACAAATTCACCATGATGCGTAGATGTGATCTTCCTGCACGCGATCTTCGACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

433 aa · TkA07G438040|TK1151|PROTEIN

MEDLKERLLPSKPTSNITPRDPSHKPSSNPYGRQPFQGVDVLGLKKRGQGLRSWIRVDSSSGEAQVIEVDKFTMMRRCDLPARDLRLLDPLFVYPSTILGREKAIVVNLEQIRCIITSDEVLLLNSLDSYVLQYVVELQRRLKAPGDGDRWKGVRNFRDMFGSPSPDYLPFEFKALEVALEAACSFLDTQASELEIEAYPLLDELTSKISTSNLERVRRLKSRLVALTRRVQKVRDEIEQLMDDDGDMAEMYLTEKKGRM...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G438040
TK1151 IDTkA07G438040
OH-1004 IDLXL04_036913
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)49.500
蛋白覆盖度 (%)TK1151 90.069 / OH-1004 95.431
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G438040
位置Chr07:110903493-110906833 (+)
描述Similar to MRS2-I: Magnesium transporter MRS2-I
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g16010 镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。 暂无已核实直接文献
At1g80900 高亲和力镁转运蛋白，介导镁的流入。
A novel family of magnesium transport genes in Arabidopsis.2001 · DOI: 10.1105/tpc.010352
Overexpression of an Arabidopsis magnesium transport gene, AtMGT1, in Nicotiana benthamiana confers Al tolerance.2006 · DOI: 10.1093/jxb/erl201

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2YFN7 镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。 暂无已核实直接文献
Os06g0650800 镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。 暂无已核实直接文献
UniProt: A2XV81 镁转运蛋白，可能介导镁离子的流入。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_036913 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009555 pollen development 生物过程
GO:0015693 magnesium ion transport 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005789 endoplasmic reticulum membrane 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0015095 magnesium ion transmembrane transporter activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G09690
ath:AT5G64560
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.476
排名 1 · TkA07G438040 · TK1151
溶酶体／液泡0.164
排名 2 · TkA07G438040 · TK1151
细胞质0.150
排名 3 · TkA07G438040 · TK1151
内质网0.113
排名 4 · TkA07G438040 · TK1151
高尔基体0.109
排名 5 · TkA07G438040 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF22099MRS2-like67-258 aa
PF01544CorA176-246 aa
PF09523DUF2390176-240 aa
PF16740SKA2176-243 aa
PF26012HH_RND_rel187-235 aa
PF00038Filament208-259 aa
PF14644DUF4456228-244 aa
PF26012HH_RND_rel294-322 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G438040PF22099MRS2-like672581.9e-36126.3
TkA07G438040PF01544CorA1762462e-0628.0
TkA07G438040PF09523DUF23901762400.312.2
TkA07G438040PF16740SKA21762430.4711.0
TkA07G438040PF26012HH_RND_rel1872350.3112.0
TkA07G438040PF00038Filament2082590.009816.3
TkA07G438040PF14644DUF44562282440.113.1
TkA07G438040PF26012HH_RND_rel2943220.3112.0
TkA07G438040PF00038Filament3103710.009816.3
TkA07G438040PF22099MRS2-like3143611.9e-36126.3
TkA07G438040PF09523DUF23903183690.312.2
TkA07G438040PF05817Ribophorin_II3283830.06113.7
TkA07G438040PF01544CorA3324182e-0628.0
TkA07G438040PF26012HH_RND_rel3353630.3112.0
TkA07G438040PF14644DUF44563403760.113.1
TkA07G438040PF16740SKA23483660.4711.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9S9N4拟南芥sp|Q9S9N4|MRS21_ARATH Magnesium transporter MRS2-177.700%Swiss-Prot高置信
Q9SAH0拟南芥sp|Q9SAH0|MRS2A_ARATH Magnesium transporter MRS2-1077.400%Swiss-Prot高置信
A2YFN7水稻sp|A2YFN7|MRS2B_ORYSI Magnesium transporter MRS2-B71.900%Swiss-Prot高置信
Q67UQ7水稻sp|Q67UQ7|MRS2B_ORYSJ Magnesium transporter MRS2-B71.900%Swiss-Prot高置信
A2XV81水稻sp|A2XV81|MRS2C_ORYSI Magnesium transporter MRS2-C67.600%Swiss-Prot高置信

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