TkA07G434110 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G434110

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 109843603-109845654 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1295 bp · TkA07G434110|TK1151|cDNA

CACCCATCAAGACTAAGAGCTTTTAGAGAGAGAAACAGAACAAAAGGAGAGAAATCAAGAAAGAATTCAAACTTCTCTGAATCTCTTTGTCTTTGTTGAGTGTGTGTGGAAACTCGGTTGAAAAATGACTTCAGACAGCTTTGCTCATCTCACTCTTGCATTTGGCCTTCTTGGCAATGCTGTATCATTCATGGTGTTTCTTTCCCCATTGCCAACATTTTATAAAGTTTACAAAAAGAAATCAACAGAAGGGTTTCAAT...

CDS

下载 CDS FASTA

891 bp · TkA07G434110|TK1151|CDS

ATGACTTCAGACAGCTTTGCTCATCTCACTCTTGCATTTGGCCTTCTTGGCAATGCTGTATCATTCATGGTGTTTCTTTCCCCATTGCCAACATTTTATAAAGTTTACAAAAAGAAATCAACAGAAGGGTTTCAATCAGTGCCTTATGTCGTCGGGTTATTTAGCGCAATGCTTTGGATCTATTACGCATTGCTTAAGGCTAATGCCATGCTTCTAATCACCATTAACTCCGTCGGATGCTTCATTCAAACCTTCTACAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

296 aa · TkA07G434110|TK1151|PROTEIN

MTSDSFAHLTLAFGLLGNAVSFMVFLSPLPTFYKVYKKKSTEGFQSVPYVVGLFSAMLWIYYALLKANAMLLITINSVGCFIQTFYICFFLFYAPKKARIESLKLITMMIVVGFGLIVVLTQFFATGVTRVTIVGWICLVFALCVFIAPLGVLRQVIKTKSVEYMPILLSAALTLNAITWFFYGLLLRDFNIAIPNVLGITFGVLQMILYFVYKNKKPIISDEKVSELKSIETVLEQPKISGKKDQEIIDVVKLSAALVC...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G434110`
TK1151 ID	TkA07G434110
OH-1004 ID	LXL04_030825
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G434110

位置 Chr07:109843603-109845654 (-)

描述 Similar to SWEET11: Bidirectional sugar transporter SWEET11

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At3g48740`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	Functional role of oligomerization for bacterial and plant SWEET sugar transporter family.2013 · DOI: 10.1073/pnas.1311244110 A cascade of sequentially expressed sucrose transporters in the seed coat and endosperm provides nutrition for the Arabidopsis embryo.2015 · DOI: 10.1105/tpc.114.134585
`At5g50790`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`UniProt: B8BKP4`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	暂无已核实直接文献
`Os11g0508600`	介导糖跨质膜的低亲和力摄取和流出。	Sugar transporters for intercellular exchange and nutrition of pathogens.2010 · DOI: 10.1038/nature09606 Five phylogenetically close rice SWEET genes confer TAL effector-mediated susceptibility to Xanthomonas oryzae pv. oryzae.2013 · DOI: 10.1111/nph.12411
`Os12g0476200`	介导跨质膜的低亲和力糖摄取和外排。	暂无已核实直接文献

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030825 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0008643 carbohydrate transport 生物过程

GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程

GO:0010431 seed maturation 生物过程

GO:0015770 sucrose transport 生物过程

GO:0048571 long-day photoperiodism 生物过程

GO:0051260 protein homooligomerization 生物过程

GO:0005576 extracellular region 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0016020 membrane 细胞组分

GO:0008515 sucrose transmembrane transporter activity 分子功能

GO:0051119 sugar transmembrane transporter activity 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G48740

ath:AT5G23660

ath:AT5G50790

dosa:Os11g0508600

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.641

排名 1 · TkA07G434110 · TK1151

内质网0.158

排名 2 · TkA07G434110 · TK1151

溶酶体／液泡0.108

排名 3 · TkA07G434110 · TK1151

细胞质0.099

排名 4 · TkA07G434110 · TK1151

高尔基体0.072

排名 5 · TkA07G434110 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF03083MtN3_slv13-97 aa

PF04193PQ-loop15-67 aa

PF22258DUF694918-60 aa

PF04193PQ-loop71-91 aa

PF03083MtN3_slv107-123 aa

PF04193PQ-loop132-147 aa

PF22258DUF6949132-185 aa

PF03083MtN3_slv133-217 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G434110	`PF03083`	MtN3_slv	13	97	2e-52	175.9
TkA07G434110	`PF04193`	PQ-loop	15	67	0.00089	19.7
TkA07G434110	`PF22258`	DUF6949	18	60	0.061	14.3
TkA07G434110	`PF04193`	PQ-loop	71	91	0.00089	19.7
TkA07G434110	`PF03083`	MtN3_slv	107	123	2e-52	175.9
TkA07G434110	`PF04193`	PQ-loop	132	147	0.00089	19.7
TkA07G434110	`PF22258`	DUF6949	132	185	0.061	14.3
TkA07G434110	`PF03083`	MtN3_slv	133	217	2e-52	175.9
TkA07G434110	`PF04193`	PQ-loop	156	189	0.00089	19.7
TkA07G434110	`PF04193`	PQ-loop	197	209	0.00089	19.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9SMM5`	拟南芥	sp\|Q9SMM5\|SWT11_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET11	49.800%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9LUE3`	拟南芥	sp\|Q9LUE3\|SWT10_ARATH Bidirectional sugar transporter SWEET10	53.900%	Swiss-Prot	高置信
`B8BKP4`	水稻	sp\|B8BKP4\|SWT14_ORYSI Bidirectional sugar transporter SWEET14	52.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q2R3P9`	水稻	sp\|Q2R3P9\|SWT14_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET14	52.600%	Swiss-Prot	高置信
`Q2QR07`	水稻	sp\|Q2QR07\|SWT13_ORYSJ Bidirectional sugar transporter SWEET13	55.900%	Swiss-Prot	高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看

基因详情