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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G414600
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 104784800-104788249 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

2577 bp · TkA07G414600|TK1151|cDNA

AACTAATATACAAAATATATAAAATTTTCACTAATACTTATACGCCAGTCTTTGAAAATGCACACTAAATTTTCTCTTTACTCTTTAGGCAACTGGAAAAAAGTGCGACTGGAATTCTGTGTTCGTTGATCCGCTCCCTTGCTTATTTTCTGCAATTTTGGGGTAAATTTCCAGAGAGAGAAAGTCATGAAATTTCCGTGATCTTTTCAAACCAGAATGCGAATTAAACACGACCGATTATTCGATTAAGATTGTCGTTT...

CDS

下载 CDS FASTA

2001 bp · TkA07G414600|TK1151|CDS

ATGGGCTGCGTGTCATCGAAACAGACAGTGCCAGTGACGCCGGCGGCGGATCATTTCGGAGGGTTTCGGGACAATGCGGTGGGTGGTTCTGGCCGGAGTTTTGACGGGATTGGCGGCGATGTGGTGGCGCAGTTAAACAAAACCAAGAGCCGAAAGAAGAAAGGGAGTACAAGGAGTGAGTCAGGGCTGACCGAGAGCGAGTTAGGCGAGTCAGGGAGAACGAATTTCACCATCGGCGGCGGCGAATCGGTAAGCTTTAG...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

666 aa · TkA07G414600|TK1151|PROTEIN

MGCVSSKQTVPVTPAADHFGGFRDNAVGGSGRSFDGIGGDVVAQLNKTKSRKKKGSTRSESGLTESELGESGRTNFTIGGGESVSFRLGNLHRYVEVEQVAAGWPAWLTAVAGEAIHGWLPLRAESFEKLEKIGQGTYSSVFRARDLEAGKIVALKKVRFDNFEPESVRFMAREITILRRLNHPNIIKLDGIITSQSSCNIYLVFEYMDHDISGLLSRRDVNFTESQIKCYMKQLLSGLKHCHSRGIMHRDIKGANLLVN...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G414600
TK1151 IDTkA07G414600
OH-1004 IDLXL04_030609
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G414600
位置Chr07:104784800-104788249 (+)
描述Similar to IBS1: Protein IMPAIRED IN BABA-INDUCED STERILITY 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g18670 是 β-氨基丁酸 诱导的针对细菌和卵菌的抗性 所必需的，通过启动水杨酸 依赖性防御反应，例如发病机制相关的 PR-1 基因表达和尾随坏死。
Dissecting the beta-aminobutyric acid-induced priming phenomenon in Arabidopsis.2005 · DOI: 10.1105/tpc.104.029728
Descendants of primed Arabidopsis plants exhibit resistance to biotic stress.2012 · DOI: 10.1104/pp.111.191593
At5g39420 细胞周期蛋白dependent kinase C-2 C。 暂无已核实直接文献
At1g09600 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g09600。 暂无已核实直接文献
At1g54610 可能的丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 At1g54610。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os01g0958000 细胞周期蛋白dependent kinase C-2。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030609 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002229 defense response to oomycetes 生物过程
GO:0009615 response to virus 生物过程
GO:0032968 positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II 生物过程
GO:0042742 defense response to bacterium 生物过程
GO:1900426 positive regulation of defense response to bacterium 生物过程
GO:1902290 positive regulation of defense response to oomycetes 生物过程
GO:2000031 regulation of salicylic acid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0000307 cyclin-dependent protein kinase holoenzyme complex 细胞组分
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
GO:0004693 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0005524 ATP binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G09600
ath:AT1G18670
ath:AT1G54610
ath:AT5G39420
dosa:Os01g0958000
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.541
排名 1 · TkA07G414600 · TK1151
细胞核0.329
排名 2 · TkA07G414600 · TK1151
细胞膜0.255
排名 3 · TkA07G414600 · TK1151
高尔基体0.044
排名 4 · TkA07G414600 · TK1151
内质网0.040
排名 5 · TkA07G414600 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase127-412 aa
PF03109ABC1127-158 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr129-336 aa
PF01636APH130-210 aa
PF14531Kinase-like132-162 aa
PF03109ABC1196-278 aa
PF14531Kinase-like238-318 aa
PF01636APH243-265 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G414600PF00069Pkinase1274128e-69232.7
TkA07G414600PF03109ABC11271580.001218.8
TkA07G414600PF07714PK_Tyr_Ser-Thr1293361.1e-32114.0
TkA07G414600PF01636APH1302100.1812.2
TkA07G414600PF14531Kinase-like1321620.09912.6
TkA07G414600PF03109ABC11962780.001218.8
TkA07G414600PF14531Kinase-like2383180.09912.6
TkA07G414600PF01636APH2432650.1812.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
F4ICB6拟南芥sp|F4ICB6|IBS1_ARATH Protein IMPAIRED IN BABA-INDUCED STERILITY 158.300%Swiss-Prot高置信
B5X564拟南芥sp|B5X564|CDC2C_ARATH Cyclin-dependent kinase C-2 C50.900%Swiss-Prot高置信
F4I114拟南芥sp|F4I114|Y1960_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g0960049.200%Swiss-Prot中等置信
Q9ZVM9拟南芥sp|Q9ZVM9|Y1461_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase At1g5461057.700%Swiss-Prot中等置信
Q5JK68水稻sp|Q5JK68|CDKC2_ORYSJ Cyclin-dependent kinase C-249.600%Swiss-Prot低置信

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