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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G386680
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 96924635-96925989 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

630 bp · TkA07G386680|TK1151|cDNA

ATGCAGAGCTTAGCGAAAAGGCAACGCGGGGTTCGTCAATGCTCTCGATTTTTCCTCGATGAATTCAAACGAAGTACGACAAGCCTTAGCAGTAGCAGCTGCAGCTCTCTCCTCGATCATTCGCTCACCTGTGATCCTGATTCTGTTGTATTAGTGGAAGGCAATGCGAGTTCGAGAACCGTAGTTCTCAACAGACCTTCCTTTCTCAATGCGCTCAACACTGCCATGGGACCTGGCGGACAACTAAAACTTGCAGATTT...

CDS

下载 CDS FASTA

630 bp · TkA07G386680|TK1151|CDS

ATGCAGAGCTTAGCGAAAAGGCAACGCGGGGTTCGTCAATGCTCTCGATTTTTCCTCGATGAATTCAAACGAAGTACGACAAGCCTTAGCAGTAGCAGCTGCAGCTCTCTCCTCGATCATTCGCTCACCTGTGATCCTGATTCTGTTGTATTAGTGGAAGGCAATGCGAGTTCGAGAACCGTAGTTCTCAACAGACCTTCCTTTCTCAATGCGCTCAACACTGCCATGGGACCTGGCGGACAACTAAAACTTGCAGATTT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

209 aa · TkA07G386680|TK1151|PROTEIN

MQSLAKRQRGVRQCSRFFLDEFKRSTTSLSSSSCSSLLDHSLTCDPDSVVLVEGNASSRTVVLNRPSFLNALNTAMGPGGQLKLADFGLARIFGCPDRSNNTDEITNDQVFARWYRAPELLFGSKQYGSGVDVWAAACIFAELLLRRPFLQGTVTSTNWVKSLLVHVESRTSHSVWLLHCMLIAAVCGSGPSCCCTQAAPRKIAAASSA

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G386680
TK1151 IDTkA07G386680
OH-1004 IDLXL04_003849
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)90.700
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G386680
位置Chr07:96924635-96925989 (+)
描述Similar to CDKD-3: Cyclin-dependent kinase D-3
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g18040 可能与细胞周期蛋白CYCH1-1形成稳定复合物，磷酸化人类CDK2及RNA聚合酶II大亚基的C端结构域(CTD)。 暂无已核实直接文献
At1g73690 细胞周期蛋白dependent kinase D-1。 暂无已核实直接文献
At1g66750 与细胞周期蛋白 CYCH1-1 形成稳定复合物，可磷酸化人类 CDK2 及 RNA 聚合酶 II 大亚基的 C 端结构域 (CTD)。 暂无已核实直接文献

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: A2Y4B6 细胞周期蛋白dependent kinase D-1。 暂无已核实直接文献
Os05g0392300 CDK 激活激酶，可能控制 G1/S 期进程。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003849 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006367 transcription initiation at RNA polymerase II promoter 生物过程
GO:0030154 cell differentiation 生物过程
GO:0045944 positive regulation of transcription by RNA polymerase II 生物过程
GO:0048578 positive regulation of long-day photoperiodism, flowering 生物过程
GO:0051301 cell division 生物过程
GO:0051726 regulation of cell cycle 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0070985 transcription factor TFIIK complex 细胞组分
GO:0004672 protein kinase activity 分子功能
GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能
GO:0004693 cyclin-dependent protein serine/threonine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G18040
ath:AT1G66750
ath:AT1G73690
dosa:Os05g0392300
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.472
排名 1 · TkA07G386680 · TK1151
细胞质0.402
排名 2 · TkA07G386680 · TK1151
线粒体0.152
排名 3 · TkA07G386680 · TK1151
细胞膜0.056
排名 4 · TkA07G386680 · TK1151
内质网0.047
排名 5 · TkA07G386680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase20-47 aa
PF07714PK_Tyr_Ser-Thr76-145 aa
PF00069Pkinase80-156 aa
PF00069Pkinase170-192 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G386680PF00069Pkinase20474.4e-1659.8
TkA07G386680PF07714PK_Tyr_Ser-Thr761450.0001621.8
TkA07G386680PF00069Pkinase801564.4e-1659.8
TkA07G386680PF00069Pkinase1701924.4e-1659.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LMT0拟南芥sp|Q9LMT0|CDKD3_ARATH Cyclin-dependent kinase D-375.000%Swiss-Prot低置信
Q9C9U2拟南芥sp|Q9C9U2|CDKD1_ARATH Cyclin-dependent kinase D-175.000%Swiss-Prot低置信
Q9C9M7拟南芥sp|Q9C9M7|CDKD2_ARATH Cyclin-dependent kinase D-270.400%Swiss-Prot低置信
A2Y4B6水稻sp|A2Y4B6|CDKD1_ORYSI Cyclin-dependent kinase D-172.800%Swiss-Prot低置信
P29620水稻sp|P29620|CDKD1_ORYSJ Cyclin-dependent kinase D-172.800%Swiss-Prot低置信

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