TkA07G382530 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G382530

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 95890237-95890849 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA 无可用 cDNA 序列

cDNA

该参考版本没有可用的cDNA序列。

CDS

下载 CDS FASTA

318 bp · TkA07G382530|TK1151|CDS

ATGATGTCACATGTTGTCATTGGAATCAGTCACCAAACAAATATTCGGATTTTAGTTTTAAATAATACCACCATAACTTGGTCTCACATTGAAGTGCTTAAGGATTCACTCCAAGCCATCCAAGAACTGCATCTAATGGGAAATAAGTTGAAGGAGATAACACCTACATCATCGAATATTGTGAAAGGATTTGATAATTTGCGGATTCTTAACTTGGAAGATAACTATATAGCTGATTGGACTGAAATCTTTAAGCTTTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

106 aa · TkA07G382530|TK1151|PROTEIN

MMSHVVIGISHQTNIRILVLNNTTITWSHIEVLKDSLQAIQELHLMGNKLKEITPTSSNIVKGFDNLRILNLEDNYIADWTEIFKLSQLKCLEQLHLNKNNIEHIW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G382530`
TK1151 ID	TkA07G382530
OH-1004 ID	LXL04_003882
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	95.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 31.928 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G382530

位置 Chr07:95890237-95890849 (+)

描述 Similar to TFCE: Tubulin-folding cofactor E

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g71440`	必需的微管蛋白折叠蛋白，参与微管蛋白折叠途径。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_003882 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000226 microtubule cytoskeleton organization 生物过程

GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程

GO:0007021 tubulin complex assembly 生物过程

GO:0007023 post-chaperonin tubulin folding pathway 生物过程

GO:0009793 embryo development ending in seed dormancy 生物过程

GO:0005737 cytoplasm 细胞组分

GO:0005856 cytoskeleton 细胞组分

GO:0009507 chloroplast 细胞组分

GO:0043014 alpha-tubulin binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G71440

hsa:219899

mmu:272589

rno:315591

xla:495403

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.560

排名 1 · TkA07G382530 · TK1151

细胞核0.440

排名 2 · TkA07G382530 · TK1151

线粒体0.073

排名 3 · TkA07G382530 · TK1151

细胞膜0.046

排名 4 · TkA07G382530 · TK1151

内质网0.029

排名 5 · TkA07G382530 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01611Filo_glycop5-51 aa

PF14580LRR_911-75 aa

PF13516LRR_611-26 aa

PF12799LRR_413-54 aa

PF29594LRR_SKP213-98 aa

PF24048LRR_NXF1-514-102 aa

PF13855LRR_814-77 aa

PF00560LRR_114-33 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G382530	`PF01611`	Filo_glycop	5	51	0.35	10.4
TkA07G382530	`PF14580`	LRR_9	11	75	0.031	14.5
TkA07G382530	`PF13516`	LRR_6	11	26	0.59	11.0
TkA07G382530	`PF12799`	LRR_4	13	54	1.2e-10	42.0
TkA07G382530	`PF29594`	LRR_SKP2	13	98	0.053	13.5
TkA07G382530	`PF24048`	LRR_NXF1-5	14	102	2.4e-06	28.0
TkA07G382530	`PF13855`	LRR_8	14	77	1.2e-05	25.7
TkA07G382530	`PF00560`	LRR_1	14	33	0.00014	22.0
TkA07G382530	`PF23598`	LRR_14	15	97	0.12	11.9
TkA07G382530	`PF21788`	TNP-like_GBD	16	52	0.012	16.8
TkA07G382530	`PF12799`	LRR_4	40	82	1.2e-10	42.0
TkA07G382530	`PF00560`	LRR_1	40	56	0.00014	22.0
TkA07G382530	`PF13516`	LRR_6	40	50	0.59	11.0
TkA07G382530	`PF13855`	LRR_8	41	102	1.2e-05	25.7
TkA07G382530	`PF14580`	LRR_9	41	105	0.031	14.5
TkA07G382530	`PF21788`	TNP-like_GBD	64	105	0.012	16.8

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q8GRL7`	拟南芥	sp\|Q8GRL7\|TBCE_ARATH Tubulin-folding cofactor E	57.000%	Swiss-Prot	高置信

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