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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G370860
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 92975052-92978755 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3326 bp · TkA07G370860|TK1151|cDNA

TTTCATTACTGTTCACTGATCATATTGCATTTGACAAATTGTCCACATGTCCAGCGCATAACTTGAATTGACTACAGCGCATTCATCTATAAGATAGAGTTCCTCAATTAAGTAACCAAACAAATTAGACATTCGTCGGCGCCTGTTACAATACGCAGATCCCCTTCTAAAGATTATAATGAACCTCTTCTCATATGGTATCTTGAACGATCTGTTAGCCAAAATGAAATCATTCCCACTTCTTTCTTCCTTCAAAACAA...

CDS

下载 CDS FASTA

1908 bp · TkA07G370860|TK1151|CDS

ATGTTACCTAGTACGATAAGAAACTGTAGCAGATTGTTGCGACTCAGGATTGACGGGAATCAGATCACGGGAAACGTGTCGGATGCTTTTGGCGTCTATGATGACTTGGAGTATGTCGATTTGAGTTATAACAAGTTGTATGGCAAGGTATCGAACAATTGGGCTCGGTGTCGCAGCTTAATGGCTCTTAAGATGTCTAACAATAATTTTTCGGGGGTTATACCTGACAATCTTGGAGACTCTGATCAGCTGCAAGAAAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

635 aa · TkA07G370860|TK1151|PROTEIN

MLPSTIRNCSRLLRLRIDGNQITGNVSDAFGVYDDLEYVDLSYNKLYGKVSNNWARCRSLMALKMSNNNFSGVIPDNLGDSDQLQEIDLASNLLTGEIPISLGRLNSLIYLFLHDNRLRGSIPREFGKLLNLGTLNLAKNALTGAIPSEIGDCSRLRILNFSGNYLRDVIPIKLMRLAELQVLDLADNSIIGGLPLEFGKLKRLETLNISHNNLTGSIPSTFIDLSSLITIDISYNELEGRVPNIHIFQLAPFEAIENNK...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G370860
TK1151 IDTkA07G370860
OH-1004 IDLXL04_030019
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)99.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 44.094 / OH-1004 31.854
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G370860
位置Chr07:92975052-92978755 (-)
描述Similar to MIK2: MDIS1-interacting receptor like kinase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g08850 作为十字花科植物SCOOP肽的受体，调节包括植物生长、发育和应激反应在内的多种过程。
A receptor heteromer mediates the male perception of female attractants in plants.2016 · DOI: 10.1038/nature16975
Perception of a divergent family of phytocytokines by the Arabidopsis receptor kinase MIK2.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-20932-y
The Arabidopsis MIK2 receptor elicits immunity by sensing a conserved signature from phytocytokines and microbes.2021 · DOI: 10.1038/s41467-021-25580-w
The MIK2/SCOOP Signaling System Contributes to Arabidopsis Resistance Against Herbivory by Modulating Jasmonate and Indole Glucosinolate Biosynthesis.2022 · DOI: 10.3389/fpls.2022.852808
At1g35710 可能的富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At1g35710。 暂无已核实直接文献
At1g17230 富含亮氨酸重复序列的受体样丝/苏氨酸蛋白激酶 At1g17230。 暂无已核实直接文献
At5g63930 可能是富含亮氨酸重复的受体样蛋白激酶 At5g63930。 暂无已核实直接文献
At4g20140 与GSO2共同参与胚胎和子叶表皮表面发育所需的受体样丝氨酸／苏氨酸激酶。
GASSHO1 and GASSHO2 encoding a putative leucine-rich repeat transmembrane-type receptor kinase are essential for the normal development of the epidermal surface in Arabidopsis embryos.2008 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03395.x
The receptor-like kinases GSO1 and GSO2 together regulate root growth in Arabidopsis through control of cell division and cell fate specification.2014 · DOI: 10.1002/dvdy.24066
A peptide hormone required for Casparian strip diffusion barrier formation in Arabidopsis roots.2017 · DOI: 10.1126/science.aai9057

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_030019 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0002213 defense response to insect 生物过程
GO:0002237 response to molecule of bacterial origin 生物过程
GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009755 hormone-mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009759 indole glucosinolate biosynthetic process 生物过程
GO:0010074 maintenance of meristem identity 生物过程
GO:0010078 maintenance of root meristem identity 生物过程
GO:0010082 regulation of root meristem growth 生物过程
GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程
GO:0010449 root meristem growth 生物过程
GO:0031349 positive regulation of defense response 生物过程
GO:0080027 response to herbivore 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G17230
ath:AT1G35710
ath:AT3G24240
ath:AT4G08850
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.860
排名 1 · TkA07G370860 · TK1151
内质网0.085
排名 2 · TkA07G370860 · TK1151
细胞质0.060
排名 3 · TkA07G370860 · TK1151
细胞核0.039
排名 4 · TkA07G370860 · TK1151
溶酶体／液泡0.027
排名 5 · TkA07G370860 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF23598LRR_142-22 aa
PF29594LRR_SKP23-44 aa
PF13855LRR_84-46 aa
PF12799LRR_411-46 aa
PF00560LRR_112-31 aa
PF13516LRR_612-24 aa
PF25013LRR_Zer-135-67 aa
PF00560LRR_136-55 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G370860PF23598LRR_142223.7e-1659.5
TkA07G370860PF29594LRR_SKP23440.01515.3
TkA07G370860PF13855LRR_84461e-2589.9
TkA07G370860PF12799LRR_411462.2e-1660.2
TkA07G370860PF00560LRR_112311.1e-2893.8
TkA07G370860PF13516LRR_612240.04814.4
TkA07G370860PF25013LRR_Zer-135671.69.6
TkA07G370860PF00560LRR_136551.1e-2893.8
TkA07G370860PF13855LRR_836941e-2589.9
TkA07G370860PF13516LRR_636460.04814.4
TkA07G370860PF29594LRR_SKP239900.01515.3
TkA07G370860PF29460LRR_NXF249950.07113.6
TkA07G370860PF13516LRR_657720.04814.4
TkA07G370860PF13855LRR_8581181e-2589.9
TkA07G370860PF00560LRR_159791.1e-2893.8
TkA07G370860PF12799LRR_463942.2e-1660.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8VZG8拟南芥sp|Q8VZG8|MIK2_ARATH MDIS1-interacting receptor like kinase 246.200%Swiss-Prot中等置信
Q9LP24拟南芥sp|Q9LP24|Y1571_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At1g3571045.300%Swiss-Prot中等置信
Q9SHI2拟南芥sp|Q9SHI2|Y1723_ARATH Leucine-rich repeat receptor-like serine/threonine-protein kinase At1g1723040.200%Swiss-Prot低置信
Q9LVP0拟南芥sp|Q9LVP0|Y5639_ARATH Probable leucine-rich repeat receptor-like protein kinase At5g6393038.900%Swiss-Prot低置信
C0LGQ5拟南芥sp|C0LGQ5|GSO1_ARATH LRR receptor-like serine/threonine-protein kinase GSO132.700%Swiss-Prot中等置信

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