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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G364470
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 91318369-91319893 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

438 bp · TkA07G364470|TK1151|cDNA

ATGAATAACGAAGAAGAGAAAAGGTGTCCGTTGTGTGCAGAAGAGATTGATTGGACTGATCAACAATTGAATCCTTGCAAATGTGGTTACGAGGTGTGCGTTTGGTGTTGGCATCACATAATGGACATGGCTGAGAAAGATGTAACAGAGGGACGATGTCCTGCTTGTAGAACACCTTATGATAAAGATAGAATTTTAGGCGTGGAATCAAACTTTCAAAGGGTTGCTGCCAATAGTTCAATAGTTCAGGTTGATTTCAT...

CDS

下载 CDS FASTA

438 bp · TkA07G364470|TK1151|CDS

ATGAATAACGAAGAAGAGAAAAGGTGTCCGTTGTGTGCAGAAGAGATTGATTGGACTGATCAACAATTGAATCCTTGCAAATGTGGTTACGAGGTGTGCGTTTGGTGTTGGCATCACATAATGGACATGGCTGAGAAAGATGTAACAGAGGGACGATGTCCTGCTTGTAGAACACCTTATGATAAAGATAGAATTTTAGGCGTGGAATCAAACTTTCAAAGGGTTGCTGCCAATAGTTCAATAGTTCAGGTTGATTTCAT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

145 aa · TkA07G364470|TK1151|PROTEIN

MNNEEEKRCPLCAEEIDWTDQQLNPCKCGYEVCVWCWHHIMDMAEKDVTEGRCPACRTPYDKDRILGVESNFQRVAANSSIVQVDFMDEQIWYAIFGTIIDGILVPLVTWARHLECCVPDLIMYHQLSTNAFYQCRNKDLKETLW

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G364470
TK1151 IDTkA07G364470
OH-1004 IDLXL04_029972
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 待复核
蛋白一致性 (%)98.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G364470
位置Chr07:91318369-91319893 (+)
描述Similar to SPAC16C9.04c: Putative general negative regulator of transcription C16C9.04c (Schizosaccharomyces pombe (strain 972 / ATCC 24843)
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

当前来源表未检出该物种的同源命中。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029972 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000209 protein polyubiquitination 生物过程
GO:0000289 nuclear-transcribed mRNA poly(A) tail shortening 生物过程
GO:0006351 DNA-templated transcription 生物过程
GO:0006511 ubiquitin-dependent protein catabolic process 生物过程
GO:0006513 protein monoubiquitination 生物过程
GO:0010498 proteasomal protein catabolic process 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0031047 regulatory ncRNA-mediated gene silencing 生物过程
GO:0031087 deadenylation-independent decapping of nuclear-transcribed mRNA 生物过程
GO:0032968 positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II 生物过程
GO:0051865 protein autoubiquitination 生物过程
GO:0070966 nuclear-transcribed mRNA catabolic process, no-go decay 生物过程
KEGG 基因交叉引用
hsa:4850
mmu:53621
sce:YER068W
spo:2542325
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.440
排名 1 · TkA07G364470 · TK1151
细胞核0.350
排名 2 · TkA07G364470 · TK1151
线粒体0.162
排名 3 · TkA07G364470 · TK1151
内质网0.101
排名 4 · TkA07G364470 · TK1151
细胞膜0.100
排名 5 · TkA07G364470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF14569zf-UDP2-63 aa
PF01363FYVE2-58 aa
PF27389AZC_39242-22 aa
PF04423Rad50_zn_hook3-15 aa
PF26470DUF81453-16 aa
PF24921RING_XB3-XBAT314-16 aa
PF25447RING_ZNF5985-75 aa
PF20173ZnF_RZ-type5-17 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G364470PF14569zf-UDP2630.002418.6
TkA07G364470PF01363FYVE2580.0215.7
TkA07G364470PF27389AZC_39242225.48.0
TkA07G364470PF04423Rad50_zn_hook3150.02215.3
TkA07G364470PF26470DUF81453160.02615.1
TkA07G364470PF24921RING_XB3-XBAT314160.04814.4
TkA07G364470PF25447RING_ZNF5985750.07914.0
TkA07G364470PF20173ZnF_RZ-type5172.08.8
TkA07G364470PF12660zf-TFIIIC6630.01216.4
TkA07G364470PF05290Baculo_IE-18630.001519.2
TkA07G364470PF05605zf-Di198160.07414.0
TkA07G364470PF26237DUF8054_C8324.08.2
TkA07G364470PF14570zf-RING_49613.1e-1969.2
TkA07G364470PF12773DZR9620.6910.8
TkA07G364470PF26470DUF814524460.02615.1
TkA07G364470PF27389AZC_392424575.48.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

没有找到该查询的结果。

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