TkA07G357080 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G357080

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 89447230-89450416 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1927 bp · TkA07G357080|TK1151|cDNA

ATTTAACAAAAGAACTAAAAACCCTATACCCTCTCTTTCCTTCAGCCGGCAAACACATACGAACGTTCTCTTCATCATCGTTGGTTCCAACCCGCTTCCAACCTGCTCGCCGTCGCTTCCGAGTACGAGGACACTTGTGCAAATTGAGCCGATCTTCTCTGCAATGTTAAACCCTCAATAGAACCCTTCCTCGCCCCCTTTACTCGCCCCCTCTTCCACTGGATTCATCAAGCTCTACTCTTCCTCCATTCCAATTTCTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1344 bp · TkA07G357080|TK1151|CDS

ATGAAAGCTTTGAGACTAATCCAAACACTTGCTAATCAGTCTTCAAAACCCTTTAAAACCTCCAATCTCAATCCCACTTTTCTCTCTCGATTTTACGCATCCCAACCTCTACAAGAAAACCCAGTATCCGACACAGAAGAACCTCACACCACCAATACCAGTGCCTTCAGCTTCGACAGCAGCCATTACGAATTACCAAACCTGTCACTAGGTTTGGGCTTAGATGAGGCTGCAAATACTGAATCGAATTGGGACGAAAA...

蛋白

下载蛋白 FASTA

447 aa · TkA07G357080|TK1151|PROTEIN

MKALRLIQTLANQSSKPFKTSNLNPTFLSRFYASQPLQENPVSDTEEPHTTNTSAFSFDSSHYELPNLSLGLGLDEAANTESNWDEKYRRKANKTIFGEEHEKLVKDKKKKKSKNERMLEQEEKRRRTVILSKVLLEAAVAPTDEEDDDDDDSEAVKMEDQLSLSVGIIGAPNAGKSALTNFMVGTKVAAVSRKTNTTTHEVLGVMTKGKTQICFFDTPGLIMKKYGLPKPDMKVRVESAWSSIDLYDILVVIFDVDRHL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G357080`
TK1151 ID	TkA07G357080
OH-1004 ID	LXL04_029900
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)	97.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G357080

位置 Chr07:89447230-89450416 (+)

描述 Similar to ERG: GTP-binding protein ERG

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At1g30960`	在植物生长和发育中具有关键作用，可能通过影响线粒体分裂实现。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029900 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0000028 ribosomal small subunit assembly 生物过程

GO:0005739 mitochondrion 细胞组分

GO:0005829 cytosol 细胞组分

GO:0005886 plasma membrane 细胞组分

GO:0003924 GTPase activity 分子功能

GO:0005525 GTP binding 分子功能

GO:0019843 rRNA binding 分子功能

GO:0043024 ribosomal small subunit binding 分子功能

GO:0070181 small ribosomal subunit rRNA binding 分子功能

GO:0097177 mitochondrial ribosome binding 分子功能

KEGG 基因交叉引用

ath:AT1G30960

bbt:BBta_4682

bra:BRADO4462

oca:OCAR_5843

ocg:OCA5_c21740

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

线粒体0.812

排名 1 · TkA07G357080 · TK1151

质体0.141

排名 2 · TkA07G357080 · TK1151

细胞核0.066

排名 3 · TkA07G357080 · TK1151

细胞质0.040

排名 4 · TkA07G357080 · TK1151

细胞膜0.014

排名 5 · TkA07G357080 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01926MMR_HSR16-24 aa

PF00350Dynamin_N107-114 aa

PF00009GTP_EFTU109-129 aa

PF01926MMR_HSR1112-125 aa

PF03193RsgA_GTPase144-221 aa

PF00009GTP_EFTU164-193 aa

PF01926MMR_HSR1166-290 aa

PF02421FeoB_N166-331 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G357080	`PF01926`	MMR_HSR1	6	24	2.5e-17	63.7
TkA07G357080	`PF00350`	Dynamin_N	107	114	0.034	14.9
TkA07G357080	`PF00009`	GTP_EFTU	109	129	1.6e-05	25.3
TkA07G357080	`PF01926`	MMR_HSR1	112	125	2.5e-17	63.7
TkA07G357080	`PF03193`	RsgA_GTPase	144	221	5.5e-07	30.3
TkA07G357080	`PF00009`	GTP_EFTU	164	193	1.6e-05	25.3
TkA07G357080	`PF01926`	MMR_HSR1	166	290	2.5e-17	63.7
TkA07G357080	`PF02421`	FeoB_N	166	331	5.3e-06	26.8
TkA07G357080	`PF00350`	Dynamin_N	166	205	0.034	14.9
TkA07G357080	`PF04548`	AIG1	168	278	6.5e-05	23.1
TkA07G357080	`PF00071`	Ras	169	338	0.0028	18.0
TkA07G357080	`PF10662`	PduV-EutP	196	203	0.013	16.1
TkA07G357080	`PF00350`	Dynamin_N	205	263	0.034	14.9
TkA07G357080	`PF02492`	cobW	229	312	0.14	12.5
TkA07G357080	`PF00009`	GTP_EFTU	243	337	1.6e-05	25.3
TkA07G357080	`PF03193`	RsgA_GTPase	270	337	5.5e-07	30.3

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`O82653`	拟南芥	sp\|O82653\|ERG_ARATH GTP-binding protein ERG	56.500%	Swiss-Prot	高置信

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