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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G356510
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 89277235-89279449 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1345 bp · TkA07G356510|TK1151|cDNA

GTCTCCTCAAATTTTGATGCCTCCCTCTTCTCCATCTCAATTTGTATCATCATAAACAAACCCAAATCGAGGAGATAGATCGTGAATGAGACAAGAAACGGTCCGAATTAAACAAGAAACGAATGCAAAACGCTTCTCGATCATGAATCCAATTCGATACATGCTACGCGAACAGAGGATCCCATGTCTGCTGATCGGAATCGCCATTCCAGCTCTGCTGTTCAACGTTTCTATTCCCTTACCTTCATCGCTGCAAGTTG...

CDS

下载 CDS FASTA

1155 bp · TkA07G356510|TK1151|CDS

ATGAGACAAGAAACGGTCCGAATTAAACAAGAAACGAATGCAAAACGCTTCTCGATCATGAATCCAATTCGATACATGCTACGCGAACAGAGGATCCCATGTCTGCTGATCGGAATCGCCATTCCAGCTCTGCTGTTCAACGTTTCTATTCCCTTACCTTCATCGCTGCAAGTTGAACAGATCTACGATTCGCTTCCCATCACCGATTCCACTCTCATACCTCGTCGTATCGCTTATGAGGTTCATGCCAAAGGATCGTA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

384 aa · TkA07G356510|TK1151|PROTEIN

MRQETVRIKQETNAKRFSIMNPIRYMLREQRIPCLLIGIAIPALLFNVSIPLPSSLQVEQIYDSLPITDSTLIPRRIAYEVHAKGSYNINIGGRIPLGLKTKSQRVLVTGGAGFVGSHLVDRLLARGDSVIVVDNFFTGRKDNLLHHLRNPRDHKTNVVGTLNMLGLAKRINARFLLTSTSEVYGDPLEHPQVETYWGNVNPIGVRSCYDEGKRVAETLTMDYHRGLNIEVRIARIFNTYGPRMCLDDGRVVSNFVAQAL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G356510
TK1151 IDTkA07G356510
OH-1004 IDLXL04_029886
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)91.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G356510
位置Chr07:89277235-89279449 (-)
描述Similar to UXS2: UDP-glucuronic acid decarboxylase 2
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g62830 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。
Biosynthesis of UDP-xylose: characterization of membrane-bound AtUxs2.2005 · DOI: 10.1007/s00425-004-1471-7
At2g47650 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At3g53520 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At2g28760 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献
At3g46440 催化 UDP-葡萄糖醛酸向 UDP-木糖的 NAD 依赖性脱羧。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029886 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0019305 dTDP-rhamnose biosynthetic process 生物过程
GO:0033320 UDP-D-xylose biosynthetic process 生物过程
GO:0042732 D-xylose metabolic process 生物过程
GO:0045492 xylan biosynthetic process 生物过程
GO:0000138 Golgi trans cisterna 细胞组分
GO:0000139 Golgi membrane 细胞组分
GO:0000325 plant-type vacuole 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0005768 endosome 细胞组分
GO:0005773 vacuole 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005794 Golgi apparatus 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT2G28760
ath:AT2G47650
ath:AT3G46440
ath:AT3G53520
ath:AT3G62830
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

高尔基体0.323
排名 1 · TkA07G356510 · TK1151
内质网0.317
排名 2 · TkA07G356510 · TK1151
细胞质0.106
排名 3 · TkA07G356510 · TK1151
溶酶体／液泡0.070
排名 4 · TkA07G356510 · TK1151
细胞核0.069
排名 5 · TkA07G356510 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF04321RmlD_sub_bind105-133 aa
PF00106adh_short105-135 aa
PF01370Epimerase106-147 aa
PF02719Polysacc_synt_2106-132 aa
PF16363GDP_Man_Dehyd107-153 aa
PF010733Beta_HSD107-134 aa
PF07993NAD_binding_4108-130 aa
PF010733Beta_HSD151-222 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G356510PF04321RmlD_sub_bind1051334.8e-0729.8
TkA07G356510PF00106adh_short1051350.4210.8
TkA07G356510PF01370Epimerase1061474.8e-38131.6
TkA07G356510PF02719Polysacc_synt_21061320.01615.2
TkA07G356510PF16363GDP_Man_Dehyd1071534.5e-46158.6
TkA07G356510PF010733Beta_HSD1071348.9e-0728.9
TkA07G356510PF07993NAD_binding_41081302.6e-0834.1
TkA07G356510PF010733Beta_HSD1512228.9e-0728.9
TkA07G356510PF04321RmlD_sub_bind1523314.8e-0729.8
TkA07G356510PF01370Epimerase1543024.8e-38131.6
TkA07G356510PF16363GDP_Man_Dehyd1553634.5e-46158.6
TkA07G356510PF07993NAD_binding_41552362.6e-0834.1
TkA07G356510PF02719Polysacc_synt_21551800.01615.2
TkA07G356510PF02719Polysacc_synt_22093180.01615.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LZI2拟南芥sp|Q9LZI2|UXS2_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 268.400%Swiss-Prot高置信
Q8S8T4拟南芥sp|Q8S8T4|UXS4_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 467.200%Swiss-Prot高置信
Q8VZC0拟南芥sp|Q8VZC0|UXS1_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 160.900%Swiss-Prot高置信
Q9ZV36拟南芥sp|Q9ZV36|UXS6_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 663.100%Swiss-Prot高置信
Q9SN95拟南芥sp|Q9SN95|UXS5_ARATH UDP-glucuronic acid decarboxylase 561.800%Swiss-Prot高置信

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