TkA07G354230 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G354230

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 88608003-88608866 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

864 bp · TkA07G354230|TK1151|cDNA

ATGATGCCCCAAGGATACCTTTCGGCTTTCCCGATAATTGGGTCTTCCGATGATACTTATAGCAGATACTGGTCAACTGACACGTTATCTACGGATACAGAGTCGTTATACCTCAGCCCTAATGGGTCTCTGATTTTGGTGCAGTATAATGGTACAAGGATGGTGGTGAATAAACCAACGAGCTCAGAGTCGGGAATGGATTATGAAGCTGTGATCTTCCGTGCTACTCTCGATTGGGATGGTAACTTTGTTTTGTATTC...

CDS

下载 CDS FASTA

864 bp · TkA07G354230|TK1151|CDS

ATGATGCCCCAAGGATACCTTTCGGCTTTCCCGATAATTGGGTCTTCCGATGATACTTATAGCAGATACTGGTCAACTGACACGTTATCTACGGATACAGAGTCGTTATACCTCAGCCCTAATGGGTCTCTGATTTTGGTGCAGTATAATGGTACAAGGATGGTGGTGAATAAACCAACGAGCTCAGAGTCGGGAATGGATTATGAAGCTGTGATCTTCCGTGCTACTCTCGATTGGGATGGTAACTTTGTTTTGTATTC...

蛋白

下载蛋白 FASTA

287 aa · TkA07G354230|TK1151|PROTEIN

MMPQGYLSAFPIIGSSDDTYSRYWSTDTLSTDTESLYLSPNGSLILVQYNGTRMVVNKPTSSESGMDYEAVIFRATLDWDGNFVLYSHRFTNSSSVMKIEWKALQDPCQAKGICGFNSYCTSIDGEFQCHCLPGFVDLNDTRDVKYYGCYRNFTDEEACNRKGLELSYNVTELDNMDLLAYKSYSVMKLSKDDCRRSCFDDCNCWASLYYGDGNCKKLKVPIIFAVLNTTITSTVYVKTSFPKDEVKYGITPLPESTNLD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G354230`
TK1151 ID	TkA07G354230
OH-1004 ID	LXL04_029855
关系 / 置信度	序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)	97.900
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 97.909 / OH-1004 36.684 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID	`TkA07G354230`
位置	Chr07:88608003-88608866 (+)
描述	Similar to LECRK1: G-type lectin S-receptor-like serine/threonine-protein kinase LECRK1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献	下载当前基因文献拟南芥当前来源表未检出该物种的同源命中。水稻当前来源表未检出该物种的同源命中。
功能注释来源	查看注释来源功能注释来源：OH1004 · `LXL04_029855` · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。
GO 注释（OH1004 来源）	GO:0006952 defense response 生物过程 GO:0051707 response to other organism 生物过程 GO:0016020 membrane 细胞组分 GO:0004672 protein kinase activity 分子功能 GO:0004674 protein serine/threonine kinase activity 分子功能 GO:0005524 ATP binding 分子功能 GO:0030246 carbohydrate binding 分子功能 GO:0106310 protein serine kinase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用	dosa:Os04g0201900 dosa:Os04g0202500 以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞膜0.608

排名 1 · TkA07G354230 · TK1151

细胞外0.210

排名 2 · TkA07G354230 · TK1151

内质网0.086

排名 3 · TkA07G354230 · TK1151

细胞质0.081

排名 4 · TkA07G354230 · TK1151

溶酶体／液泡0.034

排名 5 · TkA07G354230 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01453B_lectin29-108 aa

PF00954S_locus_glycop30-50 aa

PF00954S_locus_glycop70-136 aa

PF01683EB102-140 aa

PF00008EGF105-136 aa

PF12947EGF_3111-136 aa

PF25478EGF_Mua-3113-142 aa

PF08276PAN_2114-122 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G354230	`PF01453`	B_lectin	29	108	0.25	12.5
TkA07G354230	`PF00954`	S_locus_glycop	30	50	9e-06	26.9
TkA07G354230	`PF00954`	S_locus_glycop	70	136	9e-06	26.9
TkA07G354230	`PF01683`	EB	102	140	0.078	13.8
TkA07G354230	`PF00008`	EGF	105	136	0.025	15.6
TkA07G354230	`PF12947`	EGF_3	111	136	0.0053	17.7
TkA07G354230	`PF25478`	EGF_Mua-3	113	142	0.045	14.5
TkA07G354230	`PF08276`	PAN_2	114	122	0.0029	18.4
TkA07G354230	`PF08276`	PAN_2	153	162	0.0029	18.4
TkA07G354230	`PF08276`	PAN_2	171	206	0.0029	18.4
TkA07G354230	`PF08277`	PAN_3	181	216	0.0089	16.6
TkA07G354230	`PF01683`	EB	197	210	0.078	13.8
TkA07G354230	`PF12947`	EGF_3	202	214	0.0053	17.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

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