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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G350920
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 87677920-87679533 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1614 bp · TkA07G350920|TK1151|cDNA

ATGATGCAGATCGGTGCAACACTTCCGGCGAACAATATTCACATGTTTCAGGGAAGACACTTTTCCGGTGGCTTTAGTTATAGGTCATCGTTGAATCCTTCTGGAAGAGAGCGTTCCACGAAGAACATGATGAAAGCCACCACCGTGTCGGCCGCCGTATCAACCCGCCAACACATCTCTAATCTTGACAAATTACTCGGTACAGAAGTACCGCAGGTGATTCTGACTGAGCCGGAACTCGCTAAGGAGGATATTTCCGA...

CDS

下载 CDS FASTA

1614 bp · TkA07G350920|TK1151|CDS

ATGATGCAGATCGGTGCAACACTTCCGGCGAACAATATTCACATGTTTCAGGGAAGACACTTTTCCGGTGGCTTTAGTTATAGGTCATCGTTGAATCCTTCTGGAAGAGAGCGTTCCACGAAGAACATGATGAAAGCCACCACCGTGTCGGCCGCCGTATCAACCCGCCAACACATCTCTAATCTTGACAAATTACTCGGTACAGAAGTACCGCAGGTGATTCTGACTGAGCCGGAACTCGCTAAGGAGGATATTTCCGA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

537 aa · TkA07G350920|TK1151|PROTEIN

MMQIGATLPANNIHMFQGRHFSGGFSYRSSLNPSGRERSTKNMMKATTVSAAVSTRQHISNLDKLLGTEVPQVILTEPELAKEDISDHESLDNRGKGLLGGLNLSQIWPENKAAEEMSPRHLNRLRRLLSKNGIEYSPRNSLASRWREYHGSNNWSGLLDPLDENLRREMIRYGEFIQAAYHCFHSDPATSAYEAPSPRHVALPDKSYRVTKNLYATSSVGLPKWVDKLAPGLDWMSQRSSCIGYVAVCDDQREIARMGR...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G350920
TK1151 IDTkA07G350920
OH-1004 IDLXL04_029828
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)99.800
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G350920
位置Chr07:87677920-87679533 (+)
描述Similar to At4g16820: Phospholipase A1-Ibeta2, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g16820 酰基水解酶，催化磷脂酰胆碱在 sn-1 位的水解。 暂无已核实直接文献
At2g44810 Sn-1 特异性磷脂酶，可从磷脂中释放游离脂肪酸。 暂无已核实直接文献
At1g51440 酰基水解酶，催化磷脂酰胆碱在 sn-1 位的水解。 暂无已核实直接文献
At1g06800 具有广泛特异性的酰基水解酶。
DONGLE and DEFECTIVE IN ANTHER DEHISCENCE1 lipases are not essential for wound- and pathogen-induced jasmonate biosynthesis: redundant lipases contribute to jasmonate formation.2010 · DOI: 10.1104/pp.110.155093
At2g30550 广谱脂酰水解酶。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029828 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009611 response to wounding 生物过程
GO:0009695 jasmonic acid biosynthetic process 生物过程
GO:0009901 anther dehiscence 生物过程
GO:0010152 pollen maturation 生物过程
GO:0016042 lipid catabolic process 生物过程
GO:0043068 positive regulation of programmed cell death 生物过程
GO:0005576 extracellular region 细胞组分
GO:0005737 cytoplasm 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0004620 glycerophospholipase activity 分子功能
GO:0004806 triacylglycerol lipase activity 分子功能
GO:0008970 glycerophospholipid phospholipase A1 activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G06800
ath:AT1G51440
ath:AT2G30550
ath:AT2G44810
ath:AT4G16820
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.974
排名 1 · TkA07G350920 · TK1151
线粒体0.037
排名 2 · TkA07G350920 · TK1151
细胞质0.030
排名 3 · TkA07G350920 · TK1151
细胞核0.023
排名 4 · TkA07G350920 · TK1151
过氧化物酶体0.020
排名 5 · TkA07G350920 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF12697Abhydrolase_6212-254 aa
PF11187Mbeg1-like258-280 aa
PF01764Lipase_3264-411 aa
PF05057DUF676313-396 aa
PF12146Hydrolase_4314-358 aa
PF12697Abhydrolase_6316-367 aa
PF00975Thioesterase319-360 aa
PF07819PGAP1319-356 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G350920PF12697Abhydrolase_62122540.03115.6
TkA07G350920PF11187Mbeg1-like2582800.1312.4
TkA07G350920PF01764Lipase_32644116.5e-34117.5
TkA07G350920PF05057DUF6763133960.06313.5
TkA07G350920PF12146Hydrolase_43143580.3211.0
TkA07G350920PF12697Abhydrolase_63163670.03115.6
TkA07G350920PF00975Thioesterase3193600.1712.8
TkA07G350920PF07819PGAP13193560.3411.3
TkA07G350920PF11187Mbeg1-like3233790.1312.4
TkA07G350920PF06259Abhydrolase_83264100.05713.8
TkA07G350920PF11187Mbeg1-like5025230.1312.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O23522拟南芥sp|O23522|PLA14_ARATH Phospholipase A1-Ibeta2, chloroplastic59.600%Swiss-Prot高置信
Q948R1拟南芥sp|Q948R1|PLA11_ARATH Phospholipase A(1) DAD1, chloroplastic51.600%Swiss-Prot中等置信
Q9C8J6拟南芥sp|Q9C8J6|PLA17_ARATH Phospholipase A1-Igamma3, chloroplastic44.400%Swiss-Prot中等置信
Q941F1拟南芥sp|Q941F1|PLA15_ARATH Phospholipase A1-Igamma1, chloroplastic41.200%Swiss-Prot中等置信
Q3EBR6拟南芥sp|Q3EBR6|PLA16_ARATH Phospholipase A1-Igamma2, chloroplastic40.400%Swiss-Prot中等置信

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