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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G337730
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 84372947-84375844 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

1919 bp · TkA07G337730|TK1151|cDNA

TAAATATAGCAGTAGGCGGCAAGACAGCGAAAAGCGTGCTTCAGTGCTTTTGTATTTTTAGAGAGAGAGAGACAGAACTCCATCTTTCATGGCGAATTAGTCTGTTTAGTGAAGAATTTCTTCTATATTGGGCTACATTTATTTGTTGAAAGTGTCTCTACTACTAAAAATAGTTTAAATCAGGAGTTAGATATTAGGACTTTCTCTGTTATTTTCTGCATATATTAAAGACGACGACGGAGAACAGAATCATAAAGAAG...

CDS

下载 CDS FASTA

1326 bp · TkA07G337730|TK1151|CDS

ATGATGCAGATGGATCGGAGACAGTGCTCAGATGAGTTTGAAAAACTTCTCATCCGAATGAACACTCCAAGGGTAATGACCGACAACGCCAGCTGTCTAAACGCAACTCGCGTCATGATCGACAGTGCAAGAAAAGATGAAATTTTGCTGGAGGCGGTACAAGTTCTCACAGATCTAAACCTTTCCATCAAAAAAGGTTACGTTTCCTCTGACGGAAGGTGGAACATGGACGTCTTCCATGTGACTGATTTGGACGGCAA...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

441 aa · TkA07G337730|TK1151|PROTEIN

MMQMDRRQCSDEFEKLLIRMNTPRVMTDNASCLNATRVMIDSARKDEILLEAVQVLTDLNLSIKKGYVSSDGRWNMDVFHVTDLDGNKLTDDNIINCIEQSLETIHNKRSNSIDGMTALELTGTDRIGLLSEVFAVLSDLKCDVVESKVWTHNGRIASLIYLKDTESGFQIEDSNKIDKIKARLRNVLKGDNDIRSAKTSVSIAVTHMERRLHQMMFADRDYARKMELKMENSPLVSVQNCLDKGYSVLNIKSKDRPKLL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G337730
TK1151 IDTkA07G337730
OH-1004 IDLXL04_029704
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Probable
蛋白一致性 (%)92.600
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G337730
位置Chr07:84372947-84375844 (+)
描述Similar to ACR8: ACT domain-containing protein ACR8
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g12420 可能结合氨基酸。
Molecular characterization of a novel gene family encoding ACT domain repeat proteins in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.007484
At4g22780 可能结合氨基酸。 暂无已核实直接文献
At1g69040 可能结合氨基酸。 暂无已核实直接文献
At3g01990 可能结合氨基酸。 暂无已核实直接文献
At1g76990 可能结合氨基酸。
Molecular characterization of a novel gene family encoding ACT domain repeat proteins in Arabidopsis.2002 · DOI: 10.1104/pp.007484

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029704 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006521 regulation of amino acid metabolic process 生物过程
GO:0009735 response to cytokinin 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:0005829 cytosol 细胞组分
GO:0009506 plasmodesma 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0016597 amino acid binding 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G12420
ath:AT1G69040
ath:AT3G01990
ath:AT4G22780
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.507
排名 1 · TkA07G337730 · TK1151
细胞核0.395
排名 2 · TkA07G337730 · TK1151
细胞膜0.136
排名 3 · TkA07G337730 · TK1151
溶酶体／液泡0.064
排名 4 · TkA07G337730 · TK1151
内质网0.044
排名 5 · TkA07G337730 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF24931ACT_ACR9_3rd25-103 aa
PF26956ACT_ACR_D131-106 aa
PF13291ACT_437-72 aa
PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant42-71 aa
PF01842ACT48-88 aa
PF24914ACR10_N54-87 aa
PF26956ACT_ACR_D1116-184 aa
PF24931ACT_ACR9_3rd116-188 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G337730PF24931ACT_ACR9_3rd251037.1e-1865.2
TkA07G337730PF26956ACT_ACR_D1311061.3e-46157.0
TkA07G337730PF13291ACT_437724.9e-1143.8
TkA07G337730PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant42713.1e-1040.7
TkA07G337730PF01842ACT48885.2e-2897.2
TkA07G337730PF24914ACR10_N54873.4e-0730.3
TkA07G337730PF26956ACT_ACR_D11161841.3e-46157.0
TkA07G337730PF24931ACT_ACR9_3rd1161887.1e-1865.2
TkA07G337730PF13291ACT_41171874.9e-1143.8
TkA07G337730PF01842ACT1181675.2e-2897.2
TkA07G337730PF24926ACT_ACR9_C1181530.0002321.7
TkA07G337730PF22754bHLH-TF_ACT-like_plant1191823.1e-1040.7
TkA07G337730PF22629ACT_AHAS_ss1191620.002118.9
TkA07G337730PF13740ACT_61201573e-0834.1
TkA07G337730PF24914ACR10_N1241523.4e-0730.3
TkA07G337730PF24931ACT_ACR9_3rd2363177.1e-1865.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9LNA5拟南芥sp|Q9LNA5|ACR8_ARATH ACT domain-containing protein ACR863.200%Swiss-Prot高置信
Q8LJW1拟南芥sp|Q8LJW1|ACR7_ARATH ACT domain-containing protein ACR760.000%Swiss-Prot高置信
Q8LJW3拟南芥sp|Q8LJW3|ACR4_ARATH ACT domain-containing protein ACR450.100%Swiss-Prot高置信
Q9SGA0拟南芥sp|Q9SGA0|ACR6_ARATH ACT domain-containing protein ACR652.100%Swiss-Prot高置信
O49285拟南芥sp|O49285|ACR3_ARATH ACT domain-containing protein ACR347.400%Swiss-Prot中等置信

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