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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G336580
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 84046610-84052284 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

3161 bp · TkA07G336580|TK1151|cDNA

TAGAAACAGAACAAAGAAAAATCAAACCAACCGAAAAGCTGTGACGAGTCTGACTCATCTTTCATTCTCACCTCTCTAAATTCTTCTCATTTCTGTGATATATATATATATATATATACTCTCTAAGATTGCACGCAGAAACCCACTAAAGATTGCAGAAACACATATTCGTAGGTATTCTTTGATGGTGGAACTTCCGACCCGAATTGGGATTCTTCCGTTCAGGAACAAAGTTTTGTTGCCTGGCGCAATCATCCGAA...

CDS

下载 CDS FASTA

2568 bp · TkA07G336580|TK1151|CDS

ATGGTGGAACTTCCGACCCGAATTGGGATTCTTCCGTTCAGGAACAAAGTTTTGTTGCCTGGCGCAATCATCCGAATTCAATGCACTTCTCCGAGCAGTGTGAAATTGGTGGAACAAGAATTATGGCAGAGGGAGGAGAAAGGGTTGATTGGCATTCTGCCTGTTCGAGATATTGCCGAGGGTTCCATAGTGACACAAGGAGCTGATTTGGGTGATAAAAGCTCCAAGAATCAACAAGTCAAATCAGATTCTCACAAACT...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

855 aa · TkA07G336580|TK1151|PROTEIN

MVELPTRIGILPFRNKVLLPGAIIRIQCTSPSSVKLVEQELWQREEKGLIGILPVRDIAEGSIVTQGADLGDKSSKNQQVKSDSHKLDGKNQQEPNWHTRGVAARALHLSRGVEKPSGRVTYIVVLEGLSRFSVEELNTRGTYTTARISPLDMTKTEMEQIEQDADFIALSRQFKLTAMELITALEQKQKTGGRTKVLLETVPVHKLADIFVASFEISFEEQLAMLDSVDVKVRLSKATELVDRHLQMRAIKEELGDNDD...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G336580
TK1151 IDTkA07G336580
OH-1004 IDLXL04_029688
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)96.400
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G336580
位置Chr07:84046610-84052284 (-)
描述Similar to Lon protease homolog 2, peroxisomal
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g47040 ATP依赖性丝氨酸蛋白酶，通过选择性降解过度折叠和未组装的多肽，作用于过氧化物酶体基质（通过相似性）。
Arabidopsis LON2 is necessary for peroxisomal function and sustained matrix protein import.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.142505

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
UniProt: B8BDV1 ATP 依赖性丝氨酸蛋白酶，介导过氧化物酶体基质中错误折叠和未组装多肽的选择性降解。 暂无已核实直接文献
Os09g0533400 ATP 依赖性丝氨酸蛋白酶，介导过氧化物酶体基质中错误折叠和未组装多肽的选择性降解。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029688 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0006515 protein quality control for misfolded or incompletely synthesized proteins 生物过程
GO:0006625 protein targeting to peroxisome 生物过程
GO:0009408 response to heat 生物过程
GO:0016485 protein processing 生物过程
GO:0016558 protein import into peroxisome matrix 生物过程
GO:0016560 protein import into peroxisome matrix, docking 生物过程
GO:0032042 mitochondrial DNA metabolic process 生物过程
GO:0048527 lateral root development 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005777 peroxisome 细胞组分
GO:0005782 peroxisomal matrix 细胞组分
GO:0070013 intracellular organelle lumen 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT5G47040
dosa:Os09g0533400
zma:732820
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

过氧化物酶体0.430
排名 1 · TkA07G336580 · TK1151
细胞质0.234
排名 2 · TkA07G336580 · TK1151
线粒体0.202
排名 3 · TkA07G336580 · TK1151
细胞核0.121
排名 4 · TkA07G336580 · TK1151
质体0.076
排名 5 · TkA07G336580 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF02190LON_substr_bdg10-244 aa
PF07728AAA_5116-170 aa
PF00005ABC_tran117-117 aa
PF13207AAA_17163-225 aa
PF13476AAA_23184-270 aa
PF00931NB-ARC244-269 aa
PF03193RsgA_GTPase328-393 aa
PF01695IstB_IS21329-400 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G336580PF02190LON_substr_bdg102449.3e-29101.5
TkA07G336580PF07728AAA_51161701.4e-0835.5
TkA07G336580PF00005ABC_tran1171170.1813.1
TkA07G336580PF13207AAA_171632250.9510.5
TkA07G336580PF13476AAA_231842700.07614.4
TkA07G336580PF00931NB-ARC2442690.06413.5
TkA07G336580PF03193RsgA_GTPase3283930.005617.2
TkA07G336580PF01695IstB_IS213294000.01215.8
TkA07G336580PF08298AAA_PrkA3373880.001318.5
TkA07G336580PF05496RuvB_N3384010.0004320.8
TkA07G336580PF00931NB-ARC3583850.06413.5
TkA07G336580PF24883NPHP3_N3603880.03615.0
TkA07G336580PF13476AAA_233633950.07614.4
TkA07G336580PF13191AAA_163653930.03415.4
TkA07G336580PF20720nSTAND33653870.03914.4
TkA07G336580PF13401AAA_223664410.02715.5

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
O64948拟南芥sp|O64948|LONP2_ARATH Lon protease homolog 2, peroxisomal75.900%Swiss-Prot高置信
B8BDV1水稻sp|B8BDV1|LONP2_ORYSI Lon protease homolog 2, peroxisomal75.700%Swiss-Prot高置信
Q0J032水稻sp|Q0J032|LONP2_ORYSJ Lon protease homolog 2, peroxisomal75.400%Swiss-Prot高置信

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