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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G317470
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 79575542-79576659 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

980 bp · TkA07G317470|TK1151|cDNA

CGCGGGTACCCCACTAGTAGAAAAAAACGTCAATATCAAATTTAAGAATAAAGTAGCAAGAAATGGATGAGTGGCTATCCCCACTGCCATTTTCCAACATTACAAGATTTAGACGGACACCGCCGTCGCCGTTCTTCCGCCCCTTTTCTATAAATTGCTGCCGGATTCCATTCTTTCACGTGATCCAAATATATATCCATGGGGTTTTGGTATCTAGCAATCAAGATTCCGCAAGCACTCACCATGACAGTCTTCGCAAA...

CDS

下载 CDS FASTA

516 bp · TkA07G317470|TK1151|CDS

ATGGGGTTTTGGTATCTAGCAATCAAGATTCCGCAAGCACTCACCATGACAGTCTTCGCAAACTTAGCATCTCATCTCGTATCACTCCTACTAGCAGCACTTTCTCATGTGGGCCTTTTCAAATCGCCGCCCGATCCCGACGATTACACCTCCTCCTCCGCCAACTACGTCCTCATCTTAGACGGCTCCTCCCCTTCCCTCCTCCCTGTCCCCGTCCACGTCGTGACGGCCTCCATTAAAGCTAAAGTGCCAATCATACC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

171 aa · TkA07G317470|TK1151|PROTEIN

MGFWYLAIKIPQALTMTVFANLASHLVSLLLAALSHVGLFKSPPDPDDYTSSSANYVLILDGSSPSLLPVPVHVVTASIKAKVPIIPYSDFVYSHGGSETAACSVCLECIDATHLIRELLNCKHVFHRECLDRWVDEGQVTCPLCRSMLLPPKKLLPSSSALVTSTAADCH

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G317470
TK1151 IDTkA07G317470
OH-1004 IDLXL04_029437
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)100.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 100.000
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G317470
位置Chr07:79575542-79576659 (-)
描述Similar to BRH1: Brassinosteroid-responsive RING protein 1
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At3g61460 可能参与油菜素甾醇信号通路并调节莲座叶的生长发育。
Characterisation of BRH1, a brassinosteroid-responsive RING-H2 gene from Arabidopsis thaliana.2002 · DOI: 10.1007/s00425-001-0723-z
Overexpressed BRH1, a RING finger gene, alters rosette leaf shape in Arabidopsis thaliana.2018 · DOI: 10.1007/s11427-017-9133-8
At2g01150 E3 泛素蛋白连接酶参与种子萌发和幼苗早期发育过程中脱落酸 信号传导的正向调节以及对盐和渗透胁迫的反应。
The Arabidopsis RING finger E3 ligase RHA2b acts additively with RHA2a in regulating abscisic acid signaling and drought response.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.176214
At5g05810 RING-H2 指蛋白 ATL43。 暂无已核实直接文献
At1g15100 E3 泛素蛋白连接酶参与种子萌发和早期幼苗发育过程中脱落酸 信号传导以及对盐和渗透胁迫的反应的正向调节。
The Arabidopsis RING finger E3 ligase RHA2a is a novel positive regulator of abscisic acid signaling during seed germination and early seedling development.2009 · DOI: 10.1104/pp.109.135269
The Arabidopsis RING finger E3 ligase RHA2b acts additively with RHA2a in regulating abscisic acid signaling and drought response.2011 · DOI: 10.1104/pp.111.176214
At2g42360 E3泛素蛋白连接酶，能够与泛素结合酶E2 UBC8、UBC10、UBC11、UBC28、UBC29、UBC30、UBC35和UBC36在体外催化多泛素化反应。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029437 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程
GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程
GO:0009789 positive regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程
GO:0010200 response to chitin 生物过程
GO:0016567 protein ubiquitination 生物过程
GO:0033591 response to L-ascorbic acid 生物过程
GO:0047484 regulation of response to osmotic stress 生物过程
GO:0071456 cellular response to hypoxia 生物过程
GO:1901371 regulation of leaf morphogenesis 生物过程
GO:1905421 regulation of plant organ morphogenesis 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G22500
ath:AT2G01150
ath:AT3G61460
ath:AT4G11360
ath:AT4G11370
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

内质网0.282
排名 1 · TkA07G317470 · TK1151
细胞核0.265
排名 2 · TkA07G317470 · TK1151
细胞质0.249
排名 3 · TkA07G317470 · TK1151
细胞膜0.206
排名 4 · TkA07G317470 · TK1151
溶酶体／液泡0.170
排名 5 · TkA07G317470 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF18279zf-WRNIP1_ubi19-26 aa
PF14447Prok-RING_497-113 aa
PF14446Prok-RING_1100-133 aa
PF05883Baculo_RING100-137 aa
PF17120zf-RING_16101-143 aa
PF13639zf-RING_2102-146 aa
PF12861zf-ANAPC11102-148 aa
PF00097zf-C3HC4103-145 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G317470PF18279zf-WRNIP1_ubi19261.010.9
TkA07G317470PF14447Prok-RING_4971130.1213.0
TkA07G317470PF14446Prok-RING_11001330.02915.3
TkA07G317470PF05883Baculo_RING1001370.2212.2
TkA07G317470PF17120zf-RING_161011430.0009819.4
TkA07G317470PF13639zf-RING_21021463.2e-1040.8
TkA07G317470PF12861zf-ANAPC111021482.3e-0525.0
TkA07G317470PF00097zf-C3HC41031454.3e-0833.6
TkA07G317470PF13923zf-C3HC4_21031451.3e-0732.0
TkA07G317470PF13445zf-RING_UBOX1031433.4e-0730.8
TkA07G317470PF14634zf-RING_51031468.5e-0523.2
TkA07G317470PF17123zf-RING_111031310.0001322.3
TkA07G317470PF15227zf-C3HC4_41031120.00817.0
TkA07G317470PF14570zf-RING_41031470.01316.0
TkA07G317470PF25998U-box_ZFPL11031640.02715.5
TkA07G317470PF13920zf-C3HC4_31031470.04714.2

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9XF92拟南芥sp|Q9XF92|BRH1_ARATH Brassinosteroid-responsive RING protein 143.800%Swiss-Prot低置信
Q9ZU51拟南芥sp|Q9ZU51|RHA2B_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase RHA2B41.000%Swiss-Prot低置信
Q5EAE9拟南芥sp|Q5EAE9|ATL43_ARATH RING-H2 finger protein ATL4340.800%Swiss-Prot低置信
Q9ZT50拟南芥sp|Q9ZT50|RHA2A_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase RHA2A43.600%Swiss-Prot低置信
Q9SLC3拟南芥sp|Q9SLC3|ATL41_ARATH E3 ubiquitin-protein ligase ATL4143.600%Swiss-Prot低置信

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