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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G307210
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 77108426-77112493 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

2414 bp · TkA07G307210|TK1151|cDNA

AGCATAAAAACAATCAACAGACGACACAGATGTTTCTAAATTCTTTGAATCATAGAGGATTGTCTTAATTTTGATTTTTGATAATGGCGTTGATTGTGAACAATTTCACTGTTCCAATATCACCCCTGTTATCTCTAAAAGAGAACCCTAGGTTGCGTTCACATGTTGTGATTAGGAGTGAGGTACCACGGGCTTCATCTGTTAACAAGAAGGATACTGATGTAGCTTCAGAAGAGTTATTGGAAGCTTTGTGGGATGAT...

2025 bp · TkA07G307210|TK1151|CDS

ATGGCGTTGATTGTGAACAATTTCACTGTTCCAATATCACCCCTGTTATCTCTAAAAGAGAACCCTAGGTTGCGTTCACATGTTGTGATTAGGAGTGAGGTACCACGGGCTTCATCTGTTAACAAGAAGGATACTGATGTAGCTTCAGAAGAGTTATTGGAAGCTTTGTGGGATGATGGATATGGGACTCAAACTGCGAAGGATTACGCCTACATAGCCATGGATTTGATTAAACATGATGGAGGACCACCTAGGTGGTT...

674 aa · TkA07G307210|TK1151|PROTEIN

MALIVNNFTVPISPLLSLKENPRLRSHVVIRSEVPRASSVNKKDTDVASEELLEALWDDGYGTQTAKDYAYIAMDLIKHDGGPPRWFCPIACGIPLKDSPILLYIPGIDGTGTGLVVHEKALGKVFHVQCLHIPVQDRTPLEGLIQIVEEAIKIENKLSPNKPIYILGESFGGALALAIAARNPKIDLILILANPATSFERSQAYPVYPLLKALPQEHYTMFSYLMPPLLGDFIKVAMVPMDANGANDLSSYLQFVVNFT...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G307210
TK1151 IDTkA07G307210
OH-1004 IDLXL04_029367
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)97.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 96.588 / OH-1004 93.599
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G307210
位置Chr07:77108426-77112493 (-)
描述Similar to At1g54570: Acyltransferase-like protein At1g54570, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g54570 酰基转移酶参与叶绿体中脂肪酸植酯的合成,这是在非生物胁迫和衰老期间维持光合膜完整性所需的过程。
At3g26840 参与叶绿体内脂肪酸植醇酯合成的酰基转移酶,该过程对于在非生物胁迫和衰老期间维持光合膜完整性是必需的。

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_029367 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0006995 cellular response to nitrogen starvation 生物过程
GO:0010150 leaf senescence 生物过程
GO:0010866 regulation of triglyceride biosynthetic process 生物过程
GO:0019432 triglyceride biosynthetic process 生物过程
GO:0033306 phytol metabolic process 生物过程
GO:0090693 plant organ senescence 生物过程
GO:1904963 regulation of phytol biosynthetic process 生物过程
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0010287 plastoglobule 细胞组分
GO:0016020 membrane 细胞组分
GO:0004144 diacylglycerol O-acyltransferase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT1G54570
ath:AT3G26840
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

质体0.941
排名 1 · TkA07G307210 · TK1151
线粒体0.055
排名 2 · TkA07G307210 · TK1151
细胞质0.033
排名 3 · TkA07G307210 · TK1151
细胞核0.025
排名 4 · TkA07G307210 · TK1151
过氧化物酶体0.020
排名 5 · TkA07G307210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00975Thioesterase136-182 aa
PF12697Abhydrolase_6140-345 aa
PF00561Abhydrolase_1142-346 aa
PF00326Peptidase_S9145-186 aa
PF12695Abhydrolase_5148-194 aa
PF12146Hydrolase_4153-346 aa
PF07859Abhydrolase_3156-199 aa
PF05448AXE1161-190 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G307210PF00975Thioesterase1361820.005817.6
TkA07G307210PF12697Abhydrolase_61403453.7e-0731.7
TkA07G307210PF00561Abhydrolase_11423464.7e-0937.0
TkA07G307210PF00326Peptidase_S91451860.0116.1
TkA07G307210PF12695Abhydrolase_51481940.01116.2
TkA07G307210PF12146Hydrolase_41533469.6e-1348.7
TkA07G307210PF07859Abhydrolase_31561990.04514.2
TkA07G307210PF05448AXE11611900.1811.3
TkA07G307210PF08840BAAT_C1632060.001619.2
TkA07G307210PF12695Abhydrolase_52823400.01116.2
TkA07G307210PF00326Peptidase_S92943430.0116.1
TkA07G307210PF08840BAAT_C2983420.001619.2
TkA07G307210PF07859Abhydrolase_33003420.04514.2
TkA07G307210PF01553Acyltransferase4085380.0001922.0
TkA07G307210PF03982DAGAT4705481.8e-0834.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9ZVN2拟南芥sp|Q9ZVN2|PES1_ARATH Phytyl ester synthase 1, chloroplastic50.200%Swiss-Prot高置信
Q9LW26拟南芥sp|Q9LW26|PES2_ARATH Phytyl ester synthase 2, chloroplastic44.400%Swiss-Prot中等置信

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