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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G301680
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 75786981-75787418 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

384 bp · TkA07G301680|TK1151|cDNA

ATGGCACAGACACCACAAAGTGCACCACCGGCACCCAAGGTCAGCACCAAATTCTCTGATGTGTTGGCGTTCAGTGGGCCTGCACCGGAGAGGATCAACGGAAGGCTGGCAATGATCGGGTTTGTGTCTGCCATGGCGGTGGAAGCAAGCAGCGGTCAGGACGTGTTTACCCAGATCGGCCATGGCGGAGTGGCGGTGTTTGTGGGGACCAGCGTACTCTTGTCAATAGCCTCGTTAGTGCCCTTGTTTAAAGGGGTGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

384 bp · TkA07G301680|TK1151|CDS

ATGGCACAGACACCACAAAGTGCACCACCGGCACCCAAGGTCAGCACCAAATTCTCTGATGTGTTGGCGTTCAGTGGGCCTGCACCGGAGAGGATCAACGGAAGGCTGGCAATGATCGGGTTTGTGTCTGCCATGGCGGTGGAAGCAAGCAGCGGTCAGGACGTGTTTACCCAGATCGGCCATGGCGGAGTGGCGGTGTTTGTGGGGACCAGCGTACTCTTGTCAATAGCCTCGTTAGTGCCCTTGTTTAAAGGGGTGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

127 aa · TkA07G301680|TK1151|PROTEIN

MAQTPQSAPPAPKVSTKFSDVLAFSGPAPERINGRLAMIGFVSAMAVEASSGQDVFTQIGHGGVAVFVGTSVLLSIASLVPLFKGVTVQSKSSGVMTSDAELWNGRFAMLGLVALAFTEYVTGSALV

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G301680
TK1151 IDTkA07G301680
OH-1004 IDLXL04_029314
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)86.200
蛋白覆盖度 (%)TK1151 100.000 / OH-1004 85.294
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G301680
位置Chr07:75786981-75787418 (+)
描述Similar to ELIP1: Early light-induced protein 1, chloroplastic
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At4g14690 可能参与色素整合到成熟的捕光色素-蛋白质复合物中。
Mutational and expression analysis of ELIP1 and ELIP2 in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-4090-1
Suppression of both ELIP1 and ELIP2 in Arabidopsis does not affect tolerance to photoinhibition and photooxidative stress.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.083055
The light stress-induced protein ELIP2 is a regulator of chlorophyll synthesis in Arabidopsis thaliana.2007 · DOI: 10.1111/j.1365-313x.2007.03090.x
Inactivation of the ELIP1 and ELIP2 genes affects Arabidopsis seed germination.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03637.x
At3g22840 通过抑制整个叶绿素生物合成途径（例如 5-氨基乙酰丙酸合成和 Mg-原卟啉 IX 金属酶活性），防止游离叶绿素过量积累，并因此防止光氧化应激（通过相似性推测）。
Early light-induced proteins protect Arabidopsis from photooxidative stress.2003 · DOI: 10.1073/pnas.0736939100
Mutational and expression analysis of ELIP1 and ELIP2 in Arabidopsis thaliana.2005 · DOI: 10.1007/s11103-005-4090-1
Suppression of both ELIP1 and ELIP2 in Arabidopsis does not affect tolerance to photoinhibition and photooxidative stress.2006 · DOI: 10.1104/pp.106.083055
Inactivation of the ELIP1 and ELIP2 genes affects Arabidopsis seed germination.2011 · DOI: 10.1111/j.1469-8137.2010.03637.x

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029314 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009416 response to light stimulus 生物过程
GO:0010030 positive regulation of seed germination 生物过程
GO:0010114 response to red light 生物过程
GO:0010117 photoprotection 生物过程
GO:0010218 response to far red light 生物过程
GO:0010224 response to UV-B 生物过程
GO:0010380 regulation of chlorophyll biosynthetic process 生物过程
GO:0015979 photosynthesis 生物过程
GO:0034605 cellular response to heat 生物过程
GO:0071483 cellular response to blue light 生物过程
GO:0071486 cellular response to high light intensity 生物过程
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G22840
ath:AT4G14690
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

质体0.749
排名 1 · TkA07G301680 · TK1151
线粒体0.242
排名 2 · TkA07G301680 · TK1151
细胞质0.016
排名 3 · TkA07G301680 · TK1151
细胞核0.015
排名 4 · TkA07G301680 · TK1151
内质网0.010
排名 5 · TkA07G301680 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00504Chloroa_b-bind28-81 aa
PF31213HliA29-56 aa
PF00504Chloroa_b-bind89-119 aa
PF31213HliA93-126 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G301680PF00504Chloroa_b-bind28812.6e-1041.8
TkA07G301680PF31213HliA29561.1e-1764.4
TkA07G301680PF00504Chloroa_b-bind891192.6e-1041.8
TkA07G301680PF31213HliA931261.1e-1764.4

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q94K66拟南芥sp|Q94K66|ELIP2_ARATH Early light-induced protein 2, chloroplastic71.900%Swiss-Prot高置信
P93735拟南芥sp|P93735|ELIP1_ARATH Early light-induced protein 1, chloroplastic75.000%Swiss-Prot高置信

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