TkA07G297130 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G297130

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 74608388-74610871 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1869 bp · TkA07G297130|TK1151|cDNA

GAAAAGATTAGCGTTGCTAAATTAGTTAACTACTGCCGACAACAACCACAGATAGACAAACAGTTCGACATTTTCACATTATTAACGCCGTCAAAACTTAAAAGGACTCAAGCCACAACCAAGTGACCAACAGCCAAGATTAACAGCATCCCCGTTCATCGGACAGCCAACCTCCGCCATTGACCATCGTCATCAGTCCATCATCAAAAGTCTCAGTCAGTAGACTTCATATGTAACATTTCTTTGATCCCCCTGTAATG...

CDS

下载 CDS FASTA

1518 bp · TkA07G297130|TK1151|CDS

ATGTCTTCCATGGAGGAGTTTGATCACCTCAAAATCCAGCTCAAAGATATAATATCAGCCACCGACAACTTCAGTCCCAACAATTTAATCGGACATGGAGGGTTTGGAGCTGTGTACAAAGGACCTCTCTCTCTCCCAGAGGGACAAATCATGGTCGCTTTTAAACGCTTAGATCGAAAACTCGGGCAAGGCAATATCGAGTTTTGGAAGGAAATCATAATGCTTTCCAAATACCGACATGAAAATTTAGTCCCACTAAT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

505 aa · TkA07G297130|TK1151|PROTEIN

MSSMEEFDHLKIQLKDIISATDNFSPNNLIGHGGFGAVYKGPLSLPEGQIMVAFKRLDRKLGQGNIEFWKEIIMLSKYRHENLVPLMNFCIEGDERILVYEYASRGSLDRYLTDINVSWIQRLKICVGAARALKFLHDPMETQQRVIHRDIKSSNILLDENWTAKVSDFGLSKVGPANQPQTYVFSNVVGTPGYCDPLYFETGFLSKESDVYSFGVVLFEVMCGKLCYEYANGKITDILVPKWKKCYEEKRLDEIIFHSL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G297130`
TK1151 ID	TkA07G297130
OH-1004 ID	LXL04_029287
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	99.300
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 90.099 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G297130

位置 Chr07:74608388-74610871 (+)

描述 Similar to At5g39000: Putative receptor-like protein kinase At5g39000

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g38990`	可能的受体样蛋白激酶At5g38990。	暂无已核实直接文献
`At5g39000`	推测的受体样蛋白激酶At5g39000。	暂无已核实直接文献
`At5g18500`	可能的受体样蛋白激酶At5g18500。	暂无已核实直接文献
`At3g07070`	可能参与植物防御信号传导。	暂无已核实直接文献
`At3g20530`	可能参与植物防御信号传导。	暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029287 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0009723 response to ethylene 生物过程

GO:0009738 abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009741 response to brassinosteroid 生物过程

GO:0009742 brassinosteroid mediated signaling pathway 生物过程

GO:0009788 negative regulation of abscisic acid-activated signaling pathway 生物过程

GO:0009791 post-embryonic development 生物过程

GO:0009826 unidimensional cell growth 生物过程

GO:0009873 ethylene-activated signaling pathway 生物过程

GO:0010038 response to metal ion 生物过程

GO:0010118 stomatal movement 生物过程

GO:0010183 pollen tube guidance 生物过程

GO:0010483 pollen tube reception 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT3G46290

ath:AT3G51550

ath:AT5G38990

ath:AT5G39000

ath:AT5G59700

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.573

排名 1 · TkA07G297130 · TK1151

细胞核0.315

排名 2 · TkA07G297130 · TK1151

细胞膜0.246

排名 3 · TkA07G297130 · TK1151

内质网0.063

排名 4 · TkA07G297130 · TK1151

溶酶体／液泡0.051

排名 5 · TkA07G297130 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF00069Pkinase27-295 aa

PF07714PK_Tyr_Ser-Thr28-297 aa

PF03109ABC196-174 aa

PF01636APH132-177 aa

PF03109ABC1292-350 aa

PF14299PP2403-500 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G297130	`PF00069`	Pkinase	27	295	2.4e-40	139.3
TkA07G297130	`PF07714`	PK_Tyr_Ser-Thr	28	297	1.9e-41	142.8
TkA07G297130	`PF03109`	ABC1	96	174	0.17	11.7
TkA07G297130	`PF01636`	APH	132	177	0.0092	16.5
TkA07G297130	`PF03109`	ABC1	292	350	0.17	11.7
TkA07G297130	`PF14299`	PP2	403	500	0.0001	23.0

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FID9`	拟南芥	sp\|Q9FID9\|Y5389_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g38990	41.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9FID8`	拟南芥	sp\|Q9FID8\|Y5900_ARATH Putative receptor-like protein kinase At5g39000	41.400%	Swiss-Prot	中等置信
`Q8LEB6`	拟南芥	sp\|Q8LEB6\|Y5185_ARATH Probable receptor-like protein kinase At5g18500	39.700%	Swiss-Prot	中等置信
`Q9SFT7`	拟南芥	sp\|Q9SFT7\|PBL26_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL26	43.000%	Swiss-Prot	中等置信
`F4JEQ2`	拟南芥	sp\|F4JEQ2\|PBL23_ARATH Probable serine/threonine-protein kinase PBL23	41.800%	Swiss-Prot	中等置信

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