RubberDandelionOmics 橡胶草多组学网站
更多
转录组数据查询 注释 橡胶合成 转录因子预测 靶基因 蛋白关联网络 重测序 工具 下载
ZH EN

本页使用教程

基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID，查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度，最大 10000 bp
示例 TkA01G624900 LXL04_000258

基因概览

TkA07G290210
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 72809660-72810577 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

下载 cDNA FASTA

675 bp · TkA07G290210|TK1151|cDNA

ATGACTATCTGGTGGACTTCGAGTAAAATTGTCCCTCAACGCCAAGCTCTCTTTAGCTATAACGATGGGGAAGAAAAGCGTTACTATAAGCTCACTTGCCATCGTAAACATAAAGACGCCATCACCAATGTTTACGTCCCCCATGTGCTTGATGAAGGAGACGCCATTGCCAAGAAAACCAGACAGCAAAAGCTCTACACCAATGGCAGGAAGACGTCTTGGAGCCACATCTTATTCGAGCACCCTTCTACGTTTGAGAC...

CDS

下载 CDS FASTA

675 bp · TkA07G290210|TK1151|CDS

ATGACTATCTGGTGGACTTCGAGTAAAATTGTCCCTCAACGCCAAGCTCTCTTTAGCTATAACGATGGGGAAGAAAAGCGTTACTATAAGCTCACTTGCCATCGTAAACATAAAGACGCCATCACCAATGTTTACGTCCCCCATGTGCTTGATGAAGGAGACGCCATTGCCAAGAAAACCAGACAGCAAAAGCTCTACACCAATGGCAGGAAGACGTCTTGGAGCCACATCTTATTCGAGCACCCTTCTACGTTTGAGAC...

蛋白

下载 蛋白 FASTA

224 aa · TkA07G290210|TK1151|PROTEIN

MTIWWTSSKIVPQRQALFSYNDGEEKRYYKLTCHRKHKDAITNVYVPHVLDEGDAIAKKTRQQKLYTNGRKTSWSHILFEHPSTFETLAMHPDKKKDIMNDLMTFIESKDSYKKVGKAWKRGYLLYGPPGTGKSSMIASISNLLNYHIYDLELTSVKDNTDLRKLLIGTSSKSIIVIEDIDCSIDLTGQRKKKKRENNEEEENPVQKKEKDKKKKGKEMTLSGY

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G290210
TK1151 IDTkA07G290210
OH-1004 IDLXL04_029236
关系 / 置信度序列支持，注释或模型存在差异 / 待复核
蛋白一致性 (%)96.000
蛋白覆盖度 (%)TK1151 99.554 / OH-1004 45.510
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
查看完整 ID 对照表
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G290210
位置Chr07:72809660-72810577 (+)
描述Similar to AATP1: AAA-ATPase ASD, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At5g40010 在种子成熟过程中调节形态和解剖结构所必需。 暂无已核实直接文献
At3g28580 AAA-ATP酶 At3g28580。 暂无已核实直接文献
At3g28510 AAA-ATP酶 At3g28510。 暂无已核实直接文献
At3g28610 AAA-ATP酶 At3g28610。 暂无已核实直接文献
At5g40000 AAA-ATP酶 At5g40000。 暂无已核实直接文献

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029236 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）
GO:0000304 response to singlet oxygen 生物过程
GO:0006950 response to stress 生物过程
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0009414 response to water deprivation 生物过程
GO:0009651 response to salt stress 生物过程
GO:0009737 response to abscisic acid 生物过程
GO:0010154 fruit development 生物过程
GO:0010431 seed maturation 生物过程
GO:0005634 nucleus 细胞组分
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005783 endoplasmic reticulum 细胞组分
GO:0005886 plasma membrane 细胞组分
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G28510
ath:AT3G28580
ath:AT3G28600
ath:AT3G28610
ath:AT5G40010
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。
打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量
数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞质0.472
排名 1 · TkA07G290210 · TK1151
细胞核0.435
排名 2 · TkA07G290210 · TK1151
细胞膜0.104
排名 3 · TkA07G290210 · TK1151
内质网0.087
排名 4 · TkA07G290210 · TK1151
线粒体0.063
排名 5 · TkA07G290210 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13476AAA_2321-96 aa
PF00910RNA_helicase23-46 aa
PF13555AAA_2939-48 aa
PF00910RNA_helicase61-106 aa
PF00004AAA72-72 aa
PF13401AAA_2273-112 aa
PF03215Rad1781-149 aa
PF05673DUF81584-180 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G290210PF13476AAA_2321960.008517.5
TkA07G290210PF00910RNA_helicase23460.002818.9
TkA07G290210PF13555AAA_2939480.005517.2
TkA07G290210PF00910RNA_helicase611060.002818.9
TkA07G290210PF00004AAA72721.4e-1042.4
TkA07G290210PF13401AAA_22731120.002418.9
TkA07G290210PF03215Rad17811490.002618.4
TkA07G290210PF05673DUF815841800.001618.4
TkA07G290210PF00519PPV_E1_C1021480.112.5
TkA07G290210PF29336ATG331112150.03215.0
TkA07G290210PF08298AAA_PrkA1161590.03913.7
TkA07G290210PF01078Mg_chelatase1201450.05913.5
TkA07G290210PF13191AAA_161211470.00219.4
TkA07G290210PF13555AAA_291211440.005517.2
TkA07G290210PF12775AAA_71211650.01215.9
TkA07G290210PF05496RuvB_N1221800.0003920.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q9FLD5拟南芥sp|Q9FLD5|ASD_ARATH AAA-ATPase ASD, mitochondrial58.400%Swiss-Prot高置信
Q9LJJ7拟南芥sp|Q9LJJ7|AATP9_ARATH AAA-ATPase At3g2858058.500%Swiss-Prot高置信
Q9LH84拟南芥sp|Q9LH84|AATP5_ARATH AAA-ATPase At3g2851056.600%Swiss-Prot高置信
Q9LJJ5拟南芥sp|Q9LJJ5|AATPB_ARATH AAA-ATPase At3g2861062.400%Swiss-Prot高置信
F4KFX5拟南芥sp|F4KFX5|AATPJ_ARATH AAA-ATPase At5g4000055.400%Swiss-Prot高置信

JBrowse

在基因组浏览器中查看