TkA07G278910 | RubberDandelionOmics

基因概览

TkA07G278910

当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 69743551-69744984 链方向: - 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

cDNA

1364 bp · TkA07G278910|TK1151|cDNA

TTATAGTGGGAGACCAATAAATTGACACACGTATCCAAAATCCGACATATCCATCCATCTCCTTTGGAAAAGAAGTCTGCAAAATCTAGGGTTTGTGTTGCATCTTAATTCGATCTCGTTTTTCCTAAATTACTTAAATTTCCCACATGAAACCGCCAAACTCATTTCAAATCGTAGTGGGATTTCTCTGAACCTCTATATCTAGAGTTTGTATTCGATTGAAAAACATCAATCAAATTTATTCTGGCATCTGTTATTCT...

CDS

下载 CDS FASTA

531 bp · TkA07G278910|TK1151|CDS

ATGGCCGAAGAATACTTCTTGGTTCCTAATCGCCATCGGAGGCGCATCAGGCGCTCACTCAGCTCTGGCAACGATAGGGACGACAGAGGCTGGACTATGCTTCATGTTGGTGCTCGAAAAGGGGATCTTAATGAGGTGAAAAGGCTTCTGGATGAAGGAATGGATGCCAACGTGGCAGCACTAGGCCCCAAATCGCATGGGGTCACCCCTCTCCATCTTGCTGCTAAAGGTGGCCATGTAAAGGTTATGGATGAGCTCCT...

蛋白

下载蛋白 FASTA

176 aa · TkA07G278910|TK1151|PROTEIN

MAEEYFLVPNRHRRRIRRSLSSGNDRDDRGWTMLHVGARKGDLNEVKRLLDEGMDANVAALGPKSHGVTPLHLAAKGGHVKVMDELLERGANIDARTKGACGWTPLHTAAKEKNRKAITFLIENGAFLPDNMEDTRFNPPVHYCHGLEWAYDEMKRFQQESGSSSGEGDGSYSSES

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补，使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

多版本 ID 对照

输入 ID	`TkA07G278910`
TK1151 ID	TkA07G278910
OH-1004 ID	LXL04_029139
关系 / 置信度	跨参考版本对应关系 / Strict
蛋白一致性 (%)	100.000
蛋白覆盖度 (%)	TK1151 100.000 / OH-1004 100.000 覆盖度与证据说明覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。
版本	TK1151 / GWHBCHF00000000

查看完整 ID 对照表

SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 ID TkA07G278910

位置 Chr07:69743551-69744984 (-)

描述 Similar to PIA1: Phytochrome-interacting ankyrin-repeat protein 1

拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID	可能功能	对应论文 / DOI
`At5g07840`	光敏色素相互作用的ankyrin重复蛋白1。	暂无已核实直接文献
`At5g61230`	通过与 PHYA 相互作用促进花青素积累，特别是响应远红光、高光和蔗糖处理，可能是通过触发 A3G2XYLT/UF3GT 表达。	ANK6, a mitochondrial ankyrin repeat protein, is required for male-female gamete recognition in Arabidopsis thaliana.2010 · DOI: 10.1073/pnas.1015911107 An ankyrin repeat protein is involved in anthocyanin biosynthesis in Arabidopsis.2011 · DOI: 10.1111/j.1399-3054.2011.01468.x Phytochrome-interacting ankyrin repeat protein 2 modulates phytochrome A-mediated PIF3 phosphorylation in light signal transduction.2016 · DOI: 10.1093/jb/mvw031

水稻

当前来源表未检出该物种的同源命中。

功能注释来源

查看注释来源

功能注释来源：OH1004 · LXL04_029139 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释；下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释（OH1004 来源）

GO:0001933 negative regulation of protein phosphorylation 生物过程

GO:0006887 exocytosis 生物过程

GO:0006888 endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport 生物过程

GO:0007010 cytoskeleton organization 生物过程

GO:0007165 signal transduction 生物过程

GO:0009553 embryo sac development 生物过程

GO:0009567 double fertilization forming a zygote and endosperm 生物过程

GO:0009644 response to high light intensity 生物过程

GO:0009744 response to sucrose 生物过程

GO:0010218 response to far red light 生物过程

GO:0031542 positive regulation of anthocyanin biosynthetic process 生物过程

GO:0045199 maintenance of epithelial cell apical/basal polarity 生物过程

KEGG 基因交叉引用

ath:AT5G07840

ath:AT5G61230

hsa:286

以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号，不代表本基因已获得通路功能验证。

打开注释模块

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

查看该基因的表达量

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究；参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时，不自动选择表达记录；缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释，不能替代定位实验。

细胞核0.575

排名 1 · TkA07G278910 · TK1151

细胞质0.449

排名 2 · TkA07G278910 · TK1151

细胞膜0.064

排名 3 · TkA07G278910 · TK1151

线粒体0.048

排名 4 · TkA07G278910 · TK1151

内质网0.045

排名 5 · TkA07G278910 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测，非定位实验结果

进入亚细胞定位查询

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER；位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF13637Ank_418-49 aa

PF12796Ank_222-96 aa

PF24521Ank_KRIT122-129 aa

PF13857Ank_524-58 aa

PF00023Ank30-59 aa

PF13606Ank_330-57 aa

PF13637Ank_434-82 aa

PF00023Ank66-98 aa

基因 ID	结构域编号	结构域名称	起始 aa	终止 aa	E 值	评分
TkA07G278910	`PF13637`	Ank_4	18	49	1.7e-20	73.3
TkA07G278910	`PF12796`	Ank_2	22	96	1.9e-31	109.2
TkA07G278910	`PF24521`	Ank_KRIT1	22	129	4.9e-07	30.3
TkA07G278910	`PF13857`	Ank_5	24	58	3.2e-15	56.8
TkA07G278910	`PF00023`	Ank	30	59	1.7e-22	78.9
TkA07G278910	`PF13606`	Ank_3	30	57	1.1e-18	65.9
TkA07G278910	`PF13637`	Ank_4	34	82	1.7e-20	73.3
TkA07G278910	`PF00023`	Ank	66	98	1.7e-22	78.9
TkA07G278910	`PF13606`	Ank_3	66	95	1.1e-18	65.9
TkA07G278910	`PF13857`	Ank_5	66	109	3.2e-15	56.8
TkA07G278910	`PF12796`	Ank_2	67	127	1.9e-31	109.2
TkA07G278910	`PF13637`	Ank_4	71	122	1.7e-20	73.3
TkA07G278910	`PF13857`	Ank_5	86	125	3.2e-15	56.8
TkA07G278910	`PF12796`	Ank_2	98	127	1.9e-31	109.2
TkA07G278910	`PF00023`	Ank	101	126	1.7e-22	78.9
TkA07G278910	`PF13606`	Ank_3	101	126	1.1e-18	65.9

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻；Swiss-Prot 为人工审校条目，TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白	物种	描述	一致性	数据库	置信等级
`Q9FF09`	拟南芥	sp\|Q9FF09\|PIA1_ARATH Phytochrome-interacting ankyrin-repeat protein 1	53.000%	Swiss-Prot	高置信
`Q9FNP4`	拟南芥	sp\|Q9FNP4\|PIA2_ARATH Phytochrome-interacting ankyrin-repeat protein 2	41.400%	Swiss-Prot	中等置信

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