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基因详情

输入 TK1151 或 OH-1004 基因 ID,查看对应参考版本的序列、功能注释与分析结果。
上下游长度,最大 10000 bp

基因概览

TkA07G264100
当前版本: TK1151 染色体: Chr07 坐标: 66008094-66013929 链方向: + 类型: protein_coding

cDNA / CDS / 蛋白序列

可用序列下载 CDS FASTA 蛋白 FASTA cDNA FASTA

1255 bp · TkA07G264100|TK1151|cDNA

GTCACAACAAAATCATTACTTCTCATTATAATATCTTTTTTTCTAGATTTCAAAATGAACGGTAATAGTGTGGTCTTGGGAAAAAGGGTGTCTCACTTGCTATTAAAGCAGTTGGAAACCCGTTTGTTTTTCACGGGTTTTACCCATTCCACCATCCGTGAATCCTCCAAAATTCCTAGGGATACTAGTATCGAAACAAGTACGGTTTCTATAATGCATGCTCGTAAATGGAGCACGTTTACTTCTACAAATTCAAACAT...

993 bp · TkA07G264100|TK1151|CDS

ATGAACGGTAATAGTGTGGTCTTGGGAAAAAGGGTGTCTCACTTGCTATTAAAGCAGTTGGAAACCCGTTTGTTTTTCACGGGTTTTACCCATTCCACCATCCGTGAATCCTCCAAAATTCCTAGGGATACTAGTATCGAAACAAGTACGGTTTCTATAATGCATGCTCGTAAATGGAGCACGTTTACTTCTACAAATTCAAACATCGATAAAAAAGAGGAAAACAATCAAAAAGCCATCTCAAGCTATTGGGGTGTAAC...

330 aa · TkA07G264100|TK1151|PROTEIN

MNGNSVVLGKRVSHLLLKQLETRLFFTGFTHSTIRESSKIPRDTSIETSTVSIMHARKWSTFTSTNSNIDKKEENNQKAISSYWGVTPPSLTKADGSAWKWNSFRPWEAYVADTSIDVTKHHKPVTWNDKIAFWIVQALKYPTYFYFQKKHIHHAVLLETVAAVPGMVGGMLLHTKSLRRFEQSGGWIKALLEEAENERMHLMTFIDVYEPKWHERLLVFAVQGVFFNAYFLAYLASPKLAHRITGYLEEEAVNSYTEFL...

上下游序列下载

序列方向与下载说明

上游/下游最大各 10000 bp。负链基因会自动反向互补,使最终 FASTA 为转录方向 5′→3′。

仅下载基因 CDS 下载蛋白序列

多版本 ID 对照

输入 IDTkA07G264100
TK1151 IDTkA07G264100
OH-1004 IDLXL04_029036
关系 / 置信度跨参考版本对应关系 / 复杂对应关系
蛋白一致性 (%)71.100
蛋白覆盖度 (%)TK1151 76.667 / OH-1004 73.761
覆盖度与证据说明

覆盖度为最高分比对片段的序列跨度占代表蛋白长度的比例。同源匹配不等同于功能验证。

版本TK1151 / GWHBCHF00000000
SNP / Indel 变异与样本携带情况CRA009020 · TK1151

展开后加载该基因的变异记录。

基因基本信息与功能注释

基因 IDTkA07G264100
位置Chr07:66008094-66013929 (+)
描述Similar to AOX1: Ubiquinol oxidase 1, mitochondrial
拟南芥 / 水稻参考基因与文献

下载当前基因文献

拟南芥

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
At1g32350 催化泛醇的抗氰化物氧化和分子氧还原成水,但不转移质子,因此与氧化磷酸化无关。 暂无已核实直接文献
At3g22370 催化泛醇的抗氰化物氧化和分子氧还原成水,但不转移质子,因此与氧化磷酸化无关。

水稻

参考基因 ID可能功能对应论文 / DOI
Os04g0600300 催化泛醇的抗氰化物氧化和分子氧还原成水,但不转移质子,因此与氧化磷酸化无关。 暂无已核实直接文献
功能注释来源
查看注释来源

功能注释来源:OH1004 · LXL04_029036 · GCA_047496595.1_OSU_TarKok_2.0。此处为经 ID 对照查得的 OH1004 注释;下方拟南芥/水稻同源表使用当前查询参考的独立蛋白比对。

GO 注释(OH1004 来源)
GO:0009409 response to cold 生物过程
GO:0010230 alternative respiration 生物过程
GO:0022904 respiratory electron transport chain 生物过程
GO:0031930 mitochondria-nucleus signaling pathway 生物过程
GO:0045333 cellular respiration 生物过程
GO:0005739 mitochondrion 细胞组分
GO:0005743 mitochondrial inner membrane 细胞组分
GO:0009507 chloroplast 细胞组分
GO:0009916 alternative oxidase activity 分子功能
GO:0046872 metal ion binding 分子功能
GO:0102721 ubiquinol:oxygen oxidoreductase activity 分子功能
GO:0106292 superoxide-generating NADPH oxidase activity 分子功能
KEGG 基因交叉引用
ath:AT3G22360
ath:AT3G22370
gmx:547924
nta:107781761
以下为同源蛋白关联的 KEGG 基因编号,不代表本基因已获得通路功能验证。

基因表达

查看该基因在不同研究、组织与处理条件下的表达量。表达结果按研究与计量单位分别展示。

数据来源与对应关系说明

表达数据来自公开转录组研究;参考版本、样本信息和表达单位见查询结果。跨参考版本的对应关系不唯一时,不自动选择表达记录;缺失值不视为表达量为零。

亚细胞定位 Top 5

以下为计算预测或同源注释,不能替代定位实验。

线粒体0.944
排名 1 · TkA07G264100 · TK1151
细胞质0.052
排名 2 · TkA07G264100 · TK1151
细胞核0.048
排名 3 · TkA07G264100 · TK1151
细胞膜0.034
排名 4 · TkA07G264100 · TK1151
内质网0.019
排名 5 · TkA07G264100 · TK1151

LocPro · 直接预测 · 计算预测,非定位实验结果

预测功能结构域

结构域结果来自 Pfam-A/HMMER;位置为对应蛋白序列上的氨基酸坐标。

PF01786AOX119-311 aa
PF06479Ribonuc_2-5A126-144 aa
PF03232COQ7190-308 aa
PF06479Ribonuc_2-5A258-310 aa
基因 ID结构域编号结构域名称起始 aa终止 aaE 值评分
TkA07G264100PF01786AOX1193117.7e-77258.5
TkA07G264100PF06479Ribonuc_2-5A1261440.1812.7
TkA07G264100PF03232COQ71903080.0007419.9
TkA07G264100PF06479Ribonuc_2-5A2583100.1812.7

拟南芥 / 水稻蛋白同源

仅展示拟南芥和水稻;Swiss-Prot 为人工审校条目,TrEMBL 为补充序列候选。同源相似性不等同于实验验证。

下载当前结果

蛋白物种描述一致性数据库置信等级
Q8LEE7拟南芥sp|Q8LEE7|AOX3_ARATH Ubiquinol oxidase 3, mitochondrial75.100%Swiss-Prot高置信
Q39219拟南芥sp|Q39219|AOX1A_ARATH Ubiquinol oxidase 1a, mitochondrial70.800%Swiss-Prot高置信
O82766水稻sp|O82766|AOX1B_ORYSJ Ubiquinol oxidase 1b, mitochondrial70.600%Swiss-Prot高置信

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